結果1)AKI伴有明顯的脂質積累,并與腎損傷的嚴重程度高度正相關
根據脂質代謝組學分析結果,我們發現AKI組織中各類甘油三酯(TGs)含量***增加(圖1A)??紤]到AKI中的脂質積累,我們進行實驗來確定其臨床意義。我們對不同嚴重程度的AKI動物標本進行油紅O染色。結果顯示,隨著疾病進展的延長,小鼠腎組織脂質沉積逐漸增加(圖1B)。在體外也發現了類似的結果,即隨著細胞損傷的嚴重程度,脂質積累的程度增加(圖1C)。這些結果說明AKI中的脂質積累與疾病的嚴重程度呈正相關。 可以上傳原始的fast文件。細胞死亡
相反,miR-199a-5p抑制劑處理可提高WT小鼠脾CD4+T細胞中Sirt1的表達(圖5E),并降低衰老標志物p21,p16和乙酰p53水平(圖5F)。***,與MRL/lpr相比,hUC-MSCs可增加miR-199a-5p的產生,表明hUC-MSCs是miR-199a-5p來源的關鍵調控因子(圖5G)。在transwell系統中,hUC-MSCs與MRL/lpr脾CD4+T細胞共培養48h后,細胞內miR-199a-5p升高,Sirt1基因表達降低,CD4+T細胞中衰老標志物的表達水平恢復,而miR-199a-5p抑制劑處理后仍處于抑制狀態(圖5G-I)??偟膩碚f,這些數據表明hUC-MSCs通過miR-199a-5p介導的Sirt1下調和隨后p53去乙酰化的減少,增加了脾臟CD4+T細胞的衰老。干細胞課題外包服務找英拜放心安心。
接下來,研究了CRC細胞來源的外泌體對巨噬細胞M2極化的影響。如Fig.3e所示,當與巨噬細胞共培養時,標記有DiO(綠色)的CRC細胞來源的外泌體被未染色的巨噬細胞內化。相比于低表達miR-934的細胞的外泌體孵育的巨噬細胞或PBS孵育的細胞,M2標記物(CD206,arginase-1,IL10和CD163)的表達在高表達miR-934的CRC細胞的外泌體孵育的巨噬細胞中***增加,而M1標記物(iNOS和IL-1β)幾乎無差異(Fig.3f,g)。
為了確定CRC細胞來源的外泌體miR-934是否誘導巨噬細胞的M2極化,首先生成了miR-934mimics和anti-miR-934來過表達或抑制miR-934的表達。與對照組相比,轉染miR-934mimics的巨噬細胞M2標記物(CD163、CD206、arginase-1和IL10)的表達明顯增加(Fig.3h,i)。此外,用anti-miR-934、miR-934mimics或其陰性對照載體轉染HCT-8和HT29細胞,提取其外泌體并添加到PMA處理的THP-1細胞中。結果顯示,轉染anti-miR-934或miR-934mimics的CRC細胞的外泌體中M2標記物(CD206、arginase-1、IL10和CD163)在PMA處理的THP-1細胞中表達明顯低于或高于載體對照組(Fig.3j,k)。綜上所述,證實CRC細胞來源的外泌體miR-934可以誘導巨噬細胞M2極化。
肺*是**常被診斷的**之一,也是導致**死亡的主要原因,非小細胞肺*(NSCLC)約占肺*病例的85%。環狀RNA(circRNA)是一類共價閉合的單鏈RNA,與**的發展有關。***我們來看一篇發表在Nature Communications期刊的一篇文章,題名為:circNDUFB2 inhibits non-small cell lung cancer progression via destabilizing IGF2BPs and activating anti-tumor immunity。
circNDUFB2在NSCLC中被下調
通過circRNA芯片分析了三對NSCLC樣品中circRNA的表達譜,總共鑒定出109個circRNA失調,33個上調,76個下調。qRT-PCR驗證52個配對NSCLC樣品中**差異circRNA的表達。circNDUFB2是**顯著下調的circRNA。臨床分析發現circNDUFB2高表達與NSCLC患者的**大小、淋巴結轉移和分期呈負相關。結果表明,circNDUFB2在NSCLC中經常被下調,并且與NSCLC的惡性特征呈負相關。circNDUFB2由NDUFB2基因的外顯子2–3產生,長度為249nt。circNDUFB2可由發散引物擴增,收斂引物不能擴增。核酸酶消化證實circNDUFB2具有閉環結構。放線菌素D處理表明,與NDUFB2mRNA相比,circNDUFB2是穩定的。核質分離PCR以及熒光原位雜交(FISH)顯示circNDUFB2主要定位于細胞質中。這些結果表明circNDUFB2是一個circRNA。 產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。
METTL3降低APC表達,促進β-catenin介導的下游基因表達、有氧糖酵解、ESCC細胞增殖和**發展
APC功能的喪失使β-連環蛋白穩定,從而誘導下游基因(CCND1和MYC)的表達。CCND1促進細胞周期,c-Myc增強有氧糖酵解。正如預期的那樣,METTL3缺失增強了KYSE180細胞中APC的表達,降低了β-連環蛋白、細胞CCND1、c-Myc和PKM2的表達。此外,METTL3缺失降低了葡萄糖攝取、乳酸產生、細胞增殖和細胞集落數。值得注意的是,這種METTL3缺失引起基因表達(圖6a)、糖酵解(圖6b,c)、細胞增殖(補充圖6f)和集落形成的抑制在很大程度上被這些細胞中的APC缺失所消除。相反,METTL3過度表達引起葡萄糖消耗和乳酸產生的增加,這被YTHDF2消耗所消除。這些結果表明METTL3降低APC表達,促進β-catenin介導的下游基因表達、有氧糖酵解和ESCC細胞增殖。
為了確定METTL3誘導的APC表達下調在小鼠**生長中的作用,將KYSE180細胞皮下注射到裸鼠體內。發現通過APC去除,METTL3去除使**大小、體積和重量減小,并且**組織中的乳酸量恢復。IHC染色顯示,METTL3缺失增加AP的表達,相應地減少了**組織中β-連環蛋白、cyclind1、c-Myc和PKM2的表達。這些結果表明METTL3抑制APC的表達可以促進**的發展。 TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。丙酸
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5)NOX4的升高通過抑制人類星形膠質細胞線粒體呼吸和ATP的產生來促進線粒體代謝的損傷,從而促進氧化應激
我們研究了AD期間NOX4升高誘導受損星形膠質細胞氧化應激的潛在分子機制。與對照組相比,NOX4過表達***抑制了OCR的基礎水平,且***降低了寡霉素和FCCP作用下的OCR水平(圖5A和B)。接下來,我們研究了NOX4上調對人類星形膠質細胞線粒體呼吸途徑調控的分子靶點。我們分析了包括NADH在內的5種線粒體ETC蛋白復合物的水平(圖5C)。與OCR水平一致,與對照組相比,NOX4過表達***抑制了5種線粒體氧化磷酸化酶復合物的蛋白水平并***減少ATP的產生(圖5D)。免疫熒光染色顯示,與對照組相比,NOX4的升高導致線粒體碎裂,并***增加了線粒體碎裂的細胞數量(圖5G)。這些結果表明,NOX4的升高通過抑制人類星形膠質細胞線粒體呼吸和ATP的產生,從而損害線粒體代謝,從而促進氧化應激。 細胞死亡
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗