焦亡生物相關(guān)課題創(chuàng)新服務(wù)

USP35敲除增加了脂質(zhì)活性氧的產(chǎn)生和丙二醛的產(chǎn)生(圖2D)。過量的活性氧導(dǎo)致多不飽和脂肪酸氧化損傷并分裂成各種產(chǎn)物，包括HETEs。我們觀察到，USP35沉默促進(jìn)了H460和H1299細(xì)胞中5-HETE、11-HETE和15-HETE的釋放，而不影響12-HETE的釋放(圖2F)。GSH/GPX4為基礎(chǔ)的ROS***機(jī)制在防止鐵缺乏期間的脂質(zhì)過氧化中起著不可或缺的作用。研究表明在USP35缺乏的細(xì)胞中GSH水平降低并伴隨著對GPX4活性的抑制(圖2G，H)。此外，shUSP35***細(xì)胞中的鐵和Fe2+水平***高于對照組。相比之下，補(bǔ)充GSH或鐵螯合劑***減少了shUSP35***細(xì)胞的細(xì)胞死亡和集落形成(圖2K，L)。因此，我們得出結(jié)論，鐵死亡有助于USP35敲除誘導(dǎo)的肺*細(xì)胞死亡。促*分泌體通過外泌體傳遞和運(yùn)輸是轉(zhuǎn)移前微環(huán)境形成和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵。焦亡生物相關(guān)課題創(chuàng)新服務(wù)

紡錘體裝配檢查點(diǎn)(SAC)作為一個傳感器的**的著絲點(diǎn)延遲有絲分裂進(jìn)入后期，直到適當(dāng)?shù)娜旧w分離得到保證。這一安全機(jī)制的破壞導(dǎo)致基因組不穩(wěn)定和非整倍體，這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而，盡管了解了控制SAC的基本機(jī)制，但信號通路如何直接與有絲分裂檢查點(diǎn)活動相互作用和調(diào)節(jié)仍是未知的。在對細(xì)胞外刺激的反應(yīng)中，參與細(xì)胞生長、生存和分化的多種信號通路網(wǎng)絡(luò)被***，這一過程***受到Ras家族小鳥苷三磷酸酶(GTPases)的調(diào)控。RIT1是一種ras相關(guān)的GTPase，調(diào)節(jié)細(xì)胞存活和應(yīng)激反應(yīng)，是通過有絲分裂和適當(dāng)?shù)娜旧w分離及時進(jìn)展的必要條件。RIT1在有絲分裂期間從質(zhì)膜(PM)分離，并直接與SAC蛋白MAD2和p31conmet相互作用，該過程受周期蛋白依賴性激酶1 (CDK1)活性的調(diào)節(jié)。此外，致病水平的RIT1沉默了SAC，并通過將MAD2從有絲分裂檢查點(diǎn)復(fù)合體(MCC)中分離出來，加速了通過有絲分裂的轉(zhuǎn)運(yùn)。此外，致病性RIT1抑制SAC促進(jìn)染色體分離錯誤和非整倍體。我們的研究結(jié)果突出了RIT1與其他Ras GTPases相比的獨(dú)特功能，并闡明了信號通路與SAC之間通過一種新的調(diào)節(jié)機(jī)制的直接聯(lián)系。自噬醫(yī)學(xué)相關(guān)課題服務(wù)價格提供***科研設(shè)計咨詢及輔助實(shí)驗(yàn)。

揭示轉(zhuǎn)錄因子如何隨著時間的推移在DNA、RNA和蛋白質(zhì)水平上調(diào)節(jié)其靶標(biāo)，對于定義基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)(GRN)和分配正常和疾病狀態(tài)的機(jī)制至關(guān)重要。RNA-seq是一種使用已建立的分析階段測量基因調(diào)控的標(biāo)準(zhǔn)方法。然而，目前可用的用于解釋有序基因組數(shù)據(jù)（在時間或空間上）的管道方法都沒有使用時間序列模型來分配GRN內(nèi)的因果關(guān)系。此外，也需要將有序的RNA-seq數(shù)據(jù)與蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合數(shù)據(jù)相結(jié)合以區(qū)分直接與間接相互作用的方法。

TIMEOR是***個基于Web的自適應(yīng)時間序列多組學(xué)管道方法，它可以推斷基因調(diào)控事件之間的關(guān)系。TIMEOR通過利用時間序列RNA-seq、基序分析、蛋白質(zhì)-DNA結(jié)合數(shù)據(jù)和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用網(wǎng)絡(luò)，解決了對確定因果調(diào)節(jié)機(jī)制網(wǎng)絡(luò)的方法的關(guān)鍵需求。

APC表達(dá)下調(diào)與食管鱗*標(biāo)本METTL3上調(diào)及食管鱗*患者預(yù)后不良相關(guān)

為了確定METTL3抑制APC表達(dá)的臨床相關(guān)性，分析TCGA數(shù)據(jù)， APC mRNA表達(dá)與ESCC中METTL3 mRNA表達(dá)呈負(fù)相關(guān)。發(fā)現(xiàn)與正常組織相比，ESCC標(biāo)本中APC的表達(dá)***下調(diào)。81例ESCC標(biāo)本的IHC染色觀察到METTL3蛋白表達(dá)與APC蛋白表達(dá)呈負(fù)相關(guān)，METTL3蛋白表達(dá)與β-連環(huán)蛋白表達(dá)呈正相關(guān)。此外，APC的高表達(dá)與ESCC患者的長期總生存時間***相關(guān)。這些結(jié)果提示APC表達(dá)下調(diào)與METTL3表達(dá)上調(diào)及ESCC患者預(yù)后不良相關(guān)。 表達(dá)PTEN- 398A的細(xì)胞中上調(diào)的基因與G1/S檢查點(diǎn)的***有關(guān)。

2）Pex增強(qiáng)肝衛(wèi)星細(xì)胞(HSCs)的活性

為了證實(shí)Pex的生物學(xué)功能，將原代小鼠肝細(xì)胞與Pex孵育，Pex被受體細(xì)胞吸收。然后使用免疫熒光染色對原發(fā)性肝細(xì)胞的類型進(jìn)行表征，結(jié)果顯示，desmin+HSCs和F4/80+Kupffer細(xì)胞吸收了Pex(圖2A)。我們接下來研究了Pex對HSCs生物學(xué)行為的影響，發(fā)現(xiàn)Pex***增強(qiáng)了HSCs的增殖和遷移能力(圖2B和C)。Pex與Npex處理的HSCs的凋亡沒有***差異(圖2D)。westernblot和免疫熒光檢測結(jié)果顯示，Pex***上調(diào)α-SMA的表達(dá)，說明Pex能促進(jìn)HSC的活化(圖2E和F)。我們觀察到Pex可以通過下調(diào)vitronectin和tenascinC的表達(dá)，上調(diào)collagenI和fibronectin的表達(dá)來調(diào)節(jié)HSCs中的ECM分泌(圖2G)。 按照實(shí)驗(yàn)設(shè)計路線和實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行文章的構(gòu)思與潤色。空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)課題分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)

致力于醫(yī)學(xué)相關(guān)領(lǐng)域的實(shí)驗(yàn)技術(shù)服務(wù)和相關(guān)生物醫(yī)學(xué)課題的研究。焦亡生物相關(guān)課題創(chuàng)新服務(wù)

數(shù)據(jù)庫概況

目前，MarkerDB數(shù)據(jù)庫包含142個蛋白質(zhì)生物標(biāo)記，1089個化學(xué)生物標(biāo)記，154個核型生物標(biāo)記和26374個遺傳標(biāo)記。這些分類為25560個診斷生物標(biāo)志物，102個預(yù)后生物標(biāo)志物，265個暴露生物標(biāo)志物和6746個預(yù)測生物標(biāo)志物或生物標(biāo)志物組。這些標(biāo)記可共同用于檢測，監(jiān)視或預(yù)測670種特定人類疾病，這些疾病分為27大疾病類別。

MarkerDB中五個主要分子標(biāo)記類別

化學(xué)生物標(biāo)志物

MarkerDB中的化學(xué)生物標(biāo)記物包括各種先天性代謝或遺傳疾病、**、代謝紊亂、傳染病、藥物暴露、化學(xué)/污染物暴露和飲食攝入的標(biāo)記物。MarkerDB中的1089個化學(xué)標(biāo)記與448種疾病以及106種暴露有關(guān)。目前，MarkerDB中的每個化學(xué)標(biāo)記都有一個或多個疾病關(guān)聯(lián)，以及MarkerDB ID、結(jié)構(gòu)、化合物描述、名稱/同義詞、理化數(shù)據(jù)、疾病濃度、正常濃度、性別、年齡范圍（成人/兒童/新生兒）、生物流體（標(biāo)記物通常用于測量）、ROC曲線、敏感性、特異性、***性（P值）、一個或多個文獻(xiàn)參考和其他在線數(shù)據(jù)庫（OMIM、GenBank、UniProt、HMDB、PubMed、PDB等）的外部超鏈接。 焦亡生物相關(guān)課題創(chuàng)新服務(wù)

公司特色是以各式高通量二代測序?yàn)榛A(chǔ)，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實(shí)驗(yàn)平臺，提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實(shí)驗(yàn)平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實(shí)驗(yàn)平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實(shí)驗(yàn)并參與實(shí)驗(yàn)課題的進(jìn)度，保證您的實(shí)驗(yàn)是在您的指導(dǎo)下完成。

1.整體課題外包服務(wù)：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設(shè)計的課題均具有后續(xù)實(shí)驗(yàn)課題的延展性，為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)

2.標(biāo)書申請：提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫，標(biāo)書部分基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)的開展，設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c(diǎn)，中標(biāo)率很高。

3.提供熱點(diǎn)**文獻(xiàn)技術(shù)支持，探討科研前沿?zé)狳c(diǎn)研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關(guān)研究

4.二代測序：轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實(shí)驗(yàn)：DNA甲基化實(shí)驗(yàn)（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實(shí)驗(yàn)

7.實(shí)時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)(靶基因驗(yàn)證，過表達(dá)，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實(shí)驗(yàn)以及細(xì)胞增殖，凋亡，流式等細(xì)胞功能學(xué)實(shí)驗(yàn)