7）SsD克服了m6A介導的白血病對酪氨酸激酶抑制劑的耐藥性
由于FTO抑制使耐藥細胞對酪氨酸激酶抑制劑（TKI）***敏感，我們檢測了SsD對TKI耐藥細胞的療效。我們發現SsD聯合尼洛替尼或PKC412在降低細胞活力方面更有效(圖7A)，這表明SsD***抑制了Kas-1NR和MV4-11PR細胞的增殖。細胞的分子特征也顯示TKIS介導的m6A低甲基化被挽救(圖7B-C)。雖然SsD沒有改變Kas-1NR和MV4-11PR細胞中ALKBH5、METTL3、YTHDF2的蛋白水平(圖7D)，但TKI上調的m6A相關基因MerTK、BCL-2和STAT3的表達受損(圖7E)。與上述結果一致，MerTK、BCL-2和STAT3在TKI耐藥細胞的mRNA和蛋白水平上更穩定。然而，SsD***降低了MerTK和BCL-2轉錄本的穩定性，這隨后導致了它們的翻譯降低(圖7F和7G)。基因特異性m6AqPCR證實MerTK、BCL-2和STAT3的RNA或蛋白水平的變化是由m6A介導的mRNA穩定性引起的。 m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。浙江出生缺陷拷貝數科研
3.構建微生物群共發生網絡并進行聚類分析
使用SparCC算法構建差異ASV共發生網絡。
分析并比較了腺瘤和對照組中生物標志物的模式，將它們進一步組裝成具有不同分類學組成的四個簇。這些簇與患者的年齡，性別和BMI等特征沒有緊密聯系。此外，還探討了CRC患者腸道菌群在24種生物標記物組中的共發生網絡，并產生了三個簇。聚類1的細小螺旋藻科物種被分配的ASV**少，而聚類2在分類學上是異質的，在CRC個體中患病率較高。
4.結腸*、腺瘤分類模型的驗證
結果表明，微生物來源的生物標志物組在檢測大腸腺瘤方面優于FIT，并且它們的組合可以提高非侵入性腺瘤診斷的準確性。
5.在**隊列中驗證結直腸腺瘤標志物
本研究納入了另外兩個來自美國（驗證組1）和中國（驗證組2）的**隊列。驗證隊列1由70名對照和102例腺瘤患者組成，而驗證隊列2中有57例腺瘤患者和52例CRC患者。 重慶成骨芯片科研專注于生命科學內的前沿研究。
4）DRD2重編程的Mφ誘導**細胞的焦亡
如HE所示，來自小鼠模型的**承載DRD2顯示**細胞死亡增加(圖4A)。在免疫組化染色中，表達DRD2的4T1**樣本中pMLKL表達較高(圖4A)。根據TUNEL實驗，DRD2也促進了體內細胞凋亡(圖4B)。DRD2上調GSDME而不是GSDMD(圖4C)。在crosstalk過程中，Mφ進一步促進了DRD2轉染的BrCa細胞中GSDME的表達(圖4C)。在表達DRD2的BrCa細胞中，Mφ也能上調IL-1β(圖4C)。WB結果表明，DRD2誘導了MLKL的磷酸化，而在共培養過程中，MLKL被Mφ抑制(圖4D)。此外，DRD2表達***了caspase-8，而***被Mφ抑制(圖4D)。假設，DRD2可能在與Mφcrosstalk時誘發焦亡。BrCa細胞中與Mφ共培養時，NLRP3在表達DRD2的BrCa細胞中被觸發。***的caspase-1蛋白水解也能誘導IL-1β和IL-18的成熟(圖4D)。在共培養過程中，Cleavedcaspase-3表達上調(圖4D)。此外，在共培養過程中發現表達DRD2的BrCa細胞中，GSDME的N端發生了剪切(圖4D)。為了確定是否由M1Mφ引起焦亡，我們使用了LPS誘導的M1Mφ培養基，結果表明，在表達DRD2的BrCa細胞中，M1Mφ*觸發NLRP3組裝并剪切GSDME(圖4E)。以上結果提示，M1Mφ以DRD2依賴的方式觸發BrCa細胞的焦亡。
采用LEfSe方法分析經DHEA和tempol處理后***改變的關鍵系統發育類型。Desulfovibrionaceae屬富集于oil+PBS組，而Muribaculaceae和Alloprevotella屬富集于DHEA+PBS和DHEA+tempol組(圖5A-B)，這表明tempol可以重塑微生物PCOS大鼠的腸道微生物群的結構。通過分析細菌分類在門和屬水平上的相似性程度，進一步比較三組腸道菌群的整體組成。在門水平上，厚壁菌門(Firmicutes)和擬桿菌門(Bacteroidetes)是3個類群的優勢門(圖5)。DHEA處理增加了放線菌門(Actinobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、Patescibacteria、軟毛桿菌門(Tenericutes)和Verrucomicrobia的豐度，減少了psilonbacteraeota和變形菌門(Proteobacteria)的數量。然而，在tempol干預下，放線菌門、Patescibacteria門、變形菌門和Tenericutes門的變化減弱了(圖5D)。在屬水平上，Lachnospiraceae_NK4A136_group和Multibaculaceae為優勢屬(圖5E)。DHEA***提高了thaauera、葡萄球菌、Ideonella、棒狀桿菌和瘤胃球菌_2的豐度，降低了瘤胃球菌_1的豐度。這些變化被tempol處理抵消了(圖5F)。促進胰腺*的生長和轉移。
使用SmartSeq2協議對15個胎兒的單個細胞進行scRNA-seq處理（圖1 a）。
基于差異表達(DE)分析和按標準化表達***性排序的前20個標記基因。紅細胞(表達HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細胞祖細胞和單核細胞(表達CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細胞、肥大細胞(表達CD63、GATA2和HDC)、漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs;表達IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環pDCs(表達pDC和增殖標記物;例如，MKI67)和粒細胞1、2和3(表達AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細胞分析顯示，在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在***的轉錄異質性，一些表型祖細胞群體(如造血干細胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過10個不同的轉錄定義群體組成（圖1c）.注釋了23個不同群體（圖1 d）. 2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法。生物芯片科研實驗可參觀
文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(MLN)中的Th17細胞（與結腸炎癥密切相關）。浙江出生缺陷拷貝數科研
OARSI分級(圖6E)進一步提示小鼠SHAM+載體和DMM+circPde4b組軟骨降解較少，而DMM+載體和DMM+circPde4b+RIC8A組軟骨降解情況相反。熱板試驗、膝關節伸展試驗和電擊刺激跑步機試驗顯示，DMM+載體組和DMM+circPde4b+RIC8A組的不適和膝關節疼痛多于SHAM+載體組和DMM+circPde4b組(圖6F)。小鼠膝關節的三維微CT重建顯示，DMM+NC組和DMM+circPde4b+RIC8A組比SHAM+載體和DMM+circPde4b組有更多的骨贅(圖6G)。此外，四組中RIC8A和p-p38標記的免疫組化染色顯示過表達circPde4b下調了RIC8A和p-p38的表達，從而抑制了DMM手術引起的OA進展(圖6H，I)。綜上所述，在小鼠中，circPde4b和RIC8A參與了OA的發病機制（圖6J）。
結論：我們的研究描述了一種新的circRNA在OA中的機制。我們發現circPDE4B可以作為蛋白質降解的支架，在OA的進展中發揮重要作用。在臨床前動物模型中，CircPDE4B被發現調節細胞外基質代謝，阻止軟骨基質的形成，證實了其對OA發生的潛在***作用。機制上，circPDE4B可作為促進RIC8A-MID1結合的支架，降低RIC8A依賴的p38信號通路的***，從而調節OA的進展。 浙江出生缺陷拷貝數科研
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