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與SMARCA4類似,SMARCC1[15](在ChIP-SICAP中發(fā)現(xiàn))顯示與C1和C2位點相結(jié)合(圖2g)。
重點分析了ARBs染色質(zhì)可及性的變化,發(fā)現(xiàn)雄***通常增加了ARBs的可及性(圖3a, ATAC, siCTRL)。盡管SBs和ARBs之間有很大的重疊,但SMARCA4刪除*減少了2149個ARBs的染色質(zhì)可及性。這些sismarca4受影響的位點中有一半是開放的,不管***暴露與否(pre-accessible),其余的在***暴露后顯示其可及性增加(de novo位點,圖3a和c)。被AR招募的SMARCA4增加染色質(zhì)可及性,潛在地協(xié)助其他因素招募到這些位點(圖3d,補充表2)。由于雄***誘導(dǎo)了FOXA1在sismarca4影響位點的結(jié)合(圖3e), AR誘導(dǎo)的SMARCA4的招募可能有助于雄***誘導(dǎo)FOXA1的結(jié)合。上述結(jié)果表明SMARCA4在CRPC細胞染色質(zhì)景觀的調(diào)節(jié)中既有AR依賴的作用,也有非ARr**的作用。 英拜生物提供生物科學(xué)內(nèi)的專業(yè)的技術(shù)咨詢,技術(shù)合作。Notch信號靶標(biāo)科研實驗外包
1、白樺素作為SREBP加工特異性抑制劑的鑒定
構(gòu)建了一個由含SRE啟動子驅(qū)動的熒光素酶報告基因,并從人肝*細胞系Huh-7中生成了穩(wěn)定表達該報告基因的細胞系(命名為Huh-7/SRE-Luc)。然后將該細胞與不同化合物孵育,并進行熒光素酶活性測定。有趣的是,只有白樺素[lup-20(29)-ene-3b,28-diol]有效降低了熒光素酶的活性。白樺素是一種天然存在的五環(huán)三萜,可以很容易地從樺樹皮中提取出來(比較高可達干重的30%)。
作者直接檢測了白樺素對SREBP加工的影響和特異性,并與25-HC進行比較。25-HC有三個主要作用:通過抑制SREBP-2的切割降低n-SREBP-2(圖1A);***LXR,進而上調(diào)SREBP-1的轉(zhuǎn)錄,導(dǎo)致n-SREBP-1的增加(圖1A);促進HMG-CoA還原酶(HMGCR)的降解,HMGCR是膽固醇生物合成中的限速酶(圖1B)。另一方面,白樺素有效降低了內(nèi)源性的n-SREBP-1和n-SREBP-2(圖1A),表明白樺素在不***LXR的情況下抑制了SREBP的加工。 廣州豐度科研上海英拜生物的動物建模實驗。
人類干細胞miRNA的PCR芯片用于研究干細胞感應(yīng)、維護、分化和識別相關(guān)的84個miRNA的表達。所有的干細胞都能夠自我更新和分化成多種細胞類型。多能干細胞能夠分化成3胚層的任何類型細胞,而3胚層表達--組對多能性至關(guān)重要的miRNA,包括可以提高重編程使分化細胞回到干細胞狀態(tài)。然而,**近的研究表明,與胚胎干細胞(ESC)相比,誘導(dǎo)多能干細胞(IPSC)和始發(fā)態(tài)(或外胚層)干細胞(epiSC)的miRNA表達有差異。在分化過程多能性標(biāo)記物的表達水平下降而其他分化關(guān)鍵miRNA的表達增加。附加的miRNA在特定階段或在特定血統(tǒng)變得更加普遍,導(dǎo)致miRNA對三種不同胚層祖細胞獨特的表達模式。這個芯片確定miRNA的相對表達對多能性和分化干細胞重要性。芯片還額外包括**胚胎干細胞(ESC),誘導(dǎo)多能干細胞(iPSC),外胚層干細胞(epiSC),胚狀體的身體細胞,胚層祖細胞的標(biāo)記。每張芯片含-個對照組使得分析數(shù)據(jù)時可以用相對定量OOCT方法評估逆轉(zhuǎn)錄效率,基因組DNA污染和PCR效率。利用這張芯片,通過實時定量PCR??梢院喴浊铱煽康貦z測與干細胞**相關(guān)的miRNA的表達。
然后使用單細胞RNA-seq來描述移植后30天脾臟中存留的T細胞的轉(zhuǎn)錄譜(Fig.4G)。使用pseudobulkRNA-seq分析和預(yù)轉(zhuǎn)移體外培養(yǎng)的基因比較,生成了持續(xù)細胞的基因標(biāo)記,其標(biāo)志是記憶相關(guān)基因(Sell,F(xiàn)oxp1,Tcf7,Cd7,Il7r,Klf2,Ccl5)的高表達和效應(yīng)相關(guān)基因(Gzmd,Ifng,Prf1,Gzma,Gzmb)的低表達(Fig.4H-I)。對先前的體外單細胞數(shù)據(jù)(Fig.2H-J)的進一步分析顯示,CDK4/6i處理后,具有這種持續(xù)性特征的細胞頻率從7.5%增加至26.8%(Fig.4J-K)。這些數(shù)據(jù)表明,抑制CDK4/6促進T細胞向真實的記憶表型分化,其特征是功能的長期持久性。文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(jié)(MLN)中的Th17細胞(與結(jié)腸炎癥密切相關(guān))。
METTL3增強APCmRNA的m6A和隨后的YTHDF結(jié)合抑制APC表達
YTHDF1-3介導(dǎo)mRNA降解,針對YTHDF1的抗體進行RIP分析,實時定量PCR分析顯示,在KYSE180中,與APCmRNA結(jié)合的YTHDF2的數(shù)量遠遠多于YTHDF1和YTHDF3的數(shù)量,并且由于METTL3缺失而減少。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,在很大程度上促進了YTHDF2與APCmRNA的結(jié)合。
為了研究YTHDF2與APCmRNA結(jié)合在APC表達中的作用,我們?nèi)コ薡THDF2,這增加了KYSE450細胞中APC的mRNA(圖5d和補充圖5e)和蛋白質(zhì)表達。YTHDF1–3的聯(lián)合缺失進一步增加了這些細胞中APC的mRNA和蛋白質(zhì)表達。此外,還進行了熒光素酶報告子分析,結(jié)果表明,缺失YTHDF2增強了由含m6A的WTAPCCDS序列驅(qū)動的熒光素酶活性,而突變的APC增強了熒光素酶活性,并使該活性抵抗了YTHDF2缺失的調(diào)節(jié)。此外,METTL3過表達抑制由WTAPCCDS序列驅(qū)動的熒光素酶活性通過YTHDF2耗竭恢復(fù),其不影響突變的APC增強的熒光素酶活性。這些結(jié)果表明METTL3增加了APCmRNA的m6A,隨后的YTHDF結(jié)合抑制了APC的表達。 評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調(diào)節(jié)因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達。胰島素抵抗芯片科研實驗可參觀
英拜跟客戶形成產(chǎn)學(xué)研合作模式。Notch信號靶標(biāo)科研實驗外包
在Fth- KO小鼠中, TBI后褪黑素對神經(jīng)的保護作用被**取消
為了進一步探索神經(jīng)元Fth的喪失是否影響褪黑素對TBI誘導(dǎo)的鐵死亡的影響,測量了鐵死亡的幾種假定的生物標(biāo)志物。發(fā)現(xiàn)***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平?jīng)]有影響。令人驚訝的是,盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達水平?jīng)]有顯著差異,但是在褪黑素***的小鼠中,觀察到Fpn mRNA和蛋白表達水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是,與未***的Fth- KO小鼠相比,用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA(Slc7a11,Ptgs2)和蛋白質(zhì)(xCT,Cox2、4HNE)的表達。另外,用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統(tǒng)計學(xué)上降低GSH和MDA以及4HNE的水平,和FJB陽性細胞的數(shù)目。這些結(jié)果表明褪黑素沒有統(tǒng)計學(xué)上減少TBI引起的鐵死亡和神經(jīng)元變性。 Notch信號靶標(biāo)科研實驗外包
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學(xué)實驗