外周血單個核細(xì)胞(PBMCs)梯度離心純化是研究人體免疫健康和疾病的臨床相關(guān)細(xì)胞的主要來源。像大多數(shù)其他人體組織一樣，PBMC是一種復(fù)雜的、異構(gòu)的細(xì)胞類型混合物，來源于共同的干細(xì)胞祖細(xì)胞。盡管不同的PBMC細(xì)胞類型之間的基因組大部分是不變的，但每種免疫細(xì)胞類型執(zhí)行重要的和不同的功能。理解控制細(xì)胞系規(guī)范、細(xì)胞成熟、***狀態(tài)和響應(yīng)細(xì)胞內(nèi)外信號的功能多樣性的基因組調(diào)控景觀，是理解健康和疾病中的免疫系統(tǒng)的關(guān)鍵。
**近單細(xì)胞基因組方法的改進(jìn)使復(fù)雜細(xì)胞類型混合物的調(diào)控染色質(zhì)景觀的輪廓成為可能。特別是，基于液滴的單核或單細(xì)胞轉(zhuǎn)座酶可及染色質(zhì)分析(snATAC-seq, scATAC-seq, dscATAC-seq, mtscATAC-seq)允許在單細(xì)胞分辨率下分析開放染色質(zhì)。有前景的新方法將scATAC-seq與同時測量核mRNA或與細(xì)胞表面表位結(jié)合。 上海英拜生物提供可視化實(shí)驗(yàn)過程參觀。內(nèi)分泌科研創(chuàng)新服務(wù)
由于腸道微生物群在多囊卵巢綜合征的起始和發(fā)展中起著重要作用，作者還研究DHEA和tempol是否影響腸道的氧化還原狀態(tài)。腸道MDA、3-NT和AGEs水平在PCOS大鼠中***高于對照組和氧化生物標(biāo)記的增加被tempol處理消除(圖3K-M)。此外，tempol***增加PCOS大鼠的腸道SOD1和SOD2表達(dá)(圖3N)。因此，這些結(jié)果表明tempol能夠降低PCOS大鼠的腸道氧化應(yīng)激。
4.Tempol減輕PCOS大鼠腸道微生物失調(diào)
隨后，通過rarefaction和Shannon曲線(Fig.4A-B)，以及4個α-多樣性指數(shù)(ACE)、Shannon、Simpson和Chao1來評估細(xì)菌群落的豐度和多樣性。當(dāng)序列增加到2000時多個樣本稀疏曲線往往是平坦的，這表明測序數(shù)據(jù)的數(shù)量是合理的(圖4C-F)。在多個樣本Shannon曲線也觀察到類似的結(jié)果(圖4g)，表明大多數(shù)樣本多樣性被測序覆蓋。有趣的是，rarefaction和Shannon曲線以及4個α-多樣性指數(shù)的結(jié)果在不同組間沒有差異(圖4A-F)，這表明DHEA處理或tempol干預(yù)對腸道微生物群α-多樣性沒有明顯影響。 代謝科研國家自然科學(xué)基金細(xì)菌可能是導(dǎo)致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。
qRT-PCR結(jié)果表明，暴露于miR-144模擬物處理的鼻咽*細(xì)胞的HUVECs中miR-144上調(diào)，而暴露于miR-144inhibitor處理的鼻咽*細(xì)胞的HUVECs中miR-144下調(diào)(圖3C)。Transwell實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，miR-144過表達(dá)EVs足以增強(qiáng)HUVECs的遷移和侵襲，而miR-144抑制EVs則表現(xiàn)出相反的趨勢(圖3D和3E)。此外，我們還通過傷口愈合實(shí)驗(yàn)檢測HUVECs的增殖和遷移能力(圖3F)。結(jié)果顯示，與NC模擬EV組相比，miR-144模擬EV組細(xì)胞的創(chuàng)面愈合率升高，說明C666-1-和SUNE1細(xì)胞來源的EVmiR-144均促進(jìn)HUVECs的增殖和遷移。與NC抑制EV組相比，miR-144抑制EV組的細(xì)胞創(chuàng)面愈合率降低，提示C666-1-和SUNE1EV細(xì)胞EVmiR-144抑制后，HUVECs的增殖和遷移受到抑制。
PTEN包含一個n端磷酸酶結(jié)構(gòu)域，它可以使脂質(zhì)細(xì)胞膜的一種成分——磷脂酰肌醇3,4,5-三磷酸(PI(3,4,5)P3或PIP3)去磷酸化。PTEN通過去磷酸化PIP3的D3位，拮抗磷脂酰肌苷3-激酶(PI3K)通路。PI3K通路調(diào)節(jié)多種細(xì)胞過程，包括細(xì)胞代謝、存活、增殖、凋亡、生長和遷移。這些基本的細(xì)胞過程，當(dāng)解除控制時，可以促進(jìn)或驅(qū)動惡性表型。
PTEN功能突變的體細(xì)胞丟失在多種人類**中被發(fā)現(xiàn)，包括乳腺*、子宮內(nèi)膜*、多形性膠質(zhì)母細(xì)胞瘤、皮膚*和前列腺*。PTEN缺失是乳腺*中常見的事件，與加速進(jìn)展和不良預(yù)后密切相關(guān)。特別是PTEN的表達(dá)已經(jīng)被提出在人表皮生長因子受體2(HER2)過表達(dá)乳腺*中發(fā)揮重要作用。HER2是表皮生長因子受體家族的一員，具有酪氨酸激酶活性。它的過表達(dá)，在大約15-20%的乳腺*病例中觀察到，與侵襲性臨床行為和不良預(yù)后相關(guān)。曲妥珠單抗是一種與HER2胞外結(jié)構(gòu)域具有高親和力的單克隆抗體，是一種有效的***HER2陽性乳腺*患者的方法。PTEN表達(dá)檢測的總有效率約為70%，而PTEN表達(dá)陰性患者的總有效率*為20%。 英拜的員工福利待遇很好。
在確定了UCP1與AKI中的脂質(zhì)積累負(fù)相關(guān)后，我們試圖闡明其潛在的關(guān)系。首先，我們使用UCP1特異性過表達(dá)慢病毒載體和UCP1激動劑CL316243構(gòu)建UCP1上調(diào)的細(xì)胞模型(圖3A)。如圖3B所示，UCP1過表達(dá)***降低了順鉑暴露HK2的脂質(zhì)積累。UCP1激動劑CL316243也得到了類似的結(jié)果。這些結(jié)果表明，UCP1參與了AKI中脂質(zhì)積累的調(diào)節(jié)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證這一調(diào)控關(guān)系，提高證據(jù)的可靠性，我們采用腎多點(diǎn)注射UCP1特異性過表達(dá)腺病毒的方法建立AKI過表達(dá)UCP1的動物模型(圖3C-D)。油紅O染色顯示，過表達(dá)UCP1可***緩解AKI動物模型中的脂質(zhì)積累(圖3E)。***，使用UCP1激動劑CL316243在AKI動物模型中誘導(dǎo)UCP1過表達(dá)，也觀察到了相同的結(jié)果(圖3F-H)。因此，所有證據(jù)表明，隨著UCP1表達(dá)的增加，AKI模型中的脂質(zhì)含量降低。巨噬細(xì)胞表型協(xié)調(diào)急性胰腺炎損傷后的炎癥和修復(fù)再生。湖南科研省自然科學(xué)基金
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6）FPN蛋白在肺*細(xì)胞中的穩(wěn)定性需要USP35
USP35屬于DUBs家族，在控制各種蛋白質(zhì)的Ub依賴性降解中起關(guān)鍵作用。此外，F(xiàn)PN泛素化和隨后的內(nèi)吞作用導(dǎo)致鐵超載和鐵死亡。因此，我們研究了USP35是否通過影響其蛋白質(zhì)穩(wěn)定性來調(diào)節(jié)FPN表達(dá)。如圖8A所示，USP35敲除增加，而USP35過表達(dá)降低泛素化FPN水平。用MG132蛋白酶體抑制劑***后，shUSP35***細(xì)胞的全部或膜裂解物中FPN水平的降低被阻止(圖8B)。隨后，我們檢查了USP35是否是FPN的直接結(jié)合伙伴。IP分析的數(shù)據(jù)揭示了內(nèi)源性USP35和FPN之間的聯(lián)系(圖8C)。總之，這些數(shù)據(jù)表明USP35可以直接與FPN相互作用，并作為deubiquitinase發(fā)揮作用，以保持其蛋白質(zhì)穩(wěn)定性。 內(nèi)分泌科研創(chuàng)新服務(wù)
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