上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)促進(jìn)**發(fā)生和轉(zhuǎn)移，增加**對(duì)***干預(yù)的耐受性。TGF-b和Wnt通路的異常***誘導(dǎo)EMT。lncRNAs***影響EMT調(diào)控。2021年6月發(fā)表于Molecular Therapy-Nucleic Acids（IF=8.886）的文章“l(fā)ncRNA MIR210HG promotes the progression of endometrial cancer by spongingmiR-337-3p/137 via the HMGA2-TGF-b/Wnt pathway”對(duì)此展開(kāi)了研究。在此，我們發(fā)現(xiàn)MIR210HG在子宮內(nèi)膜*組織中過(guò)表達(dá)，與不良預(yù)后相關(guān)。MIR210HG的沉默在體外***抑制了細(xì)胞增殖、遷移、侵襲和EMT表型的形成以及在體內(nèi)的**發(fā)生。生物信息學(xué)分析、RIP分析和熒光素酶分析表明，MIR210HG作為miR-337-3p和miR-137的分子海綿，調(diào)節(jié)HMGA2的表達(dá)。此外，MIR210HG過(guò)表達(dá)***增強(qiáng)了Wnt/b-catenin和TGF-b/Smad3信號(hào)通路基因，而MIR210HG或HMGA2下調(diào)抑制了Wnt/b-catenin和TGF-b/Smad3信號(hào)通路基因。我們?cè)贛IR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2軸上的發(fā)現(xiàn)說(shuō)明了其作為子宮內(nèi)膜****發(fā)展的靶點(diǎn)的潛力。Caspase-11介導(dǎo)的肝細(xì)胞焦亡促進(jìn)非酒精性脂肪性肝炎的進(jìn)展。rDNA測(cè)序科研服務(wù)兩年
二、G4穩(wěn)定性在基因區(qū)和非基因功能區(qū)之間存在差異
根據(jù)穩(wěn)定性得分將G4基因座分為2組，高于19分的為“穩(wěn)定G4基因座”（342778個(gè)），低于19分的為“不穩(wěn)定G4基因座”（327298個(gè)），繪制穩(wěn)定性得分分布圖：
三、G4功能受到不同基因區(qū)域的限制
HKT檢驗(yàn)顯示，G4基因座的進(jìn)化取決于它們位于哪個(gè)基因組件內(nèi)。G4基因座在上游、下游基因區(qū)域、5'UTR、3'UTR的優(yōu)勢(shì)比***大于1。位于增強(qiáng)子、復(fù)制起點(diǎn)以及在TAD邊界區(qū)域的G4基因座優(yōu)勢(shì)比都很高，這一發(fā)現(xiàn)表明這三種區(qū)域的G4基因座是有功能的。
這項(xiàng)工作表明， G4 的覆蓋率、密度、預(yù)測(cè)穩(wěn)定性和選擇壓力取決于它們所在的基因成分和非基因功能區(qū)域。自然選擇在基因組的某些功能區(qū)域中保持了高密度的 G4 位點(diǎn)和高穩(wěn)定性的 G4 結(jié)構(gòu)，以及在其他功能區(qū)中保持低密度和低穩(wěn)定性。每個(gè)特定區(qū)域組的情況可能取決于維持功能性 G4 的選擇壓力與容納此類結(jié)構(gòu)的成本之間的平衡。 菌群科研中標(biāo)率高M(jìn)ETTL14是其***的潛在靶點(diǎn)。
在皂苷處理的MCF-7細(xì)胞中，觀察到內(nèi)源性INPP4B與HARab7WT或HA-Rab7Q67L共同定位于cd63陽(yáng)性的晚期核內(nèi)體(圖3e)。HA-Rab7T22N是一個(gè)不定位于晚期核內(nèi)體的顯性陰性突變體(補(bǔ)充圖3f)，它的表達(dá)也阻止了內(nèi)源性INPP4B的募集(圖3e)，表明活性的gtp結(jié)合的Rab7是INPP4B亞細(xì)胞定位到晚期核內(nèi)體所必需的。 GFP-INPP4B***提高了細(xì)胞內(nèi)PI(3)P水平(1.8倍)(圖3f)，PI(3,4)P2也存在于早期和晚期核內(nèi)體。表達(dá)INPP4B shrna的MCF-7細(xì)胞顯示出更明顯的細(xì)胞內(nèi)PI(3,4)P2斑點(diǎn)，表明INPP4B缺失抑制PI(3,4)P2在核內(nèi)體上的降解，導(dǎo)致其積累(圖3g)。GFP-INPP4B沒(méi)有改變PI(3) p陽(yáng)性早期核內(nèi)體的比例，但***增加了PI(3) p陽(yáng)性晚期核內(nèi)體的比例(1.7倍)(圖3h, i)。
接下來(lái)，研究了CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體對(duì)巨噬細(xì)胞M2極化的影響。如Fig.3e所示，當(dāng)與巨噬細(xì)胞共培養(yǎng)時(shí)，標(biāo)記有DiO(綠色)的CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體被未染色的巨噬細(xì)胞內(nèi)化。相比于低表達(dá)miR-934的細(xì)胞的外泌體孵育的巨噬細(xì)胞或PBS孵育的細(xì)胞，M2標(biāo)記物(CD206,arginase-1,IL10和CD163)的表達(dá)在高表達(dá)miR-934的CRC細(xì)胞的外泌體孵育的巨噬細(xì)胞中***增加，而M1標(biāo)記物(iNOS和IL-1β)幾乎無(wú)差異（Fig.3f,g）。
為了確定CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-934是否誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞的M2極化，首先生成了miR-934mimics和anti-miR-934來(lái)過(guò)表達(dá)或抑制miR-934的表達(dá)。與對(duì)照組相比，轉(zhuǎn)染miR-934mimics的巨噬細(xì)胞M2標(biāo)記物(CD163、CD206、arginase-1和IL10)的表達(dá)明顯增加（Fig.3h,i）。此外，用anti-miR-934、miR-934mimics或其陰性對(duì)照載體轉(zhuǎn)染HCT-8和HT29細(xì)胞，提取其外泌體并添加到PMA處理的THP-1細(xì)胞中。結(jié)果顯示，轉(zhuǎn)染anti-miR-934或miR-934mimics的CRC細(xì)胞的外泌體中M2標(biāo)記物(CD206、arginase-1、IL10和CD163)在PMA處理的THP-1細(xì)胞中表達(dá)明顯低于或高于載體對(duì)照組（Fig.3j,k）。綜上所述，證實(shí)CRC細(xì)胞來(lái)源的外泌體miR-934可以誘導(dǎo)巨噬細(xì)胞M2極化。 增加乳酸桿菌水平導(dǎo)致尿酸水平下降。
與HuR的RRM3結(jié)合，中斷HuR-β-actinmRNA相互作用，抑制β-actin表達(dá)，抑制OPC遷移
為闡明lnc-PMIF如何與HuR相互作用調(diào)節(jié)β-actin表達(dá)和OPC遷移，首先通過(guò)生物信息學(xué)分析預(yù)測(cè)了lnc-PMIF的二級(jí)結(jié)構(gòu)，并合成生物素化的全長(zhǎng)lnc-PMIF（WT）和截短的lnc-PMIF突變體，分別為突變體A1（無(wú)5’莖環(huán)的正義）、突變體A2（有中心莖環(huán)和3’莖環(huán)的正義）和突變體A3（*有3’莖環(huán)的正義1100-1455bp），轉(zhuǎn)染MC3T3-E1細(xì)胞，并進(jìn)行標(biāo)記RNA鏈霉親和素下拉試驗(yàn)。蛋白免疫印跡分析顯示，HuR存在于轉(zhuǎn)染W(wǎng)Tlnc-PMIF、截短lnc-PMIF突變體A1或截短lnc-PMIF突變體A2的細(xì)胞的下拉部分中，但在轉(zhuǎn)染截短lnc-PMIF突變體A3的細(xì)胞的下拉部分中不存在。這些數(shù)據(jù)表明，lnc-PMIF的中心莖環(huán)足以實(shí)現(xiàn)lnc-PMIF和HuR之間的相互作用。 英拜生物您隨身的科研小助手。成都WB科研
英拜潤(rùn)色的標(biāo)書的中標(biāo)率**提高。rDNA測(cè)序科研服務(wù)兩年
AP損傷后胰腺巨噬細(xì)胞的表型變化
A動(dòng)物模型使用雨蛙素誘導(dǎo)，。為了研究AP后的修復(fù)/再生過(guò)程，用更高劑量的雨蛙素（100μg/kg，每小時(shí)10次）誘導(dǎo)AP，并在一周內(nèi)的不同時(shí)間點(diǎn)收集胰腺。接受雨蛙素誘導(dǎo)***的AP小鼠在24小時(shí)后顯示出腺泡壞死和白細(xì)胞浸潤(rùn)的組織學(xué)跡象以及血清淀粉酶升高。第3天出現(xiàn)典型的腺泡-導(dǎo)管化生(ADM)結(jié)構(gòu)，第7天左右迅速恢復(fù)正常腺泡。為了檢測(cè)免疫細(xì)胞的比例，分離并分析了AP誘導(dǎo)后的胰腺白細(xì)胞。發(fā)炎的胰腺內(nèi)**豐富的免疫細(xì)胞是巨噬細(xì)胞（CD11b+F4/80+CD11c-）。流式細(xì)胞術(shù)分析的胰腺巨噬細(xì)胞數(shù)量在第1天和第3天顯著增加。根據(jù)F4/80水平，胰腺巨噬細(xì)胞從第1天到第3天逐漸成熟。巨噬細(xì)胞在組織中的積累以兩種方式發(fā)生：?jiǎn)魏思?xì)胞的募集和駐留巨噬細(xì)胞的增殖。AP急性炎癥期的大多數(shù)巨噬細(xì)胞來(lái)自單核細(xì)胞的浸潤(rùn)。 rDNA測(cè)序科研服務(wù)兩年
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4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)