然而,在單細胞方法中,尚未出現一種適用于所有三種模式的統一方法,這種方法可以應用于高度特定的功能免疫細胞類型。我們系統地測試了PBMCs的全細胞和核純化和制備方法,以克服以往的分析只限于測量細胞表面的核成分(ATAC和核rna)或蛋白質的局限性。我們發現完整的透性細胞的scATAC-seq表現非常好,在某些測量中超過了傳統的細胞核scATAC-seq(圖1b)。這一發現使得一種類似于轉錄組和表位的細胞索引(CITE-seq)的新方案能夠測量表面蛋白豐度和染色質可及性:染色質景觀和表位的整合細胞索引(ICICLE-seq,圖1a和3)。***,我們證明了我們優化的可滲透細胞方法可以與基于液滴的多組學平臺相結合,從而能夠同時測量細胞的三個不同的分子隔間:mRNA(通過scRNA-seq),蛋白質(使用寡聚標記抗體)和DNA(通過scATAC-seq),我們根據轉錄、表位和可及性將其稱為TEA-seq(圖4)。總之,對單細胞水平上基因調控和表達的分子基礎有了新的、更統一的看法。大黃酸導致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。浙江神經保護科研
3、白樺素可以改善小鼠飲食導致的肥胖并增加能量消耗
接下來,研究了白樺素在體內的作用。洛伐他汀是一種HMGCR抑制劑,具有良好的有益作用,將其與白樺素進行比較。用對照(鹽水),洛伐他汀(30mg/kg/day)或白樺素(15或30mg/kg/day)處理西式飲食(WD)的C57BL/6J小鼠6周。在***期間,未觀察到白樺素或洛伐他汀的明顯毒性,并且不同組的小鼠顯示出相似的食物攝入(圖4A)。有趣的是,盡管小鼠以30mg/kg/day加WD飲食喂養的老鼠比chow飲食喂養的小鼠重,但它們的體重增加比WD喂養的老鼠少,這表明在此劑量下,白樺素和洛伐他汀可以預防飲食引起的肥胖癥(DIO)(圖4B)。洛伐他汀對體重的影響與以前的報道一致。 細胞遺傳學科研整體服務為了闡明胰腺*中m6A水平升高的分子機制。
IL-3/IL-4能誘導M2巨噬細胞極化,預先用50ng /mL IL-3/IL-4處理THP-1細胞3天,驗證anti-miR-934對M2巨噬細胞極化的影響。結果顯示PTEN過表達部分減弱了miR-934和HCT-8細胞來源外泌體對M2標記物(CD206, arginase-1和IL10)表達的增強作用,而PTEN的沉默則相應地逆轉了anti-miR-934對M2標記物表達的衰減效應(Fig. 5g, i)。流式細胞術檢測M2巨噬細胞標志物CD163在PMA處理的THP-1細胞中的表達,結果與上述結果一致(Fig. 5j)。總之,研究結果表明,miR-934增強了CRC細胞來源的外泌體對M2巨噬細胞極化誘導的增強作用,而anti-miR-934減弱了其增強作用。
為了進一步探討m6A修飾在FZD7 mRNA中的作用,我們構建了三種FZD7突變體,其中一種突變體為***個m6A峰(FZD7- peak1 Mut),另一種突變體為第二個m6A峰(FZD7- Peak2 Mut),以及雙突變體(FZD7- peak1 &2 Mut;圖5)。與野生型相比FZD7 (FZD7-WT)突變在第二m6A峰和雙m6A峰值突變(FZD7-Peak2傻瓜和FZD7-Peak1&2Mut)野生型YTHDF1沒有反應過度(7和8)圖5 h,面板,建議第二m6A峰FZD7 YTHDF1的主要網站的監管。同樣,m6a結合能力的喪失完全消除了YTHDF1促進FZD7 mRNA翻譯的作用(圖5H,圖9 12)。這些結果表明YTHDF1介導的FZD7的翻譯控制依賴于m6A修飾。大黃酸改變嘌呤代謝降低尿酸水平。
4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取
Xc-系統是一個胱氨酸/谷氨酸逆向轉運蛋白,捕獲細胞外的胱氨酸,用于谷胱甘肽的合成,以交換谷氨酸的釋放。在圖3中,被抑制的Xc-系統功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關,然而YTHDC2如何調節Xc-系統依然未知。文獻報道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發現,SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負調控(圖4A、B)。在小鼠中,與KPE和KPYΔYTH小鼠相比,KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達下調(圖4C、D)。這證明YTH結構域是YTHDC2抑制SLC7A11表達的前提。 評估了成對*組織和鄰近組織樣本中**重要的m6A調節因子(METTL3、METTL14和WTAP)的表達。接異體科研國家自然科學基金
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1.肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11表達上調和***
為了探討Caspase-11在肝脂肪變性中的作用,我們首先檢測了肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11的表達。如圖1A所示,與正常小鼠相比,MCD誘導的肝脂肪變性小鼠肝臟中Caspase-11mRNA明顯增加。相應的,在MCD誘導的肝脂肪變性小鼠的肝臟中,pro-caspase-11(圖1B和C)和cleaved-caspase-11(圖1B和D)的蛋白水平均***上調。這些結果提示Caspase-11與肝臟脂肪變性呈正相關。
2.Caspase-11缺乏減弱MCD誘導的小鼠肝脂肪變性
為了評估Caspase-11對肝脂肪變性的潛在影響,我們在Caspase-11缺陷小鼠中誘導肝脂肪變性并監測表型。正常野生型和Caspase-11缺陷小鼠肝臟組織學表現正常。野生型小鼠經MCD***后,肝臟出現明顯的脂肪變性和腫脹。與MCD處理的野生型小鼠相比,MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的脂肪變性和腫脹明顯減少(圖2A)。相應的,與MCD處理的野生型小鼠相比,MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟脂肪變性評分(圖2B)和膨脹評分(圖2C)***降低。
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