再生胰腺中胰腺巨噬細(xì)胞的動(dòng)態(tài)轉(zhuǎn)錄組譜
為了進(jìn)一步了解AP恢復(fù)過(guò)程中巨噬細(xì)胞的表型和功能，分離出胰腺巨噬細(xì)胞用于RNA-seq分析。顯著性差異表達(dá)基因繪制熱圖。為了評(píng)估這些基因簇的功能，使用網(wǎng)絡(luò)工具DAVIDGeneOntology(GO)進(jìn)行了功能注釋分析。值得注意的是，在急性炎癥期（簇32，D1特征簇）高度表達(dá)的基因特別富集炎癥反應(yīng)和CCR2依賴(lài)性趨化性。簇25和27包含在ADM階段（第3天）高表達(dá)的基因，具有不同的表達(dá)模式和功能，表明該階段的巨噬細(xì)胞異質(zhì)性。例如，與ECM-受體相互作用和PI3K-AKT信號(hào)通路相關(guān)的基因在簇27中富集，而與細(xì)胞周期相關(guān)的基因在簇25中富集。 英拜專(zhuān)注高通量測(cè)序行業(yè)的整體服務(wù)。上海老化芯片科研
5）M1-Exos通過(guò)傳遞miR-155加重了EndoMT
為了研究外泌體miR-155在SCI后M1-Exos介導(dǎo)的BSCB破壞惡化中的作用，構(gòu)建miR-155過(guò)表達(dá)(miR-155OE)和敲低(miR-155KD)BMDMs，然后分離外泌體并處理bEnd.3細(xì)胞。如圖5A和B所示，miR-155OE-Exos組TEER值***降低，通透性***增加，而miR-155KD-Exos組則相反。加入miR-155OE-Exos后，ZO-1和Occludin的熒光強(qiáng)度明顯降低，而miR-155KD-Exos處理后，ZO-1和Occludin的表達(dá)***增強(qiáng)(圖5C和D)。此外，westernblot檢測(cè)TJs蛋白的表達(dá)，結(jié)果與上述討論的結(jié)果相似(圖5E)。miR-155OE-Exos可促進(jìn)細(xì)胞形態(tài)轉(zhuǎn)化，其分支更少，體細(xì)胞更長(zhǎng)。miR-155KD-Exos處理后的結(jié)果則相反(圖5F)。miR-155OE-Exos暴露后，I型膠原蛋白、III型膠原蛋白和α-SMA蛋白水平上調(diào)，CD31蛋白水平下調(diào)，而miR-155KD-Exos作用相反(圖5G)。以上結(jié)果表明，外泌體miR-155在促進(jìn)bEnd.3細(xì)胞的EndoMT中起著至關(guān)重要的作用。 重慶糖尿病科研英拜的實(shí)驗(yàn)室坐落在上海漕河涇園區(qū)浦江園區(qū)。
二、TBI破壞了NPC和Ran***1的分布，導(dǎo)致TBPH/NPC共聚集
使用鼻咽*標(biāo)記Mab414，它可以識(shí)別包括Nup62在內(nèi)的幾個(gè)Nups的FG結(jié)構(gòu)域，我們發(fā)現(xiàn)在非tbi控制的果蠅大腦中，核膜上有一個(gè)主要的同質(zhì)的環(huán)狀標(biāo)記。非腦外傷對(duì)照組的腹神經(jīng)索(VNC)鼻咽*染色呈均勻分布。相比之下，暴露于TBI的vnc核膜NPC染色不規(guī)則，顯示核形態(tài)紊亂。我們?cè)谀X外傷后觀察到核膜間隙和聚集(Mab414團(tuán)塊)的出現(xiàn)(圖2A)。TBI腦中Mab414染色異常的細(xì)胞百分比明顯高于非TBI對(duì)照(圖2B）。tbi暴露的vnc中Tbph和Mab414的核周和細(xì)胞質(zhì)共聚集，而對(duì)照大腦顯示很少或沒(méi)有共聚集(圖2C)。定量結(jié)果顯示，與對(duì)照組相比，tbi暴露的vnc中具有共聚集的Mab414 tbph陽(yáng)性細(xì)胞百分比***升高(圖2D)。
WTAP介導(dǎo)的HK2調(diào)控依賴(lài)于其m6A甲基化酶活性
m6A閱讀器IGF2BP2識(shí)別WTAP轉(zhuǎn)錄本中的m6A位點(diǎn)，以促進(jìn)其穩(wěn)定性。qPCR結(jié)果顯示，IGF2BP2缺陷細(xì)胞中HK2的轉(zhuǎn)錄水平***降低(圖6A)，mRNA穩(wěn)定性實(shí)驗(yàn)顯示HK2在IGF2BP2缺陷細(xì)胞中趨于不穩(wěn)定(圖6B)。pGL3-HK2-WT載體的熒光素酶活性通過(guò)抑制IGF2BP2而降低，而pGL3-HK2-MUT載體的熒光素酶活性則消失(圖6C)。因此，IGF2BP2與WTAP共同作用，影響DLBCL細(xì)胞中HK2mRNA的穩(wěn)定性和表達(dá)。此外，考慮到piRNA-30473在**發(fā)生和疾病進(jìn)展中的功能重要性，利用選擇性抑制劑靶向piRNA-30473/WTAP/HK2軸可能是***DLBCL的一種有前景的***策略(圖6D)。
結(jié)論：作者證明了piRNA-30473通過(guò)調(diào)節(jié)m6ARNA甲基化，從而觸發(fā)下游信號(hào)級(jí)聯(lián)而促進(jìn)DLBCL的**發(fā)生和不良預(yù)后。該研究強(qiáng)調(diào)了m6A修飾機(jī)制在DLBCL中的功能重要性，并通過(guò)揭示一個(gè)之前未被發(fā)現(xiàn)的DLBCL基因調(diào)控機(jī)制，為**發(fā)生的表觀遺傳機(jī)制提供了深刻的見(jiàn)解。 FOXO3A誘導(dǎo)的LINC00926限制乳腺瘤細(xì)胞的生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。
盡管轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在過(guò)去幾十年中發(fā)展迅速，但由于芯片和RNA-seq之間固有的可變性差異，對(duì)混合數(shù)據(jù)的綜合分析仍然具有挑戰(zhàn)性。本文提出了Rank-In來(lái)糾正兩種技術(shù)之間的非生物效應(yīng)，從而能夠自由混合數(shù)據(jù)以進(jìn)行整合分析。網(wǎng)站首頁(yè)如下，支持上傳用戶(hù)自己的芯片、轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。該網(wǎng)頁(yè)**終會(huì)給出調(diào)整后的矩陣、差異基因列表以及聚類(lèi)結(jié)果圖。
第一步：上傳表達(dá)文件
表達(dá)文件格式如下，需上傳***行為樣本名、***列為基因名的表達(dá)矩陣
轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)表達(dá)量可以使用FPKM、TPM或TMM；芯片數(shù)據(jù)使用基因表達(dá)強(qiáng)度；如果下載GEO數(shù)據(jù)，需要對(duì)探針注釋為基因，然后上傳注釋后的表達(dá)文件。
第二步：上傳分組文件
分組文件***列文樣本名，第二列為分組。“1”表示來(lái)自正常組織的樣本，“2”表示**亞型1的樣本，“3”表示**亞型2的樣本，依此類(lèi)推 英拜在全國(guó)各省會(huì)城市均有自己的**客戶(hù)。淋巴水腫鼠模型科研中標(biāo)率高
思路是您的操作我們來(lái)做。上海老化芯片科研
采用半定量方法對(duì)γH2AX免疫反應(yīng)性進(jìn)行評(píng)分(表1)。Pten+/+;MMTVneu**一般很少表達(dá)γH2AX(圖1B)。所有Pten398A/398A;MMTVneu樣本均為γH2AX強(qiáng)陽(yáng)性，表明更高水平的基因組不穩(wěn)定性(圖1B, C)。我們通過(guò)對(duì)**樣本的western blot分析證實(shí)了這些結(jié)果，結(jié)果顯示Pten398A/398A;MMTVneu**比Pten+/+;MMTVneu**表達(dá)更高水平的γH2AX(圖1D, E)。通過(guò)對(duì)Ki-67進(jìn)行免疫組化來(lái)評(píng)估**的增殖指數(shù)，Ki-67是常規(guī)病理中***使用的標(biāo)志物。兩種基因型Pten+/+**的Ki67免疫反應(yīng)性無(wú)***差異;MMTVneu(補(bǔ)充圖2C, D)。總之，Pten398A突變加速mmtv神經(jīng)驅(qū)動(dòng)的**發(fā)生，這與更高的基因組不穩(wěn)定性有關(guān)，但在細(xì)胞增殖中沒(méi)有明顯的改變。上海老化芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過(guò)英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái)，提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫(xiě)SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開(kāi)發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開(kāi)放參觀，客戶(hù)可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
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2.標(biāo)書(shū)申請(qǐng)：提供標(biāo)書(shū)課題設(shè)計(jì)、撰寫(xiě)，標(biāo)書(shū)部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開(kāi)展，設(shè)計(jì)的標(biāo)書(shū)均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序：轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片：信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測(cè)序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過(guò)表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測(cè)，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)