成都心血管疾病芯片科研

四、Multimodal分析突出了肥大的上行肢體的細(xì)胞異質(zhì)性

為了確定我們是否能夠檢測(cè)出具有可變claudin表達(dá)模式的細(xì)胞亞群，在snRNA-seq數(shù)據(jù)集的umap圖上劃分三個(gè)亞種群(TAL1,TAL2和ATL)。ATL，上升細(xì)肢。顯示了TAL各亞群體中富集基因的基因表達(dá)模式。一組細(xì)胞(SLC12A1+UMOD+)表達(dá)粗升肢標(biāo)記(CLDN16、KCNJ10和PTH1R):TAL1，另一組細(xì)胞表達(dá)另一組TAL特異性標(biāo)記，如CLDN10:TAL2(圖4b)。第三組細(xì)胞根據(jù)之前發(fā)表的標(biāo)記的表達(dá)被確定為髓袢升支粗段(ATL)。我們使用免疫組化方法驗(yàn)證PTH1R和KCNJ10在UMOD+SLC12A1+細(xì)胞亞群中表達(dá)(圖4c)。在snATAC-seq數(shù)據(jù)集的umap圖上進(jìn)行TAL的亞聚類，劃分三個(gè)亞種群(TAL1、TAL2和ATL)(圖4d)。點(diǎn)圖顯示每個(gè)TAL亞種群中富集的基因的活性模式(圖4e)。斑點(diǎn)的直徑對(duì)應(yīng)于檢測(cè)到的基因活性的細(xì)胞比例，斑點(diǎn)的密度對(duì)應(yīng)于相對(duì)于所有細(xì)胞類型的平均基因活性。Umap顯示CLDN10、CLDN16、S100A2或UMOD(左)的基因活性。TAL1和TAL2之間的chromVAR差異***轉(zhuǎn)錄因子基序(圖4f)。使用SeuratFindMarkers功能來識(shí)別區(qū)分厚升肢細(xì)胞群的DAR，并使用SeuratFindMotifs功能對(duì)這些DAR進(jìn)行轉(zhuǎn)錄因子motif富集(圖4g)。 METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長(zhǎng)和轉(zhuǎn)移。成都心血管疾病芯片科研

女性生殖系統(tǒng)的疾病即為婦科疾病，包括外陰疾病、陰道疾病、子宮疾病、輸卵管疾病、卵巢疾病等。婦科疾病是女性常見病、多發(fā)病。但由于許多人對(duì)婦科疾病缺乏應(yīng)有的認(rèn)識(shí)，缺乏對(duì)身體的保健，加之各種不良生活習(xí)慣等，使生理健康每況愈下，導(dǎo)致一些女性疾病纏身，且久治不愈，給正常的生活、工作帶來極大的不便。

英拜生物推出的婦科疾病風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估檢測(cè)通過風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估模型來評(píng)估個(gè)體疾病的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)，其意義在于趨利避害，用于進(jìn)行個(gè)性化健康管理：個(gè)性化保健、個(gè)性化用藥、個(gè)性化預(yù)防、個(gè)性化體檢及采取個(gè)性化的行為生活方式等，**終達(dá)到遠(yuǎn)離婦科疾病的目的。 成都細(xì)胞凋亡甲基化芯片科研Th1/Th2細(xì)胞失衡也是結(jié)腸炎的一個(gè)重要特征。

小泛素修飾(SUMO)結(jié)合稱為SUMO修飾，其作為生物活性分類的誘導(dǎo)劑分子進(jìn)入細(xì)胞外囊泡(EVs)，觸發(fā)淋巴管生成，進(jìn)一步驅(qū)動(dòng)**淋巴結(jié)(LN)轉(zhuǎn)移，但確切的機(jī)制仍不清楚。本研究發(fā)現(xiàn)，SUMOylation促進(jìn)細(xì)胞外囊泡介導(dǎo)的lncRNA ELNAT1的傳遞和膀胱*的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移。該文于2021年4月發(fā)表在《The Journal of Clinical Investigation》IF: 14.808。

1.SUMOylation參與膀胱*的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移

為了探討SUMOylation在膀胱*（BCa）的淋巴結(jié)（LN）轉(zhuǎn)移中的作用，作者基于淋巴*與TCGA數(shù)據(jù)庫(kù)中比較SUMOylation的表達(dá)譜，發(fā)現(xiàn)BCas中UBC9的高表達(dá)，同時(shí)生成分析顯示，與UBC9表達(dá)較低的患者相比，UBC9表達(dá)較高的患者總生存率（OS）和無病生存期（DFS）較低（Figure1A-E）。為了證明UBC9在LN轉(zhuǎn)移中的作用，作者通過242例的BCas患者樣本，發(fā)現(xiàn)UBC9在LN轉(zhuǎn)移過程中高表達(dá)（Figure1F）。

2021年3月，劍橋大學(xué)血液學(xué)系A(chǔ)naCvejic教授團(tuán)隊(duì)?wèi)?yīng)用scRNA-seq和scATAC-seq技術(shù)對(duì)來自胚胎肝臟和骨髓的8,000多個(gè)免疫表型HSPCs進(jìn)行綜合分析，探索人類發(fā)育過程中造血功能的調(diào)節(jié)機(jī)制。該項(xiàng)工作以“Integrativesingle-cellRNA-seqandATAC-seqanalysisofhumandevelopmentalhematopoiesis”為題發(fā)表在CellStemCell上。在胚胎發(fā)育過程中，造血干細(xì)胞(HSCs)需要快速分化為成熟的血細(xì)胞。我們目前對(duì)胎兒造血干細(xì)胞和祖細(xì)胞(HSPCs)的認(rèn)識(shí)主要是通過小鼠和體外模型系統(tǒng)取得的。已有研究表明，胎兒造血過程包括發(fā)育過程中不同***上罕見造血干細(xì)胞的分化、遷移和分化的幾個(gè)**波。在人類中，**終的造血功能開始于懷孕27天后，造血干細(xì)胞出現(xiàn)在造血集群的背主動(dòng)脈內(nèi)。細(xì)菌可能是導(dǎo)致小鼠腸道尿酸降低的主要原因。

9.阻斷SUMOylation抑制EVs介導(dǎo)的ELNAT1誘導(dǎo)的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移

用si-NC或si-UBC9#1轉(zhuǎn)染的對(duì)照或ELNAT1過表達(dá)UM-UC-3細(xì)胞分泌的EVs處理HLECs，結(jié)果顯示過表達(dá)ELNAT1***促進(jìn)了體外BCa細(xì)胞分泌的EVs誘導(dǎo)淋巴血管生成，而沉默UBC9逆轉(zhuǎn)了這一作用（Figure9A-C）。IVIS證明UM-UC-3-EVELNAT1增強(qiáng)了體內(nèi)腘窩淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移，而沉默UBC9抑制了這種作用（Figure9D,E）。UM-UC-3-EVELNAT1+siUBC9#1組的腘窩LNs體積比UM-UC-3-EVELNAT1組小（Figure9F）。與UM-UC-3-EVVector組相比，UM-UC-3-EVELNAT1增加了小鼠足底**的淋巴管數(shù)量，而下調(diào)UBC9的表達(dá)導(dǎo)致EVs介導(dǎo)的ELNAT1誘導(dǎo)的淋巴管數(shù)量逐漸減少（Figure9G,H）。此外，UM-UC-3-EVELNAT1+si-UBC9#1組的LN生成時(shí)間長(zhǎng)于UM-UC-3-EVELNAT1組（Figure9I）。綜上所述，這些結(jié)果表明UBC9誘導(dǎo)的SUMOylation抑制EVs介導(dǎo)的ELNAT1誘導(dǎo)的BCa淋巴管生成和LN轉(zhuǎn)移。 英拜生物提供生物科學(xué)內(nèi)的專業(yè)的技術(shù)咨詢，技術(shù)合作。浙江通路發(fā)現(xiàn)者科研

英拜在全國(guó)各省會(huì)城市均有自己的**客戶。成都心血管疾病芯片科研

8.EVs介導(dǎo)的ELNAT1上調(diào)HLECs中SOX18的表達(dá)

qRT-PCR分析UM-UC-3-EV1載體或UM-UC-3-EVELNAT1處理的HLECs中淋巴管生成相關(guān)基因的表達(dá)，結(jié)果顯示SRY-box轉(zhuǎn)錄因子18（SOX18）是**明顯的與EVs介導(dǎo)的ELNAT1表達(dá)正相關(guān)的基因（Figure8A,B）。此外，ChIRP分析表明EVs介導(dǎo)的ELNAT1與HLECs中SOX18啟動(dòng)子的771~786bp（p4）直接相互作用（Figure8C,D）。SOX18-p4區(qū)域的突變降低了EVs介導(dǎo)的ELNAT1誘導(dǎo)的熒光素酶活性（Figure8E,F），表明SOX18-p4對(duì)于EVs介導(dǎo)的ELNAT1誘導(dǎo)HLECs中SOX18的上調(diào)至關(guān)重要。hnRNPA1和H3K4me3在SOX18啟動(dòng)子上的富集與EVs介導(dǎo)的ELNAT1表達(dá)***相關(guān)（Figure8G,J）。EVs介導(dǎo)的ELNAT1過表達(dá)增強(qiáng)了HLECs的管形成和遷移能力，而干擾SOX18則HLECs的管形成和遷移能力受損（Figure8K,M），表明SOX18是EVs介導(dǎo)的ELNAT1驅(qū)動(dòng)體外BCa淋巴管生成所必需的。綜上所述，這些結(jié)果表明，EVs介導(dǎo)的ELNAT1通過轉(zhuǎn)錄上調(diào)HLECs中SOX18的表達(dá)來促進(jìn)BCa淋巴管生成。 成都心血管疾病芯片科研

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