異丁醇科研地區(qū)科學(xué)基金

來源: 發(fā)布時間:2021-10-22

肺*是**常被診斷的**之一,也是導(dǎo)致**死亡的主要原因,非小細(xì)胞肺*(NSCLC)約占肺*病例的85%。環(huán)狀RNA(circRNA)是一類共價閉合的單鏈RNA,與**的發(fā)展有關(guān)。***我們來看一篇發(fā)表在Nature Communications期刊的一篇文章,題名為:circNDUFB2 inhibits non-small cell lung cancer progression via destabilizing IGF2BPs and activating anti-tumor immunity。

circNDUFB2在NSCLC中被下調(diào)

通過circRNA芯片分析了三對NSCLC樣品中circRNA的表達(dá)譜,總共鑒定出109個circRNA失調(diào),33個上調(diào),76個下調(diào)。qRT-PCR驗證52個配對NSCLC樣品中**差異circRNA的表達(dá)。circNDUFB2是**顯著下調(diào)的circRNA。臨床分析發(fā)現(xiàn)circNDUFB2高表達(dá)與NSCLC患者的**大小、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和分期呈負(fù)相關(guān)。結(jié)果表明,circNDUFB2在NSCLC中經(jīng)常被下調(diào),并且與NSCLC的惡性特征呈負(fù)相關(guān)。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產(chǎn)生,長度為249nt。circNDUFB2可由發(fā)散引物擴(kuò)增,收斂引物不能擴(kuò)增。核酸酶消化證實circNDUFB2具有閉環(huán)結(jié)構(gòu)。放線菌素D處理表明,與NDUFB2mRNA相比,circNDUFB2是穩(wěn)定的。核質(zhì)分離PCR以及熒光原位雜交(FISH)顯示circNDUFB2主要定位于細(xì)胞質(zhì)中。這些結(jié)果表明circNDUFB2是一個circRNA。 專注于生命科學(xué)內(nèi)的前沿研究。異丁醇科研地區(qū)科學(xué)基金

二、腸道微生物群落動態(tài)變化

確定每個個體部位12個**豐富的科。HSCT后,在腸內(nèi)第II期Lachnospiraceae的豐度減少,從檢查前的13%減少到第1周的4.7%,然后在第III期開始的第3個月恢復(fù)到27.5%(圖2A)。同時,腸球菌科在II期的擴(kuò)張(檢查前:6.1%;第1周:22.8%)和第二階段的乳酸菌科(預(yù)檢:2%;第3個月后,第三階段分別減少到0.2%和0.6%(圖2A)。LDA在腸道中顯示了19個支系(共102個ASVs),這些支系在時間點上對樣品的分離效果比較好(圖2B)。兩個相當(dāng)有鑒別能力且LDA系數(shù)為正的進(jìn)化支系包括腸球菌科(Enterococcaceae)和乳酸桿菌科(Lactobacillaceae)的ASVs(圖2B)。從第3個月開始,它們的豐度再次下降到與預(yù)處理時間相當(dāng)?shù)乃?圖2C)。其中,ASV78的數(shù)量**多,觀察頻率比較高(圖2D),其16SrRNA部分基因序列與wexlerae序列相似性較高。另一項PCA分析也支持這些發(fā)現(xiàn)(圖2E)。腸球菌科(Enterococcaceae)在II期樣品中更為豐富,Lachnospiraceae和Ruminococcaceae在I期和III期樣品中更為豐富(圖2E)。 生理節(jié)律芯片科研整體服務(wù)英拜的員工福利待遇很好。

6、**來源外泌體miR-208b影響體內(nèi)化療效果和**生長

隨后作者探究了**來源外泌體miR-208b體內(nèi)對化療效果和**生長的影響。用慢病毒轉(zhuǎn)染CT26細(xì)胞產(chǎn)生miR-208b過表達(dá)和miR-208b敲低細(xì)胞系。動物實驗設(shè)計示意圖如圖7A所示,實驗采用6組(每組10只小鼠),其中3組使用奧沙利鉑,BALB/c小鼠植入CT26細(xì)胞,建立**植入模型。如圖7B-7D所示,miR-208b-OE組**生長速度較快,而中miR-208-KD組**生長明顯慢于對照組。從各組小鼠中分離出外周血CD4+T細(xì)胞,結(jié)果顯示miR-208b-OE組中PDCD4的***下調(diào),miR-208-KD組的結(jié)果則相反(圖7E和7F)。然而,在PDCD4mRNA水平上沒有觀察到差異(圖7G)。從血清中分離出外泌體,檢測miR-208b水平(圖7H)。如預(yù)期的,miR-208b在miR-208b-OE組中***升高,而miR-208b-KD組中miR-208b水平下降(圖7I)。這些結(jié)果表明,**分泌的miR-208b在體內(nèi)可以充分地傳遞到CD4+T細(xì)胞中,抑制PDCD4的表達(dá)。此外,這種現(xiàn)象在奧沙利鉑***組更加***(miR-208b-OE+OXA和miR-208b-KD+OXA)。

檢測TYRO3基因拷貝數(shù)與細(xì)胞毒性T細(xì)胞抗**活性的相關(guān)性,CD8+T細(xì)胞水平與高表達(dá)TYRO3基因的患者的生存期延長無關(guān),但確實介導(dǎo)了低TYRO3基因拷貝數(shù)患者的生存期延長,表明TYRO3降低細(xì)胞毒性T細(xì)胞抗**作用的觀點。為進(jìn)一步確定TYRO3和抗PD-1***結(jié)果之間的相關(guān)性,分析接受抗PD-1***的黑色素瘤患者RNA-Seq數(shù)據(jù)中TYRO3的表達(dá),發(fā)現(xiàn)耐藥**患者的TYRO3表達(dá)水平***高于**有反應(yīng)的患者。Westernblot分析也驗證了TYRO3,p-TYRO3在4T1-R克隆中的表達(dá)增強(qiáng),說明TYRO3對配體刺激有反應(yīng)。為進(jìn)一步確定TYRO3和抗PD-1/PD-L1耐藥性在各種**類型中是否普遍相關(guān),我們研究了29例繼續(xù)接受抗PD-1/PD-L1***患者的***結(jié)果。抗PD-1/PD-L1***耐藥患者的TYRO3表達(dá)水平高于對***有反應(yīng)的患者。綜上所述,患者**組織中TYRO3的高表達(dá)和磷酸化與抗PD-1/PD-L1***的耐藥性相關(guān)。英拜注重客戶的隱私。

1)AKI伴有明顯的脂質(zhì)積累,并與腎損傷的嚴(yán)重程度高度正相關(guān)根據(jù)脂質(zhì)代謝組學(xué)分析結(jié)果,我們發(fā)現(xiàn)AKI組織中各類甘油三酯(TGs)含量***增加(圖1A)。考慮到AKI中的脂質(zhì)積累,我們進(jìn)行實驗來確定其臨床意義。我們對不同嚴(yán)重程度的AKI動物標(biāo)本進(jìn)行油紅O染色。結(jié)果顯示,隨著疾病進(jìn)展的延長,小鼠腎組織脂質(zhì)沉積逐漸增加(圖1B)。在體外也發(fā)現(xiàn)了類似的結(jié)果,即隨著細(xì)胞損傷的嚴(yán)重程度,脂質(zhì)積累的程度增加(圖1C)。這些結(jié)果說明AKI中的脂質(zhì)積累與疾病的嚴(yán)重程度呈正相關(guān)。英拜生物您隨身的科研小助手。重慶染色質(zhì)科研

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4、hnRNPA2B1在外泌體miR-934向巨噬細(xì)胞轉(zhuǎn)移中發(fā)揮作用

據(jù)報道,外泌體RNA的分泌需要一種特定的RNA結(jié)合蛋白來轉(zhuǎn)運。通過RNApull-down分析和質(zhì)譜分析,鑒定了三種可能參與miR-934轉(zhuǎn)運的RNA結(jié)合蛋白,并發(fā)現(xiàn)敲除hnRNPA2B1可以降低外泌體miR-934的表達(dá)(Fig.4a,b)。hnRNPA2B1是一種RNA結(jié)合蛋白,通過與特定基序GGAG/CCCU結(jié)合,參與miRNAs的運輸和轉(zhuǎn)錄后調(diào)控。特別是,由于miR-934序列中有兩個GGAG基序,我們推測hnRNPA2B1可能通過與GGAG序列結(jié)合,介導(dǎo)miR-934包裝成外泌體的過程。此外,miRNApull-down分析顯示,在細(xì)胞質(zhì)和外泌體中,miR-934和hnRNPA2B1之間存在***的結(jié)合關(guān)系,然而,突變miR-934的結(jié)合序列(GGAG)可削弱這種結(jié)合(Fig.4c)。RNA免疫沉淀分析進(jìn)一步證明,無論是在CRC細(xì)胞及其外泌體裂解物中,miR-934在anti-hnrnpa2b1抗體組中比在anti-IgG抗體組中更***富集(Fig.4d)。此外,敲除hnRNPA2B1可以抑制外泌體miR-934從HCT8和LoVo細(xì)胞轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞的過程(Fig.4e)。因此,這些結(jié)果證實hnRNPA2B1可以通過與miR-934的GGAG序列結(jié)合,介導(dǎo)miR-934包裝到CRC細(xì)胞外泌體中,并將外泌體miR-934轉(zhuǎn)移到巨噬細(xì)胞中。 異丁醇科研地區(qū)科學(xué)基金

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進(jìn)度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。

3.提供熱點**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究

4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗

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