吉林科研分子生物學實驗

來源: 發布時間:2021-10-19

與HuR的RRM3結合,中斷HuR-β-actinmRNA相互作用,抑制β-actin表達,抑制OPC遷移

為闡明lnc-PMIF如何與HuR相互作用調節β-actin表達和OPC遷移,首先通過生物信息學分析預測了lnc-PMIF的二級結構,并合成生物素化的全長lnc-PMIF(WT)和截短的lnc-PMIF突變體,分別為突變體A1(無5’莖環的正義)、突變體A2(有中心莖環和3’莖環的正義)和突變體A3(*有3’莖環的正義1100-1455bp),轉染MC3T3-E1細胞,并進行標記RNA鏈霉親和素下拉試驗。蛋白免疫印跡分析顯示,HuR存在于轉染WTlnc-PMIF、截短lnc-PMIF突變體A1或截短lnc-PMIF突變體A2的細胞的下拉部分中,但在轉染截短lnc-PMIF突變體A3的細胞的下拉部分中不存在。這些數據表明,lnc-PMIF的中心莖環足以實現lnc-PMIF和HuR之間的相互作用。 METTL14上調促進胰腺*生長和轉移。吉林科研分子生物學實驗

轉座酶染色質可及性單核測序(snATAC-seq)也是一種單細胞表觀遺傳組測序技術。單細胞核測序,能夠獲得組織的細胞圖譜,解決細胞異質性的問題。單細胞或細胞核RNA測序(scRNA-seq或snRNAseq)促進了對定義腎臟細胞特性的基因和途徑的更深入的理解。成熟的人類和小鼠腎臟的多個scRNAseq圖譜已經確定了轉錄如何有助于細胞類型的特異性。**近的方法已經將這種方法擴展到單細胞染色質可及性分析。單核染色質轉置可及性測序試驗(snATACseq)是ATAC-seq的擴展,該試劑盒利用Tn5轉置酶在數千個單個細胞中測量染色質可及性。推廣科研動物模型構建英拜提供生命科學內的一體化服務。

巨噬細胞在 AP 恢復不同階段的不同作用

鑒于 AP 恢復過程中巨噬細胞的表型變化,接下來試圖通過用脂質體***巨噬細胞來檢查巨噬細胞在不同修復/再生階段的作用。首先,我們在急性炎癥反應后(從第 1 天到第 2 天)立即消耗了胰腺巨噬細胞,并在第 3 天檢查了胰腺。如圖所示,第 3 天之前巨噬細胞的消耗可以在很大程度上減少導管樣結構,這表明巨噬細胞在ADM的形成。AP 損傷后第 3天巨噬細胞的消耗顯著延遲了胰腺修復。Ki67 +細胞在第3天達到峰值,并隨著胰腺恢復逐漸下降。與組織學結果一致,發現CN處理組的Ki67 +細胞從第 5 天到第 7 天大幅下降,但在 CL 處理組中沒有,表明 CL 處理小鼠的修復過程受損。

背景:超過100個不同的RNA修改特征已經在過去的幾十年里,其中,該N6-methyladenosine(m6A)修改是**豐富的形式在真核mRNA。不同的m6A讀者蛋白優先區分轉錄組范圍內的RNAm6A景觀。在細胞質中,大多數YTH(YTHDF1-3和YTHDC2)和IGF2BP(IGF2BP1-3)家族蛋白與m6a修飾的mrna結合并調節其穩定性和翻譯。此外,其他蛋白質可以結合m6a修飾的前體rna在細胞核內,并影響其加工。

m6a相關基因缺陷影響多種生物過程。例如,metttl3的缺失導致受損的胚胎干細胞退出自我更新走向分化;抑制METTL14導致明顯的胚胎生長遲緩;斑馬魚胚胎中YTHDF2的消融延遲了早期胚胎發育中的母-合子過渡。特別是,RNAm6a相關基因正在成為在各種**中促進**啟動和進展的關鍵調控因子,包括肺*中的metttl3、肝*中的metttl14、白血病中的FTO和乳腺*中的ALKBH5。然而,m6A如何調節*變以及下游通路和機制如何傳遞這些信號尚不完全清楚。 增加乳酸桿菌水平導致尿酸水平下降。

同時,circNDUFB2顯著增加了p-P65,p-IRF3,p-STAT1和p-STAT2。circNDUFB2還促進了IRF3和P65進入核內的易位。免疫熒光分析證實circNDUFB2促進了IRF3的磷酸化,并隨后觸發其轉移到細胞核中。更重要的是,RIG-1的敲除顯著消除了這些基因的蛋白質水平或磷酸化水平的上調以及由circNDUFB2誘導的A549細胞中IRF3和P65的核易位。ELISAs測量細胞培養上清液中的細胞因子水平,發現RIG-1敲低顯著消除了對CXCL10,CXCL11,CCL5和IFNβ的誘導。上述結果表明RIG-1在介導NSCLC細胞中circNDUFB2的免疫應答中起關鍵作用,而circNDUFB2引發的免疫應答不依賴于circNDUFB2中m6A的修飾。尿酸升高直接引起腸道屏障損傷。江蘇科研推薦咨詢

發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。吉林科研分子生物學實驗

比較SLE-1和SLE-2組的轉錄表達譜,結果顯示,除ISGs外,mtDNA編碼的OXPHOS基因的表達差異比較大(Fig. 1c, d)。總之,SLE患者純化T細胞的轉錄組學分析根據ISG表達水平將其分為兩組,表達高I型IFN標記的患者顯示線粒體編碼基因和線粒體相關代謝途徑的表達減少,在CD8 + T細胞中更明顯。這表明SLE中與I型IFN相關的線粒體功能失調。

2、ISGs高表達患者CD8+T細胞線粒體異常

在研究I型IFN信號與線粒體異常之間的潛在聯系之前,應用計算機模擬和體外相結合的方法,根據I型IFN信號的強弱程度對SLE患者進行分層:高水平的ISGs(IFN-high)、低水平的ISGs(IFN-low)和無ISGs(IFN-Neg)。隨后,探究IFN-high和IFN-Neg的SLE患者中T細胞的線粒體基因型,以類風濕性關節炎(RA)患者為疾病對照。結果發現,與健康組,IFN-Neg組和RA組相比,來源于IFN-high的SLE患者的CD8+T細胞表現出線粒體大小增加(圖2a,b)和線粒體膜超極化(圖2c)。在IFN-High的SLE患者中,也觀察到細胞ROS(cROS)陽性CD8+T細胞比例增加,但只是線粒體ROS(mROS)染色細胞比例有上升趨勢(圖2d)。在IFN-Neg的SLE患者中也檢測到更高比例cROS陽性細胞,這表明了一種疾病特異性效應(圖2d)。 吉林科研分子生物學實驗

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