外泌體(Exosome)是由細胞分泌而來的微小囊泡,直徑約為30-100nm,具有杯狀形態(tài)、雙層膜結構,天然存在于血液、尿液、唾液、母乳和細胞培養(yǎng)基等生物體液中。包括**細胞在內幾乎所有類型的細胞(兔疫細胞、神經(jīng)細胞、干細胞),都可以產(chǎn)生并釋放exosome。Exosome可通過細胞膜受體直接***受體細胞,也可運輸?shù)鞍踪|、mRNA、miRNA、IncRNA、circRNA,甚至細胞器進入受體細胞,參與細胞間通訊。Exosome在免疫應答、炎癥反應、血管生成、凋亡、凝血和廢物處理等生理過程發(fā)揮關鍵作用,可作為多種疾病的早期診斷標記物,也能作為靶向藥物的載體進行疾病***。miRNA是一類22nt左右大小的非編碼分子，它可以通過外泌體從一個地方轉運到另外一個地方行使基因沉默功能。通過檢測外泌體中miRNA表達變化,可以發(fā)現(xiàn)外泌體中miRNA特異性功能。FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。基因組研究服務科研整體服務
如圖5所示，E8中的d-flow改變了白細胞流量和炎癥標志物(Il1β、Il6、Ccl2和Ccl3);ECM調節(jié)(Adamts4, Lamb1, Timp3，和Timp4);血管調節(jié)(Nos3, Ptgs2，和Edn1);和脂質代謝(Tm6sf2、Lsr和Mgll)，并與E2的s-flow進行比較(圖5A-5D)。這些結果表明，d-flow***了致***的內皮反應，同時通過改變轉錄和染色質可及性水平上的基因表達來抑制抗***通路。
三、體內血流依賴TF結合基序的鑒定
使用Signac和ChromVar軟件包通過我們的scATAC-seq數(shù)據(jù)集來識別流敏感的TF結合基序(圖6)。在每個內皮聚類(E1- E8)中識別出前20個TF結合基序，并繪制成熱圖(圖6A)。圖6B和6C顯示了TF結合基序和它們被發(fā)現(xiàn)的各自的細胞簇。 神經(jīng)炎癥科研中標率高Caspase-11介導的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。
6）MAPK1-109aa通過競爭性結合MEK1來抑制MAPK1的磷酸化
為了研究MAPK1-109aa抑制GC的分子機制，我們將標記的MAPK1-109aa質粒轉染HEK293T細胞。在flag標記的MAPK1-109aa免疫沉淀復合物中，潛在的相互作用蛋白被拉下(圖7a)。采用蛋白MS分析對差異表達蛋白進行鑒定。在被識別的蛋白質列表中，豐度比較高的蛋白質是MEK1，表明MEK1是MAPK1-109aa潛在的相互作用蛋白(圖7b，c)。此外，flag標記的MAPK1-109aa可以與MEK1相互作用，證實了MAPK1-109aa與MEK1之間的直接相互作用(圖7d)。免疫熒光染色顯示MAPK1-109aa與MEK1共定位(圖7e)。此外，我們采用MEK1抗體免疫共沉淀，探討MAPK1-109aa對MAPK1通路的潛在調控作用。
確定關鍵驅動突變在原始和committed亞型中的分布(圖1C，補充討論中的亞型和突變部分和補充表6 17)。盡管亞型中富含某些突變(原始組的FLT3-ITD和承諾組的DNMT3A)，驅動突變的遺傳改變對原始和committed亞型的預測較差(補充圖3 16和補充討論)，基因突變和亞型之間的Matthews相關系數(shù)(MCC)較低(FLT3-ITD的MCC = 0.32, DNMT3A的MCC = 0.16;在precision-recall曲線(AUPRC = 0.62)值下，突變與亞型之間的多變量分析得到一個薄弱區(qū)域(Supplementary Fig. 7)。**近科研技術的開發(fā)。
5）上調UCP1緩解AKI期間的脂質積累，***抑制疾病進展
為了在體內驗證脂質對AKI功能的影響，我們通過在腎臟多點注射過表達UCP1腺病毒，構建過表達UCP1動物模型，以消除脂質在AKI中的堆積。在UCP1過表達動物模型中，腎損傷指標NGAL明顯降低(圖5A)。HE和PAS染色顯示腎臟形態(tài)有很大改善，腎小管損傷評分顯示，在UCP1介導的脂質消耗增加后，腎小管損傷程度明顯降低(圖5B-C)。順鉑刺激后腎小管呈空泡變性，細胞扁平，管腔擴張，而UCP1過表達明顯改善了病理改變。血清肌酐(SCr)和尿素氮(BUN)這兩項腎臟損傷指標也出現(xiàn)了類似的***下降(圖5D-E)。利用UCP1激動劑CL316243在AKI動物模型中緩解脂堆積，進一步驗證了上述結果。***后NGAL***降低(圖5F)，腎臟形態(tài)、腎小管損傷評分、SCr、BUN均***改善(圖5G-J)。因此，在體內，上調UCP1以緩解AKI脂質積累可以抑制AKI進展。 發(fā)現(xiàn)乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。線粒體科研地區(qū)科學基金
大黃酸處理沒有改變乳酸菌尿酸的產(chǎn)生。基因組研究服務科研整體服務
為了確定METTL3促進**細胞增殖的機制，檢測了METTL3在ESCC細胞上轉錄調節(jié)中的作用。METTL3缺失降低了KYSE180細胞中m6A的總豐度。甲基化RNA免疫沉淀（MeRIP）和m6A特異性抗體，然后進行RNA測序（MeRIP-seq），發(fā)現(xiàn)KYSE180的mRNA中鑒定的m6A位點與RRACH序列一致。m6A信號在mRNAs的終止密碼子和3′-非翻譯區(qū)富集。在MeRIP-seq中METTL3缺失減少了1101個基因的mRNAs中1199個m6A峰。轉錄組測序發(fā)現(xiàn)METTL3缺失調節(jié)2973個基因的表達。二者取交集發(fā)現(xiàn)共有93個基因重疊。MeRIP-seq中細胞成分（CC）項的基因本體（GO）富集分析表明，在METTL3缺失的KYSE180細胞中，β-連環(huán)蛋白降解復合物（的基因組（包括APC）中m6A水平***降低。基因組研究服務科研整體服務
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