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7、CFL1/PLD1軸介導(dǎo)低氧誘導(dǎo)的HCC細(xì)胞中AKT途徑的***之前的一項(xiàng)研究表明,PLD1***AKT及其下游mTOR通路促進(jìn)HCC細(xì)胞增殖、侵襲。與此一致,作者觀察到CFL1敲除降低了p-AKT水平,在HCCLM3細(xì)胞中通過PLD1恢復(fù)增強(qiáng)了p-AKT水平(圖7A,C)。此外,PLD1沉默逆轉(zhuǎn)了CFL1誘導(dǎo)的Hep3B細(xì)胞中AKT信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的活化(圖7B,D)。值得注意的是,CFL1或PLD1敲除抑制了肝*細(xì)胞中缺氧誘導(dǎo)的AKT通路***和EMT過程(圖7E,F(xiàn))。之后,進(jìn)行拯救實(shí)驗(yàn)探討HIF-1α-CFL1-PLD1軸中PLD1的功能。在HCCLM3細(xì)胞中過表達(dá)的PLD1可以逆轉(zhuǎn)低氧條件下CFL1-shRNA引起的對(duì)AKT磷酸化或EMT過程的抑制(圖7G,H)。總的來說,證實(shí)CFL1/PLD1軸在缺氧誘導(dǎo)的HCC進(jìn)展中起重要作用。
總之,該研究表明HCC中過表達(dá)CFL1與較差的臨床病理學(xué)參數(shù)呈正相關(guān)。體外和體內(nèi)實(shí)驗(yàn)證實(shí)CFL1是HCC**生長和轉(zhuǎn)移的驅(qū)動(dòng)因素。PDL1/AKT通路介導(dǎo)CFL1的致*功能。此外,CFL1是一個(gè)缺氧反應(yīng)基因,通過***PLD1/AKT信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)參與缺氧誘導(dǎo)的HCC進(jìn)展(圖8)。綜上所述,該研究表明CFL1是低氧微環(huán)境與HCC進(jìn)展之間的一種新的連接體。 生命科學(xué)領(lǐng)域內(nèi)的精細(xì)研究。浙江課題技術(shù)指導(dǎo)
5)M1-Exos通過傳遞miR-155加重了EndoMT
為了研究外泌體miR-155在SCI后M1-Exos介導(dǎo)的BSCB破壞惡化中的作用,構(gòu)建miR-155過表達(dá)(miR-155OE)和敲低(miR-155KD)BMDMs,然后分離外泌體并處理bEnd.3細(xì)胞。如圖5A和B所示,miR-155OE-Exos組TEER值***降低,通透性***增加,而miR-155KD-Exos組則相反。加入miR-155OE-Exos后,ZO-1和Occludin的熒光強(qiáng)度明顯降低,而miR-155KD-Exos處理后,ZO-1和Occludin的表達(dá)***增強(qiáng)(圖5C和D)。此外,westernblot檢測(cè)TJs蛋白的表達(dá),結(jié)果與上述討論的結(jié)果相似(圖5E)。miR-155OE-Exos可促進(jìn)細(xì)胞形態(tài)轉(zhuǎn)化,其分支更少,體細(xì)胞更長。miR-155KD-Exos處理后的結(jié)果則相反(圖5F)。miR-155OE-Exos暴露后,I型膠原蛋白、III型膠原蛋白和α-SMA蛋白水平上調(diào),CD31蛋白水平下調(diào),而miR-155KD-Exos作用相反(圖5G)。以上結(jié)果表明,外泌體miR-155在促進(jìn)bEnd.3細(xì)胞的EndoMT中起著至關(guān)重要的作用。 河北課題創(chuàng)新服務(wù)也是***PDAC肝轉(zhuǎn)移的潛在靶點(diǎn)。
蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物
MarkerDB中142個(gè)蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物覆蓋了160多種疾病。MarkerDB中的所有蛋白質(zhì)生物標(biāo)記物數(shù)據(jù)都是從OncoMX、CBD和UPBD原始文獻(xiàn)中提取的,結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù)從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫PDB收集。目前,MarkerDB中的所有蛋白質(zhì)標(biāo)記都有一個(gè)或多個(gè)疾病關(guān)聯(lián),以及MarkerDB ID、序列、結(jié)構(gòu)、詳細(xì)的蛋白質(zhì)描述、蛋白質(zhì)名稱/同義詞、蛋白質(zhì)理化數(shù)據(jù)、疾病濃度、正常濃度、性別、年齡范圍,生物流體、一個(gè)或多個(gè)文獻(xiàn)參考和其他在線數(shù)據(jù)庫的外部超鏈接。
2、CFL1的高表達(dá)與HCC的不良預(yù)后相關(guān)單變量分析顯示,**大小、**數(shù)量、TNM分期、靜脈浸潤、HBV***和CFL1水平與HCC患者的總體生存率***相關(guān)(表2)。多變量分析顯示,***大小、**數(shù)量、靜脈浸潤和CFL1水平是HCC總體生存率的**預(yù)后指標(biāo)(表2)。并且,可以看出CFL1的高表達(dá)與HCC的不良預(yù)后相關(guān)。
3、CFL1促進(jìn)HCC的增殖,遷移和侵襲如圖2所示,在高表達(dá)CFL1的HCCLM3和MHCC97h細(xì)胞中,敲除CFL1(圖2A)。隨后實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)敲除CFL1后HCCLM3和MHCC97h細(xì)胞的增殖,遷移和侵襲能力被抑制,表明CFL1促進(jìn)HCC的增殖,遷移和侵襲。
使用motif和CHIP-seq預(yù)測(cè)影響基因簇表達(dá)的轉(zhuǎn)錄因子。
此外,GFP-INPP4B的表達(dá)在基礎(chǔ)和wnt刺激條件下降低了GSK3β蛋白水平,與GSK3β的增強(qiáng)破壞一致(圖6d)。通過Hrs shRNA消耗抑制晚期核內(nèi)體形成后,降低的GSK3β蛋白水平得以恢復(fù)(圖6f, g)。GFP-INPP4B而不是gfp載體細(xì)胞表現(xiàn)出明顯的GSK3β蛋白酶保護(hù),這與GSK3β向晚期核內(nèi)體轉(zhuǎn)運(yùn)的增強(qiáng)相一致(圖6h)。免疫熒光證實(shí)了這一點(diǎn),在GFP-INPP4B中觀察到RFP-GSK3與LysoTracker共定位,這是一種積累在晚期核內(nèi)體/溶酶體中的染料,而不是gfp載體細(xì)胞(圖6i)。
我們比較了Pex和Npex組間的HSC的RNA測(cè)序基因表達(dá)譜。河北課題創(chuàng)新服務(wù)
TRF測(cè)序課題整體服務(wù)。浙江課題技術(shù)指導(dǎo)
4、CLF1敲除抑制小鼠HCC的生長和肺部轉(zhuǎn)移隨后,作者在體內(nèi)進(jìn)一步驗(yàn)證CLF1的功能。結(jié)果如圖3所以,敲除CFL1后***降低了HCC細(xì)胞的**體積和**,并減少了肺轉(zhuǎn)移結(jié)節(jié)數(shù)量。IHC表明CLF1的敲除也導(dǎo)致EMT相關(guān)蛋白的抑制。總之,CLF1敲除抑制小鼠HCC的生長和肺部轉(zhuǎn)移。
5、CFL1是HIF-1α在HCC細(xì)胞中的下游靶基因?yàn)榱岁U明低氧對(duì)HCC中CFL1表達(dá)的影響,將HCCLM3和Hep3B細(xì)胞在低氧培養(yǎng)箱中培養(yǎng)48h。結(jié)果發(fā)現(xiàn)低氧誘導(dǎo)導(dǎo)致CFL1的表達(dá)升高,但是當(dāng)HIF-1α敲除后,低氧誘導(dǎo)并不能提高CFL1的表達(dá),并且使用HIF-1α的抑制劑處理HCCLM3和Hep3B細(xì)胞,也能降低因低氧誘導(dǎo)導(dǎo)致CFL1表達(dá)升高(圖4A-F)。ChIP-PCR檢測(cè)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),HIF-1α和HIF-1β與HCC細(xì)胞CFL1啟動(dòng)子中的HRE直接結(jié)合(圖4G)。在低氧條件下,轉(zhuǎn)染HRE熒光素酶質(zhì)粒或CFL1啟動(dòng)子-熒光素酶質(zhì)粒的HEK293T細(xì)胞中熒光素酶報(bào)告基因活性升高(圖4H)。 浙江課題技術(shù)指導(dǎo)
公司特色是以各式高通量二代測(cè)序?yàn)榛A(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺(tái),提供課題整體設(shè)計(jì)外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺(tái)落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實(shí)驗(yàn)平臺(tái)開放參觀,客戶可隨時(shí)參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度,保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計(jì)的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請(qǐng):提供標(biāo)書課題設(shè)計(jì)、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展,設(shè)計(jì)的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn),中標(biāo)率很高。
3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測(cè)序:轉(zhuǎn)錄組測(cè)序、smallRNA測(cè)序、snoRNA測(cè)序、TRF測(cè)序
5.芯片:信號(hào)通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn):DNA甲基化實(shí)驗(yàn)(BSP,MSP,焦磷酸測(cè)序),RNA甲基化實(shí)驗(yàn)
7.實(shí)時(shí)定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證,過表達(dá),干擾),基因突變及SNP檢測(cè),F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)