為了探究MIR210HG是否參與了一個新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調控網絡,我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學數據庫來預測與HMGA2結合的mirna(圖3F)。選擇3個軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導的HMGA2構建物共轉染HEK293T細胞,共鑒定和篩選了110個miRNAs。轉染后,23個miRNA轉染細胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中,轉染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時,熒光素酶活性***降低,其中轉染miR-337-3p和miR-137時,熒光素酶活性降低**多。利用生物信息學數據庫TargetScan預測miR-337-3p和miR-137中與HMGA2結合的位點。雙熒光素酶基因報告基因檢測結果顯示,miR-337-3p和miR-137在其預測的結合位點上結合HMGA2(圖3H)。qPCR結果顯示,miR-337-3p和miR-137負調控HMGA2的表達(圖3I)。采用Pearson’s秩相關法分析MIR210HG與HMGA2表達的相關性,發現HMGA2的表達與MIR210HG呈正相關(圖3 J和K)。這些結果表明MIR210HG可能參與了新的MIR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2調控網絡。這些細胞表現出更強的攻擊性和增殖能力.河北標書技術指導
此外,生存分析顯示,EV中CD44v6和C1QBP高表達的患者的生存結局明顯較差(圖7F)。循環外泌體的隨訪數據也顯示了一致的結果。PDAC患者中循環外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于健康對照組(圖7G), PDAC伴有肝轉移的患者中循環外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的患者(圖7G)。免疫電子顯微鏡顯示,CD44v6和C1QBP在PDAC患者的循環外泌體***表達(圖7H)。高循環外泌體表達CD44v6和C1QBP的患者比其他患者更容易發生肝轉移 (圖7I)。然而,高表達循環外泌體CD44v6和C1QBP的患者生存率明顯較差(圖7J)??傊?,我們的研究結果證實了CD44v6和C1QBP在組織源性EV和循環外泌體中的表達可以預測PDAC患者的預后和肝轉移。
結論:我們揭示了原代PDAC細胞和HSCs之間通過PDAC來源的外泌體進行遠距離的細胞通信。此外,Pex通過促進肝纖維化微環境的形成來指示肝特異性轉移。更重要的是,我們發現外泌體CD44v6/C1QBP復合物傳遞到HSC的質膜上誘導IGF-1信號通路的***。外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物,也是***PDAC肝轉移的潛在靶點。 鐵死亡臨床醫學標書免費設計circRNAs在腎細胞*(RCC)中的表達模式和生物學功能.
為了確定CDK4 /6i誘導的記憶形成是否通過細胞周期的RB介導的G1期阻滯,用G1阻滯劑處理細胞,胸腺嘧啶,通過阻止DNA合成和進入S期,**于RB的誘導G1阻滯。結果顯示胸腺嘧啶處理的細胞表型復制了CDK4/6抑制,并在很大程度上挽救了Rb1 KO細胞中Tcm的形成(Fig. 3J) ,表明RB介導的G1阻滯本身有助于CDK4 /6i誘導的記憶分化。通過3'RNA-seq進一步分析Rb1 KO細胞,發現記憶相關基因下調和效應標記增加(圖3K-L),CDK4/6抑制后未能逆轉(圖3M-N)。這些結果表明CDK4/6i介導的轉錄重編程和記憶形成是通過RB依賴的G1細胞周期停滯和同時抑制CDK4/6信號轉導。
背景:在異種造血干細胞移植(allogeneichematopoieticstemcelltransplantation,allo-HSCT)中,供者來源的干細胞輸注被用于***各種類型的血液病和非血液病。在異種造血干細胞移植患者中,移植后人體腸道菌群發生變化,這可能部分歸因于******和調理方案。隸屬于隸屬于梭狀芽孢桿菌目丁酸生成菌在移植后早期的腸道中枯竭,而變形菌門和乳酸菌門(如腸球菌)豐度增加,可能由于缺乏丁酸時腸腔內的氧氣水平增加和***素耐藥性所致。然而,到目前為止,HSCT患者的微生物群動態主要在HSCT后的***個月進行詳細監測,而不是長期監測。因此,目前尚不清楚微生物群是否以及何時恢復到造血干細胞移植前類似微生物群落結構。circNDUFB2可通過破壞CARDs與其解旋酶結構域之間的分子內相互作用。
三、在體內,tbi介導的NCT缺陷和致死率被核輸出抑制劑抑制
為了確定TBI是否會損害體內的核質運輸,我們在果蠅運動神經元中過表達了一個帶有核定位序列(NLS)和核輸出序列(NES)標記的GFP蛋白(OK371-gal4)。在表達nlsnes -GFP的大腦中,GFP信號分布在細胞核和細胞質中(圖3A)。然而,定量分析顯示,在nls - nes -GFP表達的vnc暴露于TBI中,核GFP信號減少的細胞百分比***增加,而核GFP強度***降低(圖3B和C),說明GFP核進口受到抑制和/或GFP核出口增加。接下來,我們在運動神經元中表達了一種用NLS和突變的NES (ΔNES)標記的沒有核輸出活性的GFP蛋白。表達NLS的非創傷性腦損傷動物的腦細胞-ΔNES-GFP顯示了GFP在細胞核的強大定位(圖3A),而創傷性腦損傷動物的vnc顯示了核GFP減少的細胞數量***增加,核GFP強度降低((圖3B和C)。果蠅幼蟲暴露于TBI,并在DMSO單獨、KPT-350(0.05、0.1或0.5 mM)或KPT-276(50、200或1000 nM)上飼養。對經歷過TBI的果蠅幼蟲的羽化試驗顯示,KPT-350處理的動物(圖3D)或KPT-276處理的動物(圖3E)具有***的劑量依賴性的致死抑制。kpt -350處理的果蠅核GFP信號***高于dmso處理的對照組(圖3G)。 circSDHC是一個很有前景的RCC患者潛在的預后生物標志物和***靶點。蛋白組學標書省自然科學基金
探討SCI腸道微生物失調與神經炎癥之間的分子相互作用。河北標書技術指導
RIG-I對circNDUFB2誘導的免疫反應至關重要
RIG-I樣受體(RLR)家族可識別病毒RNA 會通過產生IFN和促炎性細胞因子來觸發針對病毒***的先天免疫反應。已經報道外源circRNA有效刺激由RIG-1介導的免疫信號傳導。從qRT-PCR分析獲得的數據表明,RIG-1敲低消除了circNDUFB2過表達誘導的免疫反應,RIG-1被circNDUFB2上調。為了研究circNDUFB2和RIG-I之間的關聯,進行RIP分析和RNA FISH免疫熒光實驗。 結果表明circNDUFB2與RIG-1結合,并且它們共定位在細胞質中。 circNDUFB2過表達后, circNDUFB2顯著上調了RIG-1,IRF7,IFNβ和TNF的蛋白水平,而circNDUFB2則不影響P65和IRF3的蛋白水平。 河北標書技術指導
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗