circACTN4的表達與年齡(P ?= 0.036)、T(P ?= 0.001)、N(P ?= 0.001)和TNM分期(P < 0.001)呈正相關,但與分級無關。利用ISH檢測包含240個 BC組織的組織芯片確定circACTN4的表達。Kaplan-Meier生存分析顯示,circACTN4高表達患者的總生存期比circACTN4低表達患者的總生存期短。circACTN4的表達與T分期、N分期和TNM分期呈正相關。Cox 比例風險模型評估 circACTN4 的預后價值。結果顯示circACTN4的過表達是BC患者預后不良的**預測因子(HR = 4.566,P <0.001)。circACTN4 可以發揮致*作用,circACTN4 的高表達可以預測 BC 患者的不良預后。
3)LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解
由于PGK1是一種關鍵的糖酵解酶,而LINC00926被鑒定為負調控PGK1的lncRNA,我們想知道需氧糖酵解是否在LINC00926介導的乳腺*細胞增殖抑制中發揮作用。我們測試了LINC00926對葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成的調節作用。結果表明,LINC00926降低了葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成(圖3A)。在LINC00926轉染的細胞中,PGK1的表達逆轉了這些作用。LINC00926還顯示出細胞外酸化率下降(圖3B和3C)。PGK1在LINC00926轉染的細胞中重新表達挽救了這些效果。在PGK1敲低的MDA-MB-231或MCF-7細胞中敲低LINC00926對糖酵解表型沒有影響(圖3D-3F),表明LINC00926通過PGK1抑制糖酵解表型。綜上所述,LINC00926通過抑制乳腺*細胞中PGK1的表達來抑制糖酵解。 沈陽胃腸道功能障礙科研Th1/Th2細胞失衡也是結腸炎的一個重要特征。
我們進一步的研究表明,circPDE4B調控RIC8A蛋白水平,而不是mRNA水平或穩定性(圖3G-I)。我們還阻斷了RIC8A蛋白的合成,并觀察到sh-陰性對照(NC)和sh-circPDE4B 的HCs之間的RIC8A蛋白半衰期有明顯差異(圖3J),說明circPDE4B降低了RIC8A蛋白的穩定性。經PS341處理后,RIC8A在circPDE4B過表達和下調細胞中均未發生變化(圖3K,L),表明circPDE4B通過蛋白酶體活性調節RIC8A。無論內源性還是外源性RIC8A, RIC8A的多泛素化在circPDE4B耗盡后均下降,在過表達circPDE4B后則上升(圖3O)。綜上所述,circPDE4B翻譯后影響蛋白酶體介導的RIC8A的降解和周轉。
二、npm1突變AML患者聚集的分子基礎
CDH2是鈣粘蛋白家族的一員,被認為是決定干細胞命運的調節因子15。類似地,G蛋白偶聯受體12(GPR12)在原始亞型中上調,已知在干細胞維持和**干細胞的體細胞重編程中發揮作用。MyoD家族抑制劑(MDFI)在原始亞型中表達增加,據報道它是WNT信號通路的調節因子,只在造血干細胞祖細胞中表達。鋅指蛋白521(ZNF521)是一種轉錄因子,其在人類白血病細胞系中被敲低可以減少增殖但在原始亞型中卻有***的高表達。CD163是一種免疫調節劑,是巨噬細胞清清體受體家族的成員,已知在單核細胞系的AML細胞中表達。在committedcluster中其他基因的高表達包括免疫相關基因,如C1QA,CD14和MARCO。msl1基因,一種已知的白血病干細胞增殖抑制因子,也在committedcluster中高表達。我們通過qPCR驗證了關鍵基因的差異表達(圖2B)。使用基因**富集分析(GSEA),在committed亞型中,免疫反應通路如干擾素-γ介導的信號通路、GPCR信號通路和toll樣受體(TLR)信號通路上調(圖2C,D,SupplementaryFigs.16,18,與FLT3-ITD和DNMT3A突變的弱相關性一致。 英拜提供生命科學內的一體化服務。
進一步使用E8聚類分析顯示,這些暴露于慢性d-flow的ec向免疫細胞樣類型(EndICLT)轉變,但沒有達到完全分化的免疫細胞狀態(圖3C和S3)。圖3D顯示了EC簇中EndMT、Tagln、Acta2、Cnn1和Snai1的四個標記物,分別**了s流(E2)、急性d流(E6)和慢性d流(E8)染色質可及性的變化。與s-流(E2)和急性d-流(E6)相比,慢性d-流在E8的啟動子區域(箭頭)增加了這些基因的可及性。從scRNA-seq數據的小提琴圖中可以看出,E8中相應基因的表達量增加,進一步證實了這一結果(圖3E)。英拜的高通量測序服務質量。廣州熱圖科研
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肺腺* (LUAD) 是**常見的非小細胞肺*類型。然而,LUAD **發生的潛在機制在很大程度上是未知的。N6-甲基腺苷 (m6A) RNA 甲基化在各種人類**中的關鍵作用,包括肺*。***來講一篇關于m6A與肺*的文章,題名為:The m 6 A reader YTHDC2 inhibits lung adenocarcinoma tumorigenesis by suppressing SLC7A11-dependent antioxidant function(IF=11.79)。YTHDC2的抑制與LUAD中的**進展有關
為了評估m6A閱讀器在肺*中的表達譜,通過 GEPIA 數據庫分析了已知的閱讀器,包括 YTHDF1/2/3、YTHDC1/2、HNRNPA2B1、HNRNPC/G、eIF3A、FMR1 和 IGF2BP1/2。其中,與正常肺相比,LUAD 和 LUSC 中只有 YTHDC2 下調。然而,IGF2BP2 在 LUAD 和 LUSC 中差異表達。Oncomine 數據庫還顯示 YTHDC2 在 LUAD 中通常被下調。Kaplan-Meier 圖的分析進一步表明,較低的 YTHDC2 與 LUAD 中較差的總體生存率相關。這些結果使我們研究了 YTHDC2 在 LUAD 中的作用。 湖北上皮細胞科研
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