三、pten - s38a突變誘導細胞凋亡抵抗
為了進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應,我們使用抗體陣列評估了表達PTEN-wt或PTEN-398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。Pten+/+和Pten398A/398AMEF培養,表達Pten-wt的MCF10A細胞與表達Pten-398A的MCF10A細胞在正常培養條件下的生長速率均無差異(圖3A和補充圖5C)。對細胞進行不同的基因毒性脅迫處理:IR、順鉑和柔紅霉素。在所有條件下,Pten398A/398AMEFs和PTEN-398A表達的MCF10A細胞對基因毒性脅迫的抗性均高于野生型PTEN的細胞(圖3BD和SupplementaryFig.5D,E)。通過流式細胞儀AnnexinV染色判斷(圖3E)。通過使用caspase-3抗體對Pten+/+、MMTVneu和Pten398A/398A、MMTVneu**進行免疫組化染色,證實了這些觀察結果。caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細胞的標志物。 血清代謝產物的豐度也發生了***變化.寧夏標書實驗可參觀
4、miR-208b直接靶向和抑制CD4+T細胞中PDCD4的表達
為了進一步探究miR-208b的分子機制,探究了其下游靶基因機制,使用生信預測了其靶基因,**終挑選到PDCD4(圖5A)。熒光素酶進一步證實了miR-208b和PDCD4之間的結合(圖5C-D)。研究發現,T細胞中PDCD4的表達在SW480外泌體處理組***下降,而這個抑制作用在SW480-OXA組更加明顯,PCD表達在miR-208b缺失組則***升高(圖5E)。此外,加入miR-208bmimics后,PDCD4蛋白***降低,而抑制miR-208b后,PDCD4蛋白的表達相對增強,此外,PDCD4在mRNA水平的表達沒有明顯變化(圖5F)。然后,評估了miR-208b對CD4+T細胞擴增的影響。研究表明,轉染miR-208bmimics***增強了Treg的擴增,而抑制miR-208b水平則抑制了Treg的擴增(圖5G-H)。這些結果表明miR-208b直接靶向抑制PDCD4的表達,導致Treg分化。 海南標書技術指導大部分circSDHC定位于細胞質.
。***,用新的基于文獻的化學同義詞增強了CTD化學頁面(以改進查詢),并添加了1600個基于氨基酸的化合物(以增加化學景觀)。總之,這些更新繼續增強CTD作為一個強大的資源,以產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。
首先這是首頁界面,可以根據自己想了解的疾病、化學品、基因和通路等進行搜索。我們以氣道梗阻為例,首先進入視野的就是進本信息,然后是化學品與基因相互作用,其次是氣道梗阻相關化學品,之后是氣道梗阻相關基因,***還有表型和通路相關數據。
褪黑素可挽救TBI后皮層的鐵蓄積和神經元損傷
為了進一步研究褪黑素在TBI后鐵蓄積和神經元損傷中的假定作用,在TBI后第3天,在受傷的皮層中觀察到了Fe2+,Fe3+,總鐵含量顯著增加。而褪黑素或Lip-1抑制TBI誘導的血清和同側皮層中鐵含量的上調的。Perls的藍色染色表明,TBI后第7天鐵陽性細胞的數量顯著增加,褪黑素或Lip-1***組的鐵陽性細胞少于對照組。鑒于TBI誘導的鐵超載伴隨著Fth表達的上調,使用免疫熒光染色觀察了TBI后神經元中Fth的表達。發現與假手術組相比,模型組中Fth陽性神經元的***增加,而褪黑素和Lip-1處理顯著降低了Fth陽性神經元。與假手術組相比,受傷的神經元的細胞體在TBI后7天出現胞質萎縮或核固縮。褪黑素和Lip-1處理可減輕這些組織病理學變化。TBI后第7天,FJB染色測定腦部神經元變性,發現TBI導致大腦皮層變性神經元的數量增加,但是褪黑素和Lip-1給藥明顯減少了變性神經元的數量。這些數據表明褪黑素可防止TBI誘導的鐵蓄積并防止同側皮質的神經元損傷。 circNDUFB2通過增強泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩定性。
使用SmartSeq2協議對15個胎兒的單個細胞進行scRNA-seq處理(圖1 a)。
基于差異表達(DE)分析和按標準化表達***性排序的前20個標記基因。紅細胞(表達HBG1、HBA1、GYPA和ALAS2)、mk(表達FLI1、ITGA2B和GP9)、單核細胞祖細胞和單核細胞(表達CD14、MPEG1和CD33)、CD4+單核細胞、肥大細胞(表達CD63、GATA2和HDC)、漿細胞樣樹突狀細胞(pDCs;表達IL3RA,IRF8,MPEG1和JCHAIN)和另一簇高循環pDCs(表達pDC和增殖標記物;例如,MKI67)和粒細胞1、2和3(表達AZU1、MPO和PRTN3)(圖1B)單細胞分析顯示,在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在***的轉錄異質性,一些表型祖細胞群體(如造血干細胞、MPPs、cmp、gmp、MEPs和CLPs)由超過10個不同的轉錄定義群體組成(圖1c).注釋了23個不同群體(圖1 d). FMT處理調節SCI小鼠的腸道微生物組成。云南標書省自然科學基金
體外實驗證實circNDUFB2過表達******NSCLC細胞的增殖遷移和侵襲.寧夏標書實驗可參觀
IGF2BP結合區域包含“GGAC”N6-甲基腺苷(m6A)**基序。IGF2BPs是m6A結合蛋白。為了探索circRNA和IGF2BP之間的相互作用是否通過m6A依賴性的方式進行調節,對circNDUFB2進行了MeRIP,并觀察到circNDUFB2中m6A的顯著富集。敲低METTL3和METTL14顯著降低了circNDUFB2中m6A修飾的水平,并且沒有改變circNDUFB2的水平。METTL3/14敲低顯著削弱了circNDUFB2和IGF2BP之間的相互作用。這些數據表明,circNDUFB2以依賴于m6A的方式與三個IGF2BP物理相互作用。circNDUFB2過表后IGF2BPs的mRNA無***變化,蛋白質水平***降低。此外,circNDUFB2突變體不影響IGF2BPs的蛋白質水平。因此推測circNDUFB2可能通過相互作用使IGF2BP蛋白失穩。發現circNDUFB2的過度表達***降低了IGF2BP蛋白的水平,這可以通過MG132(蛋白酶抑制劑)恢復。circNDUFB2***增加了IGF2BPs的泛素化水平,但這種作用因其突變而受損。這些結果表明circNDUFB2通過促進泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩定性。寧夏標書實驗可參觀
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗