我們鑒定出了幾個可能與LINC00926相互作用的蛋白,包括兩個E3連接酶,STUB1和E6AP(圖4F)。免疫印跡進一步證實,只有STUB1與LINC00926相互作用,而E6AP則沒有(圖4G)。此外,RIP分析也表明,PGK1和STUB1免疫沉淀中,LINC00926***富集(圖4H)。此外,LINC00926增強了STUB1介導的PGK1泛素化(圖4I)。敲低STUB1**減弱了LINC00926對PGK1泛素化的影響(圖4J)。這些數據表明,STUB1在LINC00926調控PGK1泛素化過程中起著關鍵作用。與LINC00926對STUB1介導的PGK1泛素化的影響一致,LINC00926增加了STUB1和PGK1之間的相互作用(圖4K)。而敲低STUB1**減弱了LINC00926對PGK1降解的影響(圖4L)。英拜提供一年三節的購物卡津貼。深圳免疫應答科研
4)Pex來源的CD44v6對于HSCs的***是必要的,但不是充分的
我們之前的研究揭示了CD44v6參與調控PDAC細胞的IGF-1通路。因此,我們首先驗證了CD44v6在外泌體中的表達,發現CD44v6在Pex中的表達水平明顯高于Npex(圖5A)。為了研究CD44v6是否能夠被傳遞到受體細胞中,我們采用蛋白合成抑制劑環己酰亞胺檢測加入Pex后CD44v6的蛋白水平。westernblot分析顯示,加入Pex后,HSCs中CD44v6的表達水平明顯增加(圖5B)。與Npex-孵育的細胞相比,CD44v6的表達水平保持不變(圖5B)。我們還進行了免疫熒光分析,檢測出HSC膜中CD44v6與Pan-cadherin共定位(圖5C)。這些結果表明,Pex可將CD44v6輸送到HSC膜 熱休克蛋白科研服務兩年英拜專注高通量測序行業的整體服務。
4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取
Xc-系統是一個胱氨酸/谷氨酸逆向轉運蛋白,捕獲細胞外的胱氨酸,用于谷胱甘肽的合成,以交換谷氨酸的釋放。在圖3中,被抑制的Xc-系統功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關,然而YTHDC2如何調節Xc-系統依然未知。文獻報道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發現,SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負調控(圖4A、B)。在小鼠中,與KPE和KPYΔYTH小鼠相比,KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達下調(圖4C、D)。這證明YTH結構域是YTHDC2抑制SLC7A11表達的前提。
再生胰腺中胰腺巨噬細胞的動態轉錄組譜
為了進一步了解 AP 恢復過程中巨噬細胞的表型和功能,分離出胰腺巨噬細胞用于 RNA-seq 分析。顯著性差異表達基因繪制熱圖。為了評估這些基因簇的功能,使用網絡工具 DAVID Gene Ontology (GO) 進行了功能注釋分析。值得注意的是,在急性炎癥期(簇32,D1 特征簇)高度表達的基因特別富集炎癥反應和 CCR2 依賴性趨化性。簇 25 和 27 包含在 ADM 階段(第 3 天)高表達的基因,具有不同的表達模式和功能,表明該階段的巨噬細胞異質性。例如,與ECM-受體相互作用和PI3K-AKT信號通路相關的基因在簇27中富集,而與細胞周期相關的基因在簇25中富集。 m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。
circACTN4 在 BC 組織和細胞中高度表達并與臨床病理特征相關
為探討circACTN4的表達及其臨床意義,qRT-PCR檢測80對BC組織及鄰近非**組織中circACTN4的表達。circACTN4在BC組織中的表達顯著高于配對的*旁組織。qRT-PCR檢測20對BC和*旁組織中線性ACTN4的表達,數據顯示線性ACTN4在BC組織中高表達。Pearson相關分析顯示circACTN4的水平與BC組織中線性ACTN4的表達呈正相關。結果表明 circACTN4 和 ACTN4 的共過表達協同促進了乳腺*的進展。RO曲線分析,circACTN4的AUC(曲線下面積)為0.719,診斷特異性和敏感性分別為70%和70。circACTN4 在 BC 細胞中的表達顯著高于正常乳腺上皮細胞 MCF-10A。 大黃酸處理對正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應。生長因子科研國家自然科學基金
Caspase-11介導的肝細胞焦亡促進非酒精性脂肪性肝炎的進展。深圳免疫應答科研
3)LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解
由于PGK1是一種關鍵的糖酵解酶,而LINC00926被鑒定為負調控PGK1的lncRNA,我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導的乳腺*細胞增殖抑制中發揮作用。我們測試了LINC00926對葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成的調節作用。結果表明,LINC00926降低了葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成(圖3A)。在LINC00926轉染的細胞中,PGK1的表達逆轉了這些作用。LINC00926還顯示出細胞外酸化率下降(圖3B和3C)。PGK1在LINC00926轉染的細胞中重新表達挽救了這些效果。在PGK1敲低的MDA-MB-231或MCF-7細胞中敲低LINC00926對糖酵解表型沒有影響(圖3D-3F),表明LINC00926通過PGK1抑制糖酵解表型。綜上所述,LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解。 深圳免疫應答科研
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗