4.ELNAT1直接與hnRNPA1相互作用
由于lncRNA的分子功能與其亞細胞定位相關，通過FISH和亞細胞定位實驗發現ELNAT1在UM-UC-3和T24細胞的細胞質和細胞核均有表達（SupplementalFigure7A,B）。并且通過RNA-pulldown實驗，發現在分子量35~40kDa上有明顯的條帶（Figure4A）。對此，通過質譜（MS）和Westernblot分析顯示，hnRNPA1是**豐富的ELNAT1相互作用蛋白（Figure4B-D）。熒光染色和RNA免疫沉淀（RIP）證實了ELNAT1和hnRNPA1在UM-UC-3和T24細胞中的共定位，并且ELNAT1通過內源性hnRNPA1富集（Figure4E,F），進一步驗證了ELNAT1和hnRNPA1之間的相互作用。 提供分子生物以及到后續動物建模的一整套服務。分子毒理通路發現者
為了直接評價MAOIs是否能在體內重編程人TAM的極化，建立了人**/TAM異種移植NSG小鼠模型。A375人黑色素瘤細胞與健康供者外周血單個核細胞(PBMCs)分離的單核細胞混合，注射到NSG小鼠中形成實體瘤，接種后給予或不給予苯乙肼***（圖6h）。苯乙肼能有效抑制人TAMs的免疫抑制極化（圖6i-j）。接下來，研究了MAOI誘導的人TAM重編程是否會影響人T細胞的抗**活性，使用3D人**/TAM/T細胞類***培養。NY-ESO-1是一種公認的**抗原，通常在多種人類**中表達，被選為模型**抗原。A375人黑素瘤細胞系設計為共表達NY-ESO-1及其匹配的MHC分子HLA-A2作為人**靶點（命名為A375-A2-ESO）。NY-ESO-1特異性人CD8+T細胞的構建是通過將Retro/ESO-TCR編碼NY-ESO-1特異性TCR（命名為ESO-TCR）的逆轉錄病毒載體轉導至健康供體外周血CD8+T細胞，將該細胞命名為ESO-T細胞，它表達ESO-TCRs，特異性靶向A375-A2-ESO**細胞，從而建立**特異性人CD8+T細胞模型。核受體與輔助調節因子根客戶的研究方向查閱相關文獻。
環狀RNA（circRNA）是動植物中一類豐富且保守的RNA。**近的研究表明，circRNA可以通過充當非編碼RNA或編碼RNA發揮多種生物學作用。體外合成的circRNA可以不依賴于帽的方式進行翻譯。但鑒定circRNA編碼的蛋白質是困難的，主要是因為circRNA序列及其宿主基因的同源線性mRNA具有較大的重疊。近期NucleicAcidsResearch雜志在線發表了題名為：TransCirc:aninteractivedatabasefortranslatablecircularRNAsbasedonmulti-omicsevidence的文章，該文章主要講述了circRNA翻譯預測和分析的數據庫——TransCirc。
OARSI分級(圖6E)進一步提示小鼠SHAM+載體和DMM+circPde4b組軟骨降解較少，而DMM+載體和DMM+circPde4b+RIC8A組軟骨降解情況相反。熱板試驗、膝關節伸展試驗和電擊刺激跑步機試驗顯示，DMM+載體組和DMM+circPde4b+RIC8A組的不適和膝關節疼痛多于SHAM+載體組和DMM+circPde4b組(圖6F)。小鼠膝關節的三維微CT重建顯示，DMM+NC組和DMM+circPde4b+RIC8A組比SHAM+載體和DMM+circPde4b組有更多的骨贅(圖6G)。此外，四組中RIC8A和p-p38標記的免疫組化染色顯示過表達circPde4b下調了RIC8A和p-p38的表達，從而抑制了DMM手術引起的OA進展(圖6H，I)。綜上所述，在小鼠中，circPde4b和RIC8A參與了OA的發病機制（圖6J）。
結論：我們的研究描述了一種新的circRNA在OA中的機制。我們發現circPDE4B可以作為蛋白質降解的支架，在OA的進展中發揮重要作用。在臨床前動物模型中，CircPDE4B被發現調節細胞外基質代謝，阻止軟骨基質的形成，證實了其對OA發生的潛在***作用。機制上，circPDE4B可作為促進RIC8A-MID1結合的支架，降低RIC8A依賴的p38信號通路的***，從而調節OA的進展。 ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布。
遷移體（migrasome）是清華大學生命科學院俞立團隊新發現的胞外分泌囊泡，該研究成果已于2015年發表在CellResearch期刊（IF=）[1]。遷移體是在遷移細胞后部回縮纖維的或交叉處生長的大囊泡，直徑約為μm到3μm，并且包含許多較小的囊泡（**多300余個，**少不足10個），掃描電子顯微鏡觀察下呈石榴狀結構。細胞遷移后，回縮纖維**終斷裂，遷移體分離。遷移體及其內容物，包括細胞溶質成分和來源不明的囊泡，被釋放到細胞外空間——這一過程稱為遷移。俞立團隊推測遷移體可能在細胞間通訊中發揮重要作用。2017年俞立團隊進一步研究發現，整合素與ECM蛋白的配對結合決定了遷移體的形成[2]，該研究成果也發表在CellResearch期刊。2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法[3]。2019年，俞立團隊發現Tspan4和膽固醇在遷移體形成時組織成為微米級大型微結構域，這一結構即遷移體的基本結構，還證實遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結構的剛度增加而產生的一種生物物理過程[4]，該研究成果發表于NatureCellBiology期刊中（IF=）。并同年在同期刊中發表，遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態發生，Tspan4a和Tspan7。促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。舒張壓
也是***PDAC肝轉移的潛在靶點。分子毒理通路發現者
***，分析了MAOA基因表達水平與幾種**病人臨床預后的關系，結果顯示瘤內MAOA基因與卵巢*，淋巴*和乳腺*患者的臨床總生存率呈現負相關關系（圖6o-q）。此外，黑色素瘤患者**內高水平的MAOA表達很大程度上抵消了PD-1***提供的生存好處，提示MAO-A阻斷***與PD-1/PD-L1阻斷***聯合可能通過調節TAM極化，從而改變免疫抑制TME，提高抗**免疫能力，提供協同***好處（圖6r）。綜上所述，人類TAM和臨床相關性研究證實了MAO-A作為人類TAM中一個有前途的藥物靶點，并支持了MAO-A通過靶向TAM重編程阻斷**免疫***的翻譯潛力。分子毒理通路發現者
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗