來自4個不同腺泡性LUAD患者的PDX模型被給予XC-系統抑制劑erastin(PKE)和多激酶抑制劑索拉非尼(sorafenib)。與DMSO***的對照組相比,PKE和sorafenib給藥時觀察到***的**消退(圖7G-J)。此外,PKE和sorafenib給藥小鼠也導致**中MDA和4-HNE的***增加(圖7K和L),提示誘導的脂質過氧化可能是抑制腺泡LUADs**發生的結果。圖7M顯示,與*旁組織相比,**組織中MDA和YTHDC2表達量都降低,而SLC7A11mRNA和蛋白水平都升高,證明在LUAD中抑制YTHDC2可通過SLC7A11表達上調阻止脂質過氧化。同樣地,MDA和YTHDC2與**期數呈負相關,而SLC7A11與分期呈正相關(圖7N),說明SLC7A11的升高可能是抑制YTHDC2促進LUAD進展的關鍵。
結論:本研究強調了m6A閱讀器YTHDC2在LUAD中的重要性。XC?系統活性可能通過抑制YTHDC2來誘導促進**發生。此外,基于YTHDC2表達的分子模型可能有助于預測LUAD的預后。抑制劑靶向XC?系統可能有助于***預后不良的LUAD患者。因此,本研究對LUAD的**發生、分子分型和藥物敏感性提供了有價值的見解。 為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機制。代謝組學科研售后服務
5、外泌體miR-934通過下調PTEN表達和***PI3K/AKT信號通路誘導巨噬細胞M2極化
進一步探索**來源的外泌體miR-934誘導M2巨噬細胞極化的機制。miR-934序列與PTEN的3'-UTR序列存在比對,提示miR-934可能靶向PTEN誘導M2巨噬細胞極化(Fig.5a)。如Fig.5b所示,將miR-934mimics或anti-miR-934及其控制載體轉染到PMA處理的THP-1細胞中,發現分別轉染miR-934mimics或anti-miR-934和PTEN野生型結合位點組中PTEN的3’-UTR熒光素酶活性***降低或升高(Fig.5b)。有趣的是,當細胞與轉染了anti-miR-934、miR-934mimics或其對照載體的HCT-8或HT29細胞的外泌體共培養時,熒光素酶活性模式顯示出與上述趨勢相同(Fig.5c)。此外,PMA處理的THP-1細胞轉染miR-934mimics或anti-miR-934,與各自的對照細胞相比,分別在mRNA和蛋白水平下調或上調了PTEN的表達(Fig.5d)。類似的,分別用轉染anti-miR-934或miR-934mimics的CRC細胞的外泌體孵育PMA處理的THP-1細胞,結果發現PTEN,PI3K/AKT的表達明顯高于或低于各自的對照組(Fig.5e,f)。這些表明在PMA處理的THP-1細胞中,外泌體來源的miR-934可以通過靶向其3'-UTR和***PI3K/AKT通路來下調PTEN的表達。 貴州科研技術指導2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法。
四、HSCT前通過腸道微生物組成預測急性GvHD 嚴重性
基于機器學習,hsct前腸道微生物群組成預測aGvHD嚴重程度。A.在0級aGvHD患者中,12個**豐富的家族隨著時間的推移在腸道中的相對豐度。B.svmLinear模型識別出的前20個預測腸道ASV的重要性圖,其重要性得分表明,如果將各自的ASV排除在模型之外,預測精度會平均下降。**終的交叉驗證svmLinear模型從腸ASVspreHSCT的豐度中預測了aGvHD(0IvsIIIV),準確率為86%(95%CI:65-97%)。通過Boruta特征選擇確認的asv用星號表示。
大約 1% 的人類基因組能夠折疊成 G 四鏈體 (G quadruplexes,G4s)——在富含 G 的基序上形成的非經典鏈特異性 DNA 結構。G4 的熱穩定性不同,這可能會影響它們的功能。然而,G4s 也可能阻礙復制、轉錄和翻譯,并可能增加基因組的不穩定性和突變率。因此,根據其基因組位置、熱穩定性和功能性,G4 基因座可能會在不同的選擇壓力下進化,而這一點從未被研究過。
一、基因組中G4基因座的密度不均勻
與全基因組平均值相比,CpG島、上游區域和轉錄鏈的G4密度的倍數差異特別**別為12.3、4.98和4.11。相比之下,內含子的非轉錄和轉錄鏈、非轉錄外顯子鏈和3'UTR的非轉錄鏈具有G4密度接近全基因組平均值;校正G含量總體趨勢不變,復制起點和增強子具有特別高的G4密度:分別比全基因組平均值高6.88倍和3.03倍。 大黃酸處理改變腸道菌群組成。
piRNA-30473通過調控WTAP的表達介導m6A的甲基化
為了進一步探討piRNA-30473在DLBCL中轉錄組調控中的作用,我們在轉染antiagomir-30473后48h檢測m6A整體甲基化水平。結果顯示,轉染antiagomir-30473的細胞總體m6A水平降低(圖3A,3B)。METTL3,METTL14,WTAP,FTO和ALKBH5是關鍵的m6A甲基轉移酶或去甲基化酶,它們的失調可能導致DLBCL中m6A修飾譜異常。結果發現,抑制piRNA-30473降低了WTAP的表達(圖3C,3D),而其他蛋白表達無明顯差異。同時,免疫共沉淀表明,antiagomir-30473處理降低了WTAP與METTTL3和METTTL14的相關性(圖3E)。接下來為了證明piRNA-30473在WTAPmRNA中是否存在結合位點,作者先使用miRNA特異性靶檢測算法確定假定的結合位點(圖3F),后續實驗結果證明,piRNA-30473通過與WTAP的3’-UTR結合,降低了WTAPmRNA的衰減,進而增強了mRNA的穩定性(圖3G,3H)。 英拜可解放您的雙手釋放您的時間。代謝科研推薦咨詢
文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(MLN)中的Th17細胞(與結腸炎癥密切相關)。代謝組學科研售后服務
4、白樺素能改善小鼠血液、肝臟和脂肪組織中的脂質參數
測量了血液和其他組織中的脂質水平,如圖5所示。洛伐他汀和白樺素處理的小鼠的血清總膽固醇(TC)和甘油三酸酯(TG)的水平顯著低于對照***的小鼠(圖5A和5B)。值得注意的是,與洛伐他汀相似,白樺素降低了LDL膽固醇(LDL-c)的含量并增加了HDL膽固醇(HDL-c)(圖5C和5D)。有趣的是,盡管白樺素和洛伐他汀均降低了肝臟的TC水平,但只有白樺素顯著降低了肝臟的TG含量(圖5E和5F)。組織學分析表明,白樺素可以減少白色脂肪細胞組織(WAT)和棕色脂肪細胞組織(BAT)的細胞大小,而洛伐他汀*可以減少棕色脂肪細胞的大小(圖5G)。油紅色O切片染色表明,與用WD喂養的對照***小鼠的肝臟相比,洛伐他汀或白樺素處理的小鼠的肝臟具有較低的脂質蓄積(圖5G)。這與洛伐他汀和白樺素降低肝脂質含量的先前數據一致(圖5E和5F)。 代謝組學科研售后服務
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗