YTHDC2調節SLC7A11 mRNA的穩定性(圖5A-D),而控制RNA衰減是m6A甲基化的重要功能之一。作者先驗證METTL3刺激m6A的能力(圖5E、F)。在H1975細胞中敲降METTL3延長了SLC7A11 mRNA的半衰期,而在H1299細胞中過表達METTL3則加速了SLC7A11 mRNA的降解(圖5G)。此外,H1299細胞中降低METTL3表達阻斷了YTHDC2,從而減緩SLC7A11 mRNA的衰減,刺激胱氨酸攝取并減弱脂質活性氧(ROS)的生成(圖5H-J),這表明YTHDC2在LUAD細胞中的作用是依賴m6A。
6.YTHDC2傾向于相互作用并使m6A甲基化的SLC7A11mRNA不穩定
為了揭示SLC7A11mRNA中潛在的m6A甲基化位點,在H1975細胞中METTL3敲除前后分別進行了MeRIP-seq研究。在H1975細胞中,無論是否敲除METTL3,GGACmotif都高度富集于m6A位點(圖6A)。m6A峰在mRNA停止密碼子附近的3’非翻譯區(3’UTR)尤為豐富(圖6B)。為了進一步證實SLC7A11mRNA的m6A依賴性修飾,我們進行MeRIP-qPCR。在H1975細胞中,敲除METTL3后,SLC7A11mRNA中的m6A修飾明顯減少,特別是在假定的m6A位點周圍。相反,當METTL3在H1299細胞中過表達時,觀察到相反的結果(圖6C)。 阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配。黑龍江課題動物模型構建
導語:骨是一個動態***,通過破骨細胞和成骨細胞的協調產生自我修復潛力。衰老過程中骨的自我修復能力明顯受損。間充質骨祖細胞(OPCs)向骨形成表面的遷移是成骨細胞生成的初始步驟,OPCs的遷移能力在衰老過程中是否受到損害,以及它如何促成衰老相關的骨形成減少仍不清楚。***,lncRNA粉墨登場,演繹著不一樣的精彩故事。
1.衰老過程中骨形成減少伴隨OPCs向骨形成表面遷移減少,lnc-PMIF表達升高
收集衰老小鼠模型的骨標本,分析動態骨組織形態,發現老年小鼠的礦化沉積率(MAR)和骨形成率(BFR/BS)均***降低,表明衰老期間小鼠的骨形成減少。從小鼠中分離出BMSCs,RNA-Seq分析發現老年BMSCs中遷移相關基因均下調。老年和年輕小鼠BMSCs成骨誘導7d后ALP活性和成骨誘導14d后鈣礦物質沉積相當,表明BMSCs的成骨潛能在衰老過程中沒有改變。 吉林課題實驗可參觀TIMEOR用于推斷基因調控事件之間的關系。
例如,雖然之前認為抗PD-1可以阻斷**末期枯竭的T細胞上的PD-1信號,但這種直接模型已經受到質疑,表明PD-1成功阻斷可能作用于分化較低的類祖細胞,高比例的**浸潤**終耗盡的T細胞預測抗pd -1的耐藥。此外,雖然代謝相關因素,如**細胞消耗氧氣和產生缺氧的能力,可以預測對PD-1阻斷劑的抗性18,但這些環境壓力源已被證明對T細胞功能有不同的影響。缺氧誘導因子1α (HIF1α)及其負調控因子此前已被證實與T細胞***有關23,而在缺氧條件下***細胞的擴張可增強**殺傷能力。然而,無論是在隔離狀態還是在體內,缺氧都具有明顯的免疫抑制作用。因此,雖然代謝壓力和T細胞衰竭有聯系,但尚不清楚T細胞衰竭是否促進了導致細胞代謝改變的程序,或者是否代謝不足和壓力直接導致了T細胞衰竭。
七、股骨和肝臟細胞在不同細胞類型之間的統計學差異
HSC / MPP簇中的細胞來源于肝臟,股骨和髖部,這為評估起源于胚胎肝臟或骨髓的HSC/MPP群體中潛在的定性和定量差異提供了機會。研究者首先對處于不同細胞周期狀態的肝臟和股骨細胞的數量進行了Fisher精確檢驗。結果顯示,在股骨和肝臟中,絕大多數CD-REF細胞處于G0/G1期,而肝臟中處于S-G2-M期的細胞數量幾乎是股骨的兩倍。KS和MWW檢驗顯示,與肝臟相比,股骨中HSCs/MPPS中基因表達數量也比較少,但股骨中HSCs/MPPs***上調了與核小體組裝、染色質組裝和DNA組裝有關的基因,而肝臟中HSC/MPPs***上調了與肌動蛋細胞骨架重塑、細胞粘附和遷移有關的基因。 根據自身需要檢索相關基因或者化學品。
遷移體(migrasome)是清華大學生命科學院俞立團隊新發現的胞外分泌囊泡,該研究成果已于2015年發表在CellResearch期刊(IF=)[1]。遷移體是在遷移細胞后部回縮纖維的或交叉處生長的大囊泡,直徑約為μm到3μm,并且包含許多較小的囊泡(**多300余個,**少不足10個),掃描電子顯微鏡觀察下呈石榴狀結構。細胞遷移后,回縮纖維**終斷裂,遷移體分離。遷移體及其內容物,包括細胞溶質成分和來源不明的囊泡,被釋放到細胞外空間——這一過程稱為遷移。俞立團隊推測遷移體可能在細胞間通訊中發揮重要作用。2017年俞立團隊進一步研究發現,整合素與ECM蛋白的配對結合決定了遷移體的形成[2],該研究成果也發表在CellResearch期刊。2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法[3]。2019年,俞立團隊發現Tspan4和膽固醇在遷移體形成時組織成為微米級大型微結構域,這一結構即遷移體的基本結構,還證實遷移體的形成是局部富集的Tspan4使遷移體所在膜結構的剛度增加而產生的一種生物物理過程[4],該研究成果發表于NatureCellBiology期刊中(IF=)。并同年在同期刊中發表,遷移體在斑馬魚原腸胚形成中影響***形態發生,Tspan4a和Tspan7。促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。糖尿病課題服務價格
了解客戶的研究方向以及所能提供的樣本類型和樣本量確定研究思路。黑龍江課題動物模型構建
7)FOXO3A/LINC00926/PGK1軸調節乳腺***生長和肺轉移
為了證實FOXO3A/LINC00926/PGK1通路的體內表型,我們首先通過將MDA-MB-231細胞注射到BALB/c小鼠的乳腺脂肪墊上,研究了LINC00926/PGK1軸對乳腺*生長的影響。與預期的一樣,下調LINC00926***增加了乳腺**的生長。相反,當PGK1被敲除時,**生長被抑制。更重要的是,當PGK1被敲除時,LINC00926敲除對**生長的影響***減弱(圖7A-7C)。接下來,我們研究了FOXO3A/LINC00926軸對乳腺*生長的影響。結果顯示FOXO3A過表達***降低了乳腺*的生長。當LINC00926敲低時,**生長增加,FOXO3A過表達對**生長的影響***減弱(圖7D-7F)。接下來,我們研究了該途徑對乳腺*轉移的影響。與對照組相比,LINC00926基因抑制組在整個肺區域擴散的結節數量明顯增加(圖7G)。相反,PGK1基因敲低導致乳腺*細胞向肺轉移擴散的減少。然而,PGK1下調極大地減弱了下調LINC00926調節肺轉移的能力(圖7G)。與**生長實驗結果一致,下調LINC00926***減弱了FOXO3A調控肺轉移的能力(圖7H)。 黑龍江課題動物模型構建
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗