此外,核輸出基因Emb (Exportin)的mRNA水平在tbi后***增加(圖1M),而與對照組相比,微管相關(guān)蛋白Futsch的mRNA水平?jīng)]有變化(圖1圖Supplement 1H),這與蛋白質(zhì)組學(xué)分析一致。Western blotting進(jìn)一步證實(shí)了tbi依賴性的果蠅幼蟲腦內(nèi)Nup214蛋白水平的升高(圖1N和O)。Western blot分析了損傷后幼蟲(0、2、4和6小時(shí))和成蟲(0、2、4、24和72小時(shí))的時(shí)間過程,以評估Nup214蛋白的水平。在檢測的時(shí)間點(diǎn)上,不管是幼蟲還是成人的大腦中,Nup214蛋白的水平都是上調(diào)的(圖1P,Q,R,S),這表明創(chuàng)傷可能會破壞Nup214的水平和體內(nèi)的轉(zhuǎn)換。英拜注重客戶的隱私。河南科研技術(shù)指導(dǎo)
并同年在同期刊中發(fā)表,遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態(tài)發(fā)生,Tspan4a和Tspan7(遷移體生成相關(guān)基因)突變體斑馬魚的***形態(tài)發(fā)生受損,并闡明遷移體誘導(dǎo)胚胎細(xì)胞至正確的位置,從而影響***形態(tài)發(fā)生[5]。2019年俞立團(tuán)隊(duì)還發(fā)表了關(guān)于遷移體標(biāo)志物的文章[6],該文章闡明了人血清中存在遷移體;與外泌體相比,遷移體中存在四種特異性蛋白:NDST1、EOGT、PIGK和CPQ。
2021年5月,俞立團(tuán)隊(duì)在Cell期刊(IF=38.637)上發(fā)表文章,文章主要講述在外界刺激下,細(xì)胞中受損的線粒體外排至遷移體中[7]。同年6月,俞立團(tuán)隊(duì)利用斷層成像技術(shù)研究不同物種的大規(guī)模細(xì)胞遷移和神經(jīng)活動,并觀察了哺乳動物在中性粒細(xì)胞遷移和**細(xì)胞循環(huán)過程中的各種亞細(xì)胞動力學(xué)[8],該研究成果亦發(fā)表于Cell期刊中。 泌尿科研動物模型構(gòu)建英拜可解放您的雙手釋放您的時(shí)間。
4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取
Xc-系統(tǒng)是一個(gè)胱氨酸/谷氨酸逆向轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白,捕獲細(xì)胞外的胱氨酸,用于谷胱甘肽的合成,以交換谷氨酸的釋放。在圖3中,被抑制的Xc-系統(tǒng)功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關(guān),然而YTHDC2如何調(diào)節(jié)Xc-系統(tǒng)依然未知。文獻(xiàn)報(bào)道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統(tǒng)活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發(fā)現(xiàn),SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負(fù)調(diào)控(圖4A、B)。在小鼠中,與KPE和KPYΔYTH小鼠相比,KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達(dá)下調(diào)(圖4C、D)。這證明YTH結(jié)構(gòu)域是YTHDC2抑制SLC7A11表達(dá)的前提。
YTHDC2抑制胱氨酸攝取和下游抗氧化程序
通常在具有高致瘤特性的**中觀察到代謝活性。為了研究YTHDC2對代謝物的影響,進(jìn)行了代謝組學(xué)分析,比較了具有低和高YTHDC2表達(dá)(的LUAD標(biāo)本。GSH代謝是確定的前20條KEGG途徑之一。在顯著改變的代謝物中,與YTHDC2高**相比,在YTHDC2低**中觀察到胱氨酸增加了3.975倍。此外,觀察到Y(jié)THDC2與細(xì)胞內(nèi)胱氨酸之間呈負(fù)相關(guān)。這些數(shù)據(jù)表明YTHDC2減少細(xì)胞內(nèi)胱氨酸。為了驗(yàn)證YTHDC2是否降低了胱氨酸攝取,我們培養(yǎng)了具有高(pHY#1-8)或低(pLY#1-8)YTHDC2表達(dá)水平的原代患者來源的LUAD細(xì)胞。L-14C-胱氨酸攝取測定結(jié)果表明,YTHDC2通過其YTH結(jié)構(gòu)域抑制了H1299和H1975細(xì)胞產(chǎn)生的異種移植物、小鼠形成的LUAD和患者來源的LUAD細(xì)胞中的胱氨酸攝取。已顯示CHAC1mRNA水平的上調(diào)表明胱氨酸攝取受損。事實(shí)上,觀察到Y(jié)THDC2增加了CHAC1mRNA水平。 N6甲基腺苷(m6A)是一種常見的真核細(xì)胞mRNA修飾。
前,PROTAC-DB包括1662個(gè)PROTAC,202個(gè)彈頭(靶向目標(biāo)蛋白質(zhì)的小分子),65個(gè)E3配體(能夠募集E3連接酶的小分子)和806個(gè)接頭,以及它們的化學(xué)結(jié)構(gòu),生物學(xué)活性和理化性質(zhì)。除了彈頭和E3配體的生物活性外,PROTAC-DB還提供PROTAC的降解能力,結(jié)合親和力和細(xì)胞活性。
數(shù)據(jù)庫的查詢和瀏覽為了方便對PROTAC-DB中的數(shù)據(jù)進(jìn)行檢索,作者提供了檢索和瀏覽工具。在檢索工具上,PROTAC-DB可以進(jìn)行基于文本的檢索和基于結(jié)構(gòu)的檢索。基于文本的搜索是在整個(gè)PROTAC-DB中進(jìn)行搜索的一種簡單方式,只需輸入單個(gè)術(shù)語,如目標(biāo)名稱、化合物名稱或ID。對于基于結(jié)構(gòu)的搜索,用戶可以在ChemDoodle編輯器中輸入SMILES字符串、上傳MO***F文件或繪制分子草圖。導(dǎo)入自編輯的分子后,可以從三個(gè)搜索選項(xiàng)(similarity、substructure或exact)中選擇一個(gè)。在相似性搜索中,利用類FCFP指紋中的位向量Morgan指紋來計(jì)算兩個(gè)分子之間的Tanimoto相似度。可以選擇數(shù)據(jù)集(PROTAC、彈頭、E3配體或Linker)進(jìn)行搜索。 結(jié)腸炎也會導(dǎo)致促炎細(xì)胞因子或趨化因子的增加。生物相關(guān)科研實(shí)驗(yàn)外包
大黃酸導(dǎo)致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。河南科研技術(shù)指導(dǎo)
6)NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷通過抑制人類星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程而誘導(dǎo)氧化應(yīng)激
我們研究了NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷是否可以通過抑制人體星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程來誘導(dǎo)氧化應(yīng)激。與對照組相比,NOX4的升高***降低了谷胱甘肽(GSH)水平和谷胱甘肽/氧化谷胱甘肽(GSSG)的比值(圖6A和B)。NOX4的升高也增加了GSSG的水平(圖6C)。由于NOX4導(dǎo)致GSH減少以及GSH/GSSG比值降低,我們接下來研究NOX4是否可以影響人類星形膠質(zhì)細(xì)胞中NRF2信號通路,這是細(xì)胞抗氧化反應(yīng)的關(guān)鍵調(diào)控因子。與對照組相比,NOX4的升高抑制了NRF2在細(xì)胞質(zhì)中的核易位(圖6D)。此外,NRF2靶基因HO-1和GCL的水平和活性在人星形膠質(zhì)細(xì)胞中被NOX4過表達(dá)***抑制(圖6E和F)。這些結(jié)果表明,NOX4誘導(dǎo)的線粒體代謝損傷通過抑制人星形膠質(zhì)細(xì)胞的細(xì)胞抗氧化過程而誘導(dǎo)氧化應(yīng)激。 河南科研技術(shù)指導(dǎo)
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4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)