細胞周期科研整體服務

來源: 發布時間:2021-10-24

在Fth- KO小鼠中, TBI后褪黑素對神經的保護作用被**取消

為了進一步探索神經元Fth的喪失是否影響褪黑素對TBI誘導的鐵死亡的影響,測量了鐵死亡的幾種假定的生物標志物。發現***KO小鼠上皮層非血紅素鐵的水平沒有影響。令人驚訝的是,盡管褪黑素***的和未***的Fth -KO小鼠的Tfr1 mRNA和蛋白表達水平沒有顯著差異,但是在褪黑素***的小鼠中,觀察到Fpn mRNA和蛋白表達水平顯著增加Fth- KO小鼠。值得注意的是,與未***的Fth- KO小鼠相比,用褪黑素***Fth- KO小鼠未能顯著改變mRNA(Slc7a11,Ptgs2)和蛋白質(xCT,Cox2、4HNE)的表達。另外,用褪黑素***Fth- KO小鼠并沒有統計學上降低GSH和MDA以及4HNE的水平,和FJB陽性細胞的數目。這些結果表明褪黑素沒有統計學上減少TBI引起的鐵死亡和神經元變性。 英拜生物提供專業的編輯潤色團隊保證服務到文章接收為止。細胞周期科研整體服務

1.下載GEO數據并進行預處理

下載數據集GSE28829,GSE41571和GSE43292,使用Perl腳本和R軟件的sva軟件包進行原始數據的合并和預處理。然后,使用Perl腳本將每個基因的探針ID轉換為基因名。

2.CIBERSORT分析免疫浸潤

CIBERSORT的LM22基因文件用于定義22個免疫細胞亞群,這些數據可從CIBERSORT網站進行下載。使用CIBERSORT對表達文件的P值和均方根誤差進行計數,獲得免疫細胞收據,使用R包,corplot,vioplot和ggplot2進行結果的可視化。


野生型科研國家自然科學基金METTL14是其***的潛在靶點。

2、白樺素下調SREBP靶基因,降低細胞脂質水平

由于SREBP-2是其自身的直接靶標,因此白樺素將其表達下調40%(圖3A)。與SREBP-2是膽固醇生物合成的主要轉錄因子這一觀點一致,膽固醇合成途徑中的10個被測基因,例如HMGCR,HMG-CoA合酶(HMGCS)和角鯊烯環氧酶(SE),都被白樺素處理抑制了(圖3A)。類似地,與脂肪酸和甘油三酸酯合成有關的所有9個基因,例如SREBP-1c,脂肪酸合酶(FAS)和乙酰輔酶A羧化酶α(ACC),都被白樺素顯著下調(圖3B)。與早期觀察結果一致(圖1A),包括ABCG5和ABCG8在內的LXR靶基因不受白樺素的影響(圖3C)。

4.YTHDC2抑制依賴于SLC7A11的胱氨酸攝取

Xc-系統是一個胱氨酸/谷氨酸逆向轉運蛋白,捕獲細胞外的胱氨酸,用于谷胱甘肽的合成,以交換谷氨酸的釋放。在圖3中,被抑制的Xc-系統功能與YTHDC2受損的胱氨酸攝取有關,然而YTHDC2如何調節Xc-系統依然未知。文獻報道催化亞基SLC7A11在維持Xc-系統活性方面起著重要作用。作者通過IB和RT-qPCR發現,SLC7A11蛋白和mRNA水平均受YTHDC2負調控(圖4A、B)。在小鼠中,與KPE和KPYΔYTH小鼠相比,KPYWT小鼠的**中SLC7A11表達下調(圖4C、D)。這證明YTH結構域是YTHDC2抑制SLC7A11表達的前提。 增加乳酸桿菌水平導致尿酸水平下降。

由于HoxBlinc通過招募SETD1A和MLL1復合物,并在HoxB前位點組織活躍的染色質結構域,促進HoxB前基因的表達,NPM1c+或HoxBlincTg引起的HoxBlinc上調可以通過增強子/啟動子染色質可及性來***其在HSPC中的靶基因。為了驗證這一點,使用WT、NPM1c/+和HoxBlincTg小鼠的LSK細胞進行了轉座酶可及染色質分析高通量測序 (ATAC-seq)。巧合的是,NPM1c/+和HoxBlincTg LSK細胞有相當一部分基因表現出啟動子可及性的增加(28.9%)或減少(24.3%)(圖4e)。此外,NPM1c+或HoxBlincTg使啟動子可及性增加的基因中有相當一部分也上調,這些基因包括NPM1c特征基因HoxB2-5、HoxA9-10、Meis1和Runx1,以及其他靶基因如Stat1和Cdr2(圖4f-g)。這些結果表明HoxBlinc lncRNA的過表達通過增強HSPC中增強子/啟動子染色質的可及性特異性***NPM1c+標記基因。英拜提供一年三節的購物卡津貼。運動神經元科研服務兩年

大黃酸改變嘌呤代謝降低尿酸水平。細胞周期科研整體服務

5、hUC-MSCs調節MRL/lpr小鼠脾CD4+T細胞Sirt1/p53信號通過miR-199a-5p

文獻報道在**和自身免疫疾病中,hUC-MSCs能夠將miRNAs轉移到周圍的細胞。因此,作者考慮miRNAs是否可能參與hUC-MSCs介導的對脾CD4+T細胞中Sirt1的表達調控。使用在線軟件Targetscan識別了10個miRNA,這些miRNA被預測靶向Sirt1。qPCR分析顯示,在這10個miRNAs中,只有miR-199a-5p的表達在MRL/lpr脾CD4+T細胞中***降低(圖5A)。此外,miR-199a-5p是hUC-MSCs處理后***表達增加的miRNA(圖5A)。事實上,miR-199a-5pmimic不僅可以提高MRL/lpr脾CD4+T細胞中miR-199a-5p的水平,降低Sirt1的表達(圖5B-C),而且還可以提高衰老標志物p21、p16和乙?;痯53的表達水平(圖5D)。 細胞周期科研整體服務

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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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