四、在體內和體外,NUPs的上調導致TDP-43/TBPH定位錯誤和聚集
為了檢測Nup上調對Tbph (Drosophila TDP-43)病理的影響,我們建立了一個位點特異性Nup62過表達(Nup62 OE)蠅線,并對內源性Tbph進行染色。在eGFP對照(以下稱為對照)表達的果蠅幼蟲VNC中,Tbph的分布以細胞核為主,而Nup62 OE幼蟲VNC***改變了Tbph的定位,出現細胞質聚集(圖4A)。定量分析顯示,與對照組相比,Nup62 OE果蠅幼蟲或成年大腦中斑點Tbph***增加(圖4B)。與對照組相比,Nup62 OE vnc的核Tbph強度***降低(圖4C)。此外,核細胞質(N/C)分割進一步證實,與對照組相比,Nup62 OE動物的Tbph N/C比值***降低(圖4D和E),表明Nup62的上調改變了Tbph在體內的亞細胞定位。 促進胰腺*的生長和轉移。分組比較科研省自然科學基金
一、腦損傷改變了果蠅的大腦蛋白質組,擾亂了NCT蛋白和Nup蛋白水平
為了研究創傷性腦損傷的機制,我們使用了一個具有良好特征的創傷性腦損傷果蠅模型,該模型顯示了強大的表型,如TDP-43同源物(Tbph)、p62、應激顆粒和泛素病理,以識別和研究創傷性腦損傷后大腦蛋白質組的變化(圖1A)。對暴露于重復TBI的三齡果蠅幼蟲大腦中的2000個蛋白質進行了無偏性蛋白質組學分析(w1118),發現361個蛋白質在創傷損傷后發生了***變化(p 0.05,學生t檢驗)?;诨虮倔w論(GO)的復雜網絡分析在BiNGO (Cytoscape 3)中對tbi相關腦蛋白質組與非tbi對照進行了關聯分析,確定了不同類別的改變蛋白,其中大多數上調(圖1B和C;圖1圖補充1A-E;補充文件1和3)。TBI后上調的比較高類別是微管細胞骨架、蛋白質折疊和蛋白酶體。此外,我們還鑒定了涉及**白復合體和剪接體的蛋白質。核孔復合體(NPC)和NCT通路的組成部分是tbi后上調的主要蛋白子集(圖1圖補充1F)。 北京炎癥因子科研英拜是您身邊的科研小助手。
A.29名兒童在進行異體造血干細胞移植前、移植時、移植后即刻以及后期隨訪時均進行了監測。監測患者的基線特征、臨床結果、免疫細胞計數以及炎癥和***標志物。表S1(附加文件1)詳細描述了患者特征。宿主免疫系統參數與腸道、口腔和鼻腔微生物群的縱向動力學相關,這些微生物群在指定的時間點進行了評估。
B.每個身體部位HSCT前、移植時和移植后的細菌α多樣性以log10變換后的y軸顯示。星號表示時間點間的中值逆Simpson指數存在***差異。C.相對于HSCT的時間點LDA分析。對于糞便樣本,HSCT后立即采集的樣本LDA評分為陽性。對于口腔和鼻腔樣本,在HSCT前和后期隨訪時間點樣本的LDA評分均為陽性
4)體外實驗表明,上調UCP1以減輕AKI期間的脂質積累,可通過影響炎癥和凋亡,***抑制疾病進展
越來越多的證據表明,在AKI中有明顯的脂質積累和UCP1的異常表達,并與腎損傷的嚴重程度有很強的相關性。為了確定脂質積累是否影響AKI期間的細胞功能,我們首先使用UCP1過表達慢病毒和UCP1激動劑CL316243構建AKI細胞脂質積累***模型。如圖4A所示,在AKI中上調UCP1***脂質積聚,導致腎小管損傷指數、NGAL***下調,說明UCP1***脂質積聚可***減輕模型細胞的損傷。鑒于炎癥和凋亡是AKI細胞損傷**重要和直接的原因,我們對上述細胞模型中的炎癥和凋亡標記物進行了量化。IL-1β、IL-6和TNF-α隨著UCP1的上調而***降低(圖4B-D)。在凋亡指標Bax和C-caspase3中也觀察到類似的趨勢,而Bcl-2升高(圖4E)。***,通過TUNEL熒光染色直接定量評估細胞凋亡,證實上調UCP1緩解AKI模型細胞的凋亡(圖4F)。 大黃酸導致嘌呤代謝正常化和腸道尿酸水平的降低。
二、腸道微生物群落動態變化
確定每個個體部位12個**豐富的科。HSCT后,在腸內第II期Lachnospiraceae的豐度減少,從檢查前的13%減少到第1周的4.7%,然后在第III期開始的第3個月恢復到27.5%(圖2A)。同時,腸球菌科在II期的擴張(檢查前:6.1%;第1周:22.8%)和第二階段的乳酸菌科(預檢:2%;第3個月后,第三階段分別減少到0.2%和0.6%(圖2A)。LDA在腸道中顯示了19個支系(共102個ASVs),這些支系在時間點上對樣品的分離效果比較好(圖2B)。兩個相當有鑒別能力且LDA系數為正的進化支系包括腸球菌科(Enterococcaceae)和乳酸桿菌科(Lactobacillaceae)的ASVs(圖2B)。從第3個月開始,它們的豐度再次下降到與預處理時間相當的水平(圖2C)。其中,ASV78的數量**多,觀察頻率比較高(圖2D),其16SrRNA部分基因序列與wexlerae序列相似性較高。另一項PCA分析也支持這些發現(圖2E)。腸球菌科(Enterococcaceae)在II期樣品中更為豐富,Lachnospiraceae和Ruminococcaceae在I期和III期樣品中更為豐富(圖2E)。 大黃酸可以改變腸道菌群組成。囊性纖維化科研實驗外包
英拜跟客戶形成產學研合作模式。分組比較科研省自然科學基金
創傷性腦損傷(TBI)是世界范圍內**常見的死亡和殘疾原因之一。事實上,創傷性腦損傷導致的繼發性損傷可導致長期的神經和神經精神后遺癥,包括神經退行性疾病,如肌萎縮性脊髓側索硬化癥(ALS)、阿爾茨海默病(AD)和帕金森病。TBI還與慢性創傷性腦病(CTE)的發展有關,CTE是一種與反復頭部創傷相關的進行性神經退行性綜合征。反復創傷患者(如CTE)的死后腦組織以及創傷性腦損傷動物模型顯示微管相關蛋白(TAU)和TAR DNA/RNA結合蛋白(TDP-43)病理變化。TDP-43病理是神經退行性變的標志,在~ 97%的ALS病例、~ 45%的額顳葉癡呆(FTD)病例和~ 60%的AD病例中均有TDP-43表現。盡管有證據表明TDP-43病理作為神經退行性變的生物標志物,但仍不清楚重復創傷如何促進TDP-43蛋白病。分組比較科研省自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗