一、在pik3a突變的ER+乳腺*中,INPP4B的表達增加
INPP4B被確定為人類乳腺*er陽性標記物.INPP4B在三陰性乳腺*中表達缺失,然而,它作為其他**中潛在的致*基因的出現,促使我們檢測其在ER+乳腺*中的相對表達和功能。INPP4B蛋白表達缺失與三陰性乳腺*相關(圖1a, b) 增加INPP4B蛋白表達在14 40%的乳腺*相對于正常組織與ER / PR-positivity和腔內(ER +和/或PR+)乳腺*亞型(圖1 a, b和補充圖1 b, c)。在mRNA表達數據不能用于這些cohorts使用組織掃描乳腺*cDNA陣列I IV (OriGene)檢測130例原發人類乳腺*和16例正常乳腺組織的INPP4B mRNA表達(圖1c)。INPP4B表達降低與三陰性乳腺*相關,而***增加的INPP4B表達在25%的乳腺*中與ER/ propositivity和luminal亞型相關(圖1c, d和補充圖1d, e)。使用METABRIC和TCGA數據集,我們發現只有1%的乳腺*表現出INPP4B基因改變,如突變、截斷、擴增或缺失。INPP4B mRNA表達與PTEN或AKT1突變無關,但與pik3a突變狀態正相關(圖1e和補充圖1f)。在PIK3CA多突變的乳腺*中,INPP4B的表達也***升高(補充圖1g)。進一步分層研究發現,INPP4B高表達與pik3c突變ER+乳腺*亞型特異性相關(圖1f)。 英拜跟客戶形成產學研合作模式。基礎醫學科研技術指導
耗盡的**內T細胞會經歷嚴重的缺氧
雖然缺氧在**中很常見,但尚不清楚**內T細胞亞群是否比其他T細胞更容易缺氧。我們首先在8-10 mm(第14天)B16黑色素瘤中沿著衰竭譜對CD8+**浸潤淋巴細胞(TILs)進行表型分析(擴展數據圖1a)。**終衰竭的T細胞被定義為高水平和持續表達PD-1和共表達Tim-3(圖1a),具有高的LAG3和Tox表達,低的TCF1表達,通過將gp100特異的Pmel-1 T細胞轉移到攜帶b16的小鼠中,一旦它們達到**終衰竭,就會重新刺激它們,從而測定抗原特異性反應(擴展數據圖1b)。與LN-resident Pmel-1 T細胞相比,gp100-restimulated T細胞的多功能性要少得多(圖1f)。在處死B16**小鼠之前,將其注入一種缺氧示蹤劑吡莫硝唑,使用抗吡莫硝唑和抗hif1 α抗體,發現與其他亞群相比,**終耗盡的T細胞缺氧程度比較高(圖1g,h)。因此,缺氧是**代謝景觀的主要代謝組成部分,與其他亞群相比,**終衰竭的T細胞會經歷更高的缺氧。 四川科研技術指導降低腸上皮細胞尿酸的產生。
circACTN4 和 FIR 與 FUBP1 競爭結合
推測circACTN4可以與FUBP1競爭性結合并阻止FIR與FUBP1結合以促進 MYC的轉錄和表達。為了進一步驗證提出的假設,qRT-PCR檢測了BC和匹配組織中FIR的表達,與正常相鄰組織相比,BC組織中FIR的表達顯著下調。Pearson相關分析表明,FIR的表達與BC組織中circACTN4、FUBP1和MYC的水平呈負相關。免疫共沉淀試驗結果表明,在過表達circACTN4的BC細胞的FUBP1-共免疫共沉淀物中未發現明顯的FIR蛋白帶,而在circACTN4被敲低后,通過蛋白質印跡在共免疫共沉淀物中明顯檢測到FIR,這表明上調的circACTN4顯著削弱FIR與 FUBP1的結合,同時下調 circACTN4 顯著加強了 FUBP1 和 FIR 之間的相互作用。ChIP分析結果表明,高濃度si-circ#2轉染后FIR和FUSE的結合水平高于低濃度si-circ#2轉染后FIR和FUSE的結合水平。
3)DRD2重新編碼MφM1表型,下調IL-6和IL-10
據報道,DRD2可調節M1的極化。結果顯示,在DRD2表達水平較高的BrCa組織中,M1Mφ的浸潤增加,M2Mφ的浸潤減少(圖3A)。為進一步研究DRD2對TAMs的調控作用,構建了BrCa與Mφ共培養體系。當Mφ與表達DRD2的BrCa細胞共培養時,qRT-PCR顯示M1表型標記增加,M2Mφ標記下調(圖3B-C)。qRT-PCR也證實了載體轉染的BrCa細胞將Mφ調節為M2型(圖3C)[12]。WB結果顯示,表達DRD2的BrCa細胞上調M1標記iNOS,下調M2標記CD206(圖3D)。IF染色顯示,與表達DRD2的**細胞共培養后,Mφ表現為M1表型(圖3E)。上述結果表明,BrCa中的DRD2具有將Mφ重新編碼為M1表型的能力。為了探索使Mφ向M1表型分化的關鍵調控因子,我們進行了細胞因子陣列分析。結果表明,TNF-α和兩種誘導M1極化的經典細胞因子IFNγ均未增加。而與Mφ共培養后,DRD2***下調IL-6和IL-10(圖3F)。分析熒光值,進一步證實IL-6和IL-10下調(圖3F)。因此,DRD2可以將Mφ重新編碼為M1表型,并在crosstalk過程中***下調IL-6和IL-10。 英拜專注高通量測序行業的整體服務。
1、白樺素作為SREBP加工特異性抑制劑的鑒定
構建了一個由含SRE啟動子驅動的熒光素酶報告基因,并從人肝*細胞系Huh-7中生成了穩定表達該報告基因的細胞系(命名為Huh-7/SRE-Luc)。然后將該細胞與不同化合物孵育,并進行熒光素酶活性測定。有趣的是,只有白樺素[lup-20(29)-ene-3b,28-diol]有效降低了熒光素酶的活性。白樺素是一種天然存在的五環三萜,可以很容易地從樺樹皮中提取出來(比較高可達干重的30%)。
作者直接檢測了白樺素對SREBP加工的影響和特異性,并與25-HC進行比較。25-HC有三個主要作用:通過抑制SREBP-2的切割降低n-SREBP-2(圖1A);***LXR,進而上調SREBP-1的轉錄,導致n-SREBP-1的增加(圖1A);促進HMG-CoA還原酶(HMGCR)的降解,HMGCR是膽固醇生物合成中的限速酶(圖1B)。另一方面,白樺素有效降低了內源性的n-SREBP-1和n-SREBP-2(圖1A),表明白樺素在不***LXR的情況下抑制了SREBP的加工。 促進胰腺*的生長和轉移。代謝科研
**近科研技術的開發。基礎醫學科研技術指導
人類的炎癥反應和自身免疫甲基化PCR芯片用于研究已報道參與炎癥反應的22個關鍵基因的啟動子甲基化狀態。利用該芯片分析細胞或新鮮組織DNA樣本可能有助于研究CpG島甲基化狀態與促炎或***反應的關系。結果也可能助于洞察炎性疾病背后的分子機制和生物學通路。利用這個芯片,通過簡單的限制性內切酶消化和實時定量PCR,就可以研究分析22個不同炎癥反應與自身:免疫基因的啟動子甲基化狀態。芯片:信號通路pcr芯片 蛋白芯片。標書申請:提供標書撰寫,標書部分基礎實驗的展開,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。基礎醫學科研技術指導
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
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3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗