熱圖科研中標(biāo)率高

    中國科學(xué)院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組和北京基因組研究所（國家生物信息中心）鮑一明研究組、張維綺研究組合作建立了AgingAtlas數(shù)據(jù)庫（./aging/index）。數(shù)據(jù)庫相關(guān)文章于2020年10月29日以“AgingAtlas:amulti-omicsdatabaseforagingbiology”為題在線發(fā)表于NucleicAcidsResearch雜志（IF=）。

AgingAtlas目前的實現(xiàn)包括五個模塊：轉(zhuǎn)錄組學(xué)、單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組學(xué)、表觀基因組學(xué)、蛋白質(zhì)組學(xué)和藥物基因組學(xué)。此外，AgingAtlasConsortium還手動管理了一系列與衰老相關(guān)的人類和小鼠基因(GAAA)。GAAA部分現(xiàn)在包含數(shù)百個人類和小鼠衰老相關(guān)基因，分為10個“基因集”和相應(yīng)的KEGG通路。基因組具有成熟的老化特征，包括基因組不穩(wěn)定性、端粒磨損、表觀遺傳改變、蛋白質(zhì)穩(wěn)態(tài)喪失、線粒體功能障礙、營養(yǎng)感知失調(diào)、細(xì)胞間通訊改變、細(xì)胞衰老和干細(xì)胞衰竭。AgingAtlasConsortium的老年學(xué)專家將GAAA中的每個基因都?xì)w因于這些基因集。因此，GAAA提供了AgingAtlas的基準(zhǔn)部分，以幫助用戶更好地解釋這些與衰老相關(guān)的基因的生物學(xué)意義。 英拜提供生命科學(xué)內(nèi)的一體化服務(wù)。熱圖科研中標(biāo)率高

與基因表達(dá)改變一致，白樺素處理以濃度依賴性的方式***減少了膽固醇和脂肪酸的從頭合成（圖3D-E）。此外，白樺素降低了細(xì)胞膽固醇（圖3F）和中性脂質(zhì)（主要是膽固醇酯和甘油三酸酯）的穩(wěn)態(tài)水平（圖3G）。 兩者合計，我們的數(shù)據(jù)表明白樺素抑制SREBP加工并下調(diào)膽固醇和脂肪酸的生物合成，從而降低細(xì)胞脂質(zhì)水平。 有趣的是，洛伐他汀顯著降低了膽固醇的合成（圖3D），但也適度地增加了脂肪酸的生物合成（圖3E），這可能是因為洛伐他汀是HMGCR的抑制劑，它可以阻斷膽固醇的合成，進(jìn)而刺激SREBP的活化，從而增加脂肪酸合成。  分子毒理通路發(fā)現(xiàn)者科研實驗外包增加乳酸桿菌水平導(dǎo)致尿酸水平下降。

4.ELNAT1直接與hnRNPA1相互作用

由于lncRNA的分子功能與其亞細(xì)胞定位相關(guān)，通過FISH和亞細(xì)胞定位實驗發(fā)現(xiàn)ELNAT1在UM-UC-3和T24細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)和細(xì)胞核均有表達(dá)（SupplementalFigure7A,B）。并且通過RNA-pulldown實驗，發(fā)現(xiàn)在分子量35~40kDa上有明顯的條帶（Figure4A）。對此，通過質(zhì)譜（MS）和Westernblot分析顯示，hnRNPA1是**豐富的ELNAT1相互作用蛋白（Figure4B-D）。熒光染色和RNA免疫沉淀（RIP）證實了ELNAT1和hnRNPA1在UM-UC-3和T24細(xì)胞中的共定位，并且ELNAT1通過內(nèi)源性hnRNPA1富集（Figure4E,F），進(jìn)一步驗證了ELNAT1和hnRNPA1之間的相互作用。

背景：超過100個不同的RNA修改特征已經(jīng)在過去的幾十年里,其中,該N6-methyladenosine(m6A)修改是**豐富的形式在真核mRNA。不同的m6A讀者蛋白優(yōu)先區(qū)分轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)的RNAm6A景觀。在細(xì)胞質(zhì)中，大多數(shù)YTH(YTHDF1-3和YTHDC2)和IGF2BP(IGF2BP1-3)家族蛋白與m6a修飾的mrna結(jié)合并調(diào)節(jié)其穩(wěn)定性和翻譯。此外，其他蛋白質(zhì)可以結(jié)合m6a修飾的前體rna在細(xì)胞核內(nèi)，并影響其加工。

m6a相關(guān)基因缺陷影響多種生物過程。例如，metttl3的缺失導(dǎo)致受損的胚胎干細(xì)胞退出自我更新走向分化;抑制METTL14導(dǎo)致明顯的胚胎生長遲緩;斑馬魚胚胎中YTHDF2的消融延遲了早期胚胎發(fā)育中的母-合子過渡。特別是，RNAm6a相關(guān)基因正在成為在各種**中促進(jìn)**啟動和進(jìn)展的關(guān)鍵調(diào)控因子，包括肺*中的metttl3、肝*中的metttl14、白血病中的FTO和乳腺*中的ALKBH5。然而，m6A如何調(diào)節(jié)*變以及下游通路和機制如何傳遞這些信號尚不完全清楚。 大黃酸能緩解D。SS誘導(dǎo)的小鼠慢性結(jié)腸炎。

四、atm依賴性PTEN磷酸化缺失的細(xì)胞中G1/S細(xì)胞周期檢查點受損

對表達(dá)PTEN-WT或PTEN-398A的MCF10A細(xì)胞進(jìn)行了cDNA微陣列分析，并用順鉑誘導(dǎo)基因毒性應(yīng)激。差異表達(dá)基因列表采用基因**富集分析[39]進(jìn)行分析。有趣的是，表達(dá)PTEN-398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點的***有關(guān)，如G1/S期特異性轉(zhuǎn)錄、E2F靶標(biāo)、Rb1通路控制的細(xì)胞周期調(diào)控基因等推測表達(dá)PTEN-398A的細(xì)胞對基因毒性脅迫的抗性可能是由于未能阻止細(xì)胞周期以應(yīng)對DNA損傷。為了測試這種可能性，測量了表達(dá)野生型或突變PTEN的同步細(xì)胞在細(xì)胞周期阻滯在G1/S檢查點的能力，以應(yīng)對DNA損傷。在表達(dá)PTEN-WT或PTEN-398A的正常周期細(xì)胞中，G1、S、G2/M期細(xì)胞比例沒有明顯差異(圖4A)。為了使細(xì)胞在G1/S檢查點同步，我們對它們施加雙胸腺嘧啶脈沖。這種處理有效地抑制了PTEN-WT和PTEN-398A細(xì)胞在G1/S邊界(圖4B)。

大黃酸導(dǎo)致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。成都急性腎損傷科研

鑒定的前列腺瘤細(xì)胞內(nèi)源性雄***受體網(wǎng)絡(luò)。熱圖科研中標(biāo)率高

接下來，測定了分泌的miR-208b對體內(nèi)Treg和存活的影響，如圖8A-B所示，CD4+- CD25+ Foxp3+ Treg在外周血和脾臟分離的總CD4+ T細(xì)胞群中的比例在miR-208b-OE組和miR-208b-OE + OXA組***升高，而在miR-208b-KD和miR-208b-KD + OXA***下降。與此一致，miR-208b低表達(dá)組的生存率也***高于高表達(dá)組（圖8C）。綜上所述，這些結(jié)果表明，**分泌的miR208b增加了Treg的百分比，促進(jìn)了**在體內(nèi)的生長。此外，奧沙利鉑在體內(nèi)可以通過miR-208b調(diào)控Tregs的數(shù)量，這與奧沙利鉑成分的化學(xué)敏感性有關(guān)。熱圖科研中標(biāo)率高

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