由于p65轉位到細胞核并促進其靶向基因的轉錄,假設NFκB/p65信號通路的***可通過p65的轉錄活性上調miR-934表達。在p65和miR-934啟動子之間發現了5個潛在的轉錄結合區域和2個特異性結合位點(Fig. 8d)。隨后,用miR-934啟動子中含有p65結合區域的載體轉染SW480和RKO細胞;ChIP實驗證明p65對miR-934的轉錄在-2002和-1500 bp(區域1)之間的區域內***增高,在其他四個結合區域中未觀察到明顯變化(Fig. 8e)。這些數據表明,區域1可能在調節CRC細胞中p65介導的miR-934轉錄誘導中起關鍵作用。熒光素酶報告基因檢測證實p65對SW480和RKO細胞中miR-934啟動子的轉錄影響(Fig. 8f)。作者發現只有突變結合位點1可以下調p65的熒光素酶報告基因活性,抑制miR-934的轉錄表達,這證明p65可以通過結合位點1正向直接調節miR-934的表達(Fig. 8f)。此外,作者證明了SW480和RKO細胞中的突變結合位點1可以消除CXCL13的促進作用和NFκB/p65信號對miR-934表達的抑制作用(Fig. 8g,h)。綜上所述,這些結果證明CXCL13/CXCR5/NFκB/p65信號通路促進CRC細胞中miR-934的轉錄,形成一個正反饋回路,參與持續的M2巨噬細胞極化和CRC細胞的侵襲和轉移。也是***PDAC肝轉移的潛在靶點。醫學基礎實驗課題協同創作
在s-flow條件下,KLF4的TF結合基元在E2中富集,而NRF1在E3和E4中富集(所有流條件下)(圖6B)。相比之下,暴露于d-flow條件下的E5 E8中,TEF、ETV3、RELA、FOS::JUN、TEAD1和STAT1的TF基序富集(圖6C)。對一些眾所周知的流量敏感tf的基模的鑒定,KLF4(與KLF2基模相同),FOS:JUN (AP1), RELA和TEAD1證實了我們分析的有效性。為了進一步確定新發現的TF結合基序是否也與流量依賴反應相關,我們檢測了phospho -STAT1水平是否對流量敏感,作為STAT1***的標記。pcl術后2周,與RCA相比,CDH5+ LCA的ECs中phosphoSTAT1水平***升高(圖6D和6E)。機制研究課題潤色服務soRNA測序的 整套服務。
自噬“貨物”是有選擇性裝載的,其中主要依靠LIR基序與LC3互作,形成自噬體。隨后,自噬體進行運輸、溶解。研究表明,自噬異常會影響疾病進程。**中的自噬具有雙重作用:一方面自噬的發生會增強*細胞的生存能力;另一方面,抑制自噬會造成“廢物”的積累、基因突變等,誘發**。
1、Meta-GWAS分析
收集三組GWAS數據用于meta分析,確定了35個基因區域中36個**的基因突變(p<5×10?8)。接下來,分析SNP200kb內與AD***相關(p<10-5)的突變,篩選獲得PRKD3/NDUFAF7,SHARPIN,CHRNE,PLCG2,APP6個基因,這6個基因都存在于AD發病***相關的突變。
2、多基因風險評分(PRS)
為了評估AD遺傳景觀的穩健性和綜合效應,基于39個遺傳變異(不包括APOE基因型)構建了一個加權PRS。
接下來測試了RPS與臨床診斷的關聯。PRS與臨床診斷的AD病例的關聯與病理證實的AD的關聯相似;在伴隨的腦部病變(除AD之外)存在的情況下PRS與AD相關;在不同性別中,RPS與AD的相關性無差異,并且在早發型、晚發型中效果一致。
3、PRS有可能及早識別有風險的受試者
使用12,386例樣本分析RPS能否識別早發型AD(AAO),結果表明,PRS與APOE基因型相結合,可能對AAO進行有效的預測。
腸道菌群與結直腸*(CRC)之間的關聯已被***研究。然而,用于多個人群的早期診斷標記仍然難以捉摸。本研究對1056例糞便樣本進行了綜合分析,以確定與CRC相關的微生物作為早期檢測CRC的標志物。
對來自4項研究的16srRNA測序進行分析,評估隨著CRC進展(無疾病-腺瘤-結直腸*)腸道微生物的變化,并鑒定出針對腺瘤的為微生物標志物。
2.構建腺瘤微生物模型
除了使用差異ASV作為關鍵指標,模型構建中還包括α多樣性指數(Shannon指數,Simpson指數和ObservedASV)以及三個患者臨床指標(年齡,性別和體重指數(BMI))。**終構建了包括八個差異性ASV(作為生物標記物)以及年齡,性別和BMI為**的模型,可區分對照對象與腺瘤患者(準確度:0.73,敏感性:0.82,特異性:0.62,精度:0.73,F1得分:0.77)。其中,用ASV區分腺瘤和**的RF模型達到了0.89的AUC(精度:0.80,靈敏度:0.66,特異性:0.90,精度:0.83和F1得分:0.72)。 Pex調節HSC的ECM分泌。
**調節因子通常作為蛋白質復合物中的亞基存在,并以多種方式參與轉錄調控,例如通過調節組蛋白修飾和染色質結構。哺乳動物BRG1-或brm相關的染色質重塑復合物(BAF, SWI/SNF)改變了*細胞染色質可及性景觀。該復合物是細胞周期和增殖的關鍵調控因子,也是前列腺*的驅動因子,具有多種**特異性作用。此外,頻繁發生的TMPRSS2-ERG融合基因易位可使BAF復合物重新靶向于染色質,促進前列腺*的發生。互斥的ATPase亞基BRG1 (SMARCA4)和BRM (SMARCA2)是復雜功能的關鍵組件。此外,AR與DNA序列特異性轉錄因子(如FOXA1、GATA2、ERG和HOXB13)之間的合作已經建立。TF FOXA1可以結合到封閉的染色質區域,調節其染色質可及性,從而促進AR結合染色質引發PCa。產生關于環境影響疾病的病因和分子機制的可測試的假設。焦亡活化課題一站式
caspase-3抗體是一種***用于檢測凋亡細胞的標志物。醫學基礎實驗課題協同創作
通過半定量分析,胃*組織中MAPK1-109aa水平較正常胃組織中降低。Kaplan-Meier生存分析顯示,MAPK1-109aa表達水平較高的胃*患者總生存期明顯長于MAPK1-109aa表達水平較低的胃*患者(圖4h)。一系列GC細胞系中MAPK1-109aa的含量也明顯低于正常胃粘膜細胞系GES-1。在內源性circMAPK1水平較低且幾乎沒有MAPK1-109aa表達的MKN45細胞中,轉染circMAPK1和MAPK1-109aa質粒均產生預測的MAPK1-109aa帶,而過表達circMAPK1IRES突變質粒則沒有產生預測的MAPK1-109aa帶(圖4i)。相反,在內源性circMAPK1和MAPK1-109aa更高表達的GES-1細胞中,發現兩種特異性靶向circMAPK1連接的shRNA***降低了MAPK1-109aa的表達(圖4j)。使用anti-flag抗體進行免疫熒光檢測,證實MAPK1-109aa-Flag位于過表達MAPK1-109aa-Flag質粒的MKN45細胞的胞質中,如圖4k所示。醫學基礎實驗課題協同創作
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1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗