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來源: 發布時間:2021-10-27

4)LINC00926通過增強STUB1介導的泛素-蛋白酶體途徑調節PGK1蛋白的穩定性

亞細胞定位結果顯示,LINC00926主要定位于細胞質,FISH實驗進一步證實了這一點(圖4A和4B)。結合LINC00926沒有改變PGK1mRNA水平的事實,我們推測LINC00926在轉錄后水平下調了PGK1的表達。事實上,蛋白酶體抑制劑MG132的加入阻斷了LINC00926過表達介導的PGK1降解,這表明泛素-蛋白酶體途徑參與了LINC00926對PGK1蛋白穩定性的調節(圖4C)。LINC00926過表達增加PGK1泛素化(圖4D)。下調LINC00926基因后,PGK1蛋白水平升高,泛素化水平降低(圖4E)。為了尋找負責LINC00926調控PGK1蛋白穩定性的E3泛素連接酶STUB1,我們接下來通過RNA下拉實驗確定了LINC00926在乳腺*細胞中的蛋白伴侶。質譜分析結果顯示了特異性差異表達譜帶。 zVAD預處理也略微增加了IR后PTEN-398A細胞中未解決的DNA損傷灶的數量。電鏡課題整體服務

RIG-I對circNDUFB2誘導的免疫反應至關重要

RIG-I樣受體(RLR)家族可識別病毒RNA 會通過產生IFN和促炎性細胞因子來觸發針對病毒***的先天免疫反應。已經報道外源circRNA有效刺激由RIG-1介導的免疫信號傳導。從qRT-PCR分析獲得的數據表明,RIG-1敲低消除了circNDUFB2過表達誘導的免疫反應,RIG-1被circNDUFB2上調。為了研究circNDUFB2和RIG-I之間的關聯,進行RIP分析和RNA FISH免疫熒光實驗。 結果表明circNDUFB2與RIG-1結合,并且它們共定位在細胞質中。 circNDUFB2過表達后, circNDUFB2顯著上調了RIG-1,IRF7,IFNβ和TNF的蛋白水平,而circNDUFB2則不影響P65和IRF3的蛋白水平。 多細胞亞型TIMEOR是***個基于 Web 的自適應時間序列多組學管道方法。

作者構建了 (WT) SLC7A113’-UTR和突變型(Mut) 3’-UTR兩種質粒(圖6H)。結果表明,只有過表達YTHDC2WT降低SLC7A11 mRNA在H1299細胞中的穩定性,敲除YTHDC2可以提高SLC7A11 mRNA在H1975細胞中的穩定性。然而,與WT 3’-UTR相比,Mut報告基因的這些作用減弱(圖6I和J)。在檢測外源性F-Luc-SLC7A11融合mRNA的RNA穩定性后,得到了類似的結果(圖6K-M)。總的來說,3’-UTR上的m6A位點對于YTHDC2使SLC7A11 mRNA不穩定至關重要。

7.抑制YTHDC2對XC-系統靶向***敏感,并與LUAD進展相關

為了評估YTHDC2抑制在LUAD中的重要性,從cohort#1隨機抽取20例YTHDC2lowLUAD,其中50%屬于腺泡型(圖7A)。在cohort#2中,與相鄰組織相比,**中YTHDC2表達下調,62%(62/100)的腺泡組織被歸類為YTHDC2low(圖7B、C)。與無這種表達模式的腺泡性LUAD患者相比,YTHDC2low的患者總生存期要短得多(圖7D),進一步表明YTHDC2抑制可能對腺泡性LUAD的**進展尤為重要。另外,相對于*旁組織,**中腺泡LUAD組織中SLC7A11mRNA和蛋白水平表達量都比較高(圖7E、F)。

2、CDK4/6i介導的CD8+T細胞記憶獲得是細胞固有的

為了確定在CDK4/6i處理的**中觀察到的T細胞記憶是否由于CDK4/6在這些細胞內的直接抑制,在體外將活化的小鼠CD8+T細胞暴露于CDK4/6i中,并監測Tcm獲取和分裂數。***CDK4/6i暴露0、24、72h后,Tcm細胞平均分裂數減少,同時細胞比例增加,且呈劑量依賴性,*在24h內發生(Fig.2A)。這表明CDK4/6i不是簡單地抑制分化,而是直接促進記憶形成,表明細胞周期機制與分化之間存在方向性關系。通過3'RNA-seq進一步分析發現,在CDK4/6i處理后,記憶相關轉錄本增加,GSEA分析證實了記憶相關特征的富集,以及細胞周期相關特征的減少,包括E2F靶點(Fig.2B-E)。矛盾的是,CDK4/6抑制也誘導了效應相關轉錄本,包括Gzma、Gzmc和Pdcd1(Fig.2B-C),這與之前CDK4/6i促進T細胞活化的報道一致。 課題CRO服務找上海英拜。

特色lncRNA基因

LncExpDB 表征了在特定細胞系/組織中特異性表達、在**或病毒***背景下差異表達、在特定細胞器中富集、在細胞分化或胚胎/***發育過程中動態表達或隨晝夜節律周期性表達的特征 lncRNA 基因韻律?;诖罅縍NA-seq數據,共鑒定出25191個特征lncRNA,其中***發育7922個,正常組織/細胞系7498個,亞細胞定位5292個,植入前胚胎4343個,*細胞系2907個,1740個晝夜節律,外泌體中為 1538,細胞分化中為 1232,病毒***中為 985。

LncRNA-mRNA相互作用

為了促進對特征 lncRNA 分子機制的深入研究,LncExpDB 通過共表達網絡預測 lncRNA-mRNA 相互作用。LncExpDB 總共包含 28 443 865 個預測的 lncRNA-mRNA 相互作用;這些相互作用中的大多數 (96.4%) 存在于一種生物環境中,并且在五種環境中發現了 12 種相互作用。 根據自身需要檢索相關基因或者化學品。調控因子

也是***PDAC肝轉移的潛在靶點。電鏡課題整體服務

PTEN表達檢測的總有效率約為70%,而PTEN表達陰性患者的總有效率*為20%。PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩定性有關。此外,小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中,PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合,促進著絲粒組裝和中期到后期的轉變。此外,作為轉錄因子E2F1的輔助因子,核PTEN似乎調節Rad51的表達,Rad51是DNA修復機制的關鍵組成部分。然而,后續的研究得出了不一致的結果,表明PTEN在轉錄水平上對RAD51的調控可能***于特定的細胞環境。PTEN缺陷改變了多個細胞周期檢查點,可能留下更少的時間進行DNA損傷修復和/或染色體分離。細胞周期的進展需要幾個分子過程的完美執行,以確保一個熟練的,無錯誤的,細胞分裂。這些事件發生的速度由周期蛋白依賴激酶(CDKs)的活性決定,CDKs磷酸化關鍵底物以促進DNA合成和有絲分裂進程電鏡課題整體服務

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎

2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。

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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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