2、HMH-exo增強低轉移性HCC細胞系的轉移潛力
為了探究HCC轉移時外泌體在細胞與細胞串擾中的可能作用,作者實驗HMH-exo預處理低轉移性的HCC細胞系。結果發現,與LMH-exo或者PBS預處理組相比,HMH-exo***增強了低轉移性HCC細胞系的轉移能力;隨后作者使用低轉移性HCC細胞系構建了體內原位異種移植瘤模型,成瘤后使用外泌體***6周,***檢測肝臟**和肺轉移,結果顯示與其它組相比,HMH-exo組的肝臟**更大,肺轉移結節更多。(圖2)。這些結果表明HMH-exo可以在體內外增強低轉移性HCC細胞的轉移能力。 結腸炎也會導致促炎細胞因子或趨化因子的增加。湖北ampk信號通路芯片科研
對snATAC-seq數據集使用97%置信閾值對細胞類型分配進行過濾,以去除異型雙重體。通過標簽轉移獲得的snATAC-seq細胞類型預測(圖1d)與無監督簇的編輯注釋(圖1e, f)的比較表明,所有主要的細胞類型都存在于這兩個數據集中,并且在檢測和分配細胞身份方面,snATAC-seq與snRNA-seq具有可比性(補充圖3)。使用基于基因活性的細胞類型分配進行下游分析,這是通過對snatc -seq數據集的無監督聚類獲得的。有趣的是,snATAC-seq能夠檢測到近端小管簇內的兩個亞群,這可能**近端曲小管(圖1e, PCT)和近端直小管(圖1e, PST)。PCT顯示編碼SGLT2的SLC5A2具有更強的染色質可及性;而PST在編碼SGLT1的SLC5A1(圖1f,補充圖4)中表現出更強的可達性。SGLT2在近端小管S1和S2段重新吸收葡萄糖,SGLT1位于S3。鐵死亡損傷科研服務兩年m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。
二、染色質的可及性明確了細胞的類型
我們使用R包Signac來研究不同細胞類型間染色質可及性的差異。細胞類型可以根據差異開放區域(DARs)是開放的還是封閉的來區分(Fig.2a)。約20%(平均比例=0.2030.04)的DAR與各自細胞類型中的差異表達基因密切相關(補充表4)。例如,LRP2是一個表達在近端小管的譜系特異性基因,該區域的覆蓋圖顯示其啟動子和基因體內ATAC峰的數量和幅度增加(圖2a)。事實上,大部分DAR都位于距離**近的轉錄起始位點3kb內的啟動子區域(圖2b,補充圖7)。第二個**常見的位置是內含子,DAR在不同細胞類型中的分布相對保守(圖2c)。
6)FOXO3A通過調控乳腺*細胞中LINC00926的表達抑制增殖、遷移和侵襲,抑制糖酵解
我們研究了FOXO3A是否通過LINC00926調節這些效應。細胞增殖和集落形成分析顯示FOXO3A過表達抑制了乳腺*細胞的生長,而LINC00926敲低則促進了細胞的生長(圖6A和6B)。重要的是,下調LINC00926***減弱了FOXO3A調控細胞增殖的能力,表明FOXO3A主要通過表達LINC00926來降低乳腺*細胞的增殖。接下來,我們通過LINC00926檢測FOXO3A是否抑制細胞遷移、侵襲和糖酵解。如預期,FOXO3A減少了乳腺*細胞的遷移和侵襲(圖6C和6D)。敲除LINC00926**削弱了FOXO3A抑制細胞遷移和侵襲的能力。FOXO3A過表達抑制葡萄糖攝取、乳酸生成和ATP生成,降低ECAR和增加OCR。然而,敲除LINC00926極大地減弱了FOXO3A調節細胞遷移、侵襲和糖酵解的能力(圖6C-6G)。綜上所述,FOXO3A抑制乳腺*細胞的遷移和侵襲,以及糖酵解主要依賴于LINC00926。 英拜在全國各省會城市均有自己的**客戶。
來自4個不同腺泡性LUAD患者的PDX模型被給予XC-系統抑制劑erastin(PKE)和多激酶抑制劑索拉非尼(sorafenib)。與DMSO***的對照組相比,PKE和sorafenib給藥時觀察到***的**消退(圖7G-J)。此外,PKE和sorafenib給藥小鼠也導致**中MDA和4-HNE的***增加(圖7K和L),提示誘導的脂質過氧化可能是抑制腺泡LUADs**發生的結果。圖7M顯示,與*旁組織相比,**組織中MDA和YTHDC2表達量都降低,而SLC7A11mRNA和蛋白水平都升高,證明在LUAD中抑制YTHDC2可通過SLC7A11表達上調阻止脂質過氧化。同樣地,MDA和YTHDC2與**期數呈負相關,而SLC7A11與分期呈正相關(圖7N),說明SLC7A11的升高可能是抑制YTHDC2促進LUAD進展的關鍵。
結論:本研究強調了m6A閱讀器YTHDC2在LUAD中的重要性。XC?系統活性可能通過抑制YTHDC2來誘導促進**發生。此外,基于YTHDC2表達的分子模型可能有助于預測LUAD的預后。抑制劑靶向XC?系統可能有助于***預后不良的LUAD患者。因此,本研究對LUAD的**發生、分子分型和藥物敏感性提供了有價值的見解。 神經元中FTH的敲除抵消了褪黑素對創傷性腦損傷鐵死亡的保護作用。微生物科研省自然科學基金
發現乳酸菌上清液降低了尿酸濃度。湖北ampk信號通路芯片科研
PI3K-AKT信號通路PCR基因芯片可以同時檢測與PI3K-AKT信號通路相關的84個基因的表達。芯片中包括AKT(蛋白激酶B)和PI13K家族成員及他們的調節基因,這些基因參與許多生物學過程包括:Gsk3失活、β-catenin的沉積、肌動蛋白的組裝調控及細胞遷移、BAD磷酸化等。IGF-1.mTOR和抗凋亡二信號通路相關的基因,調控elF4e和p70S6激酶活性的基因也包含其中。利用實時定量PCR,研究者可以方便并且可信地對與PI3K-AKT信號通路相關的基因進行同時檢測。湖北ampk信號通路芯片科研
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗