蛋白組學課題創新服務

來源: 發布時間:2021-10-27

此外,circPDE4B不影響MID1水平(圖4E)。RPD和序列IP分析都顯示circPDE4B促進了RIC8A和MID1的結合(圖4F,G)。與這一發現相一致的是,體外結合試驗表明,circPDE4B增加了重組RIC8A和MID1蛋白之間的關聯(圖4H)。通過co-IP,MID1與RIC8A在N端調控域結合(圖4I)。此外,我們檢測了RIC8A的功能位點。在HCs中免疫沉淀RIC8A并進行MS分析,證實了RIC8A中氨基酸殘基的泛素化(圖4J)。在RIC8A、K143和K187中鑒定出10個泛素化位點,并且在人類和小鼠之間并不保守(圖4J)。因此,我們將保守的RIC8A位點從賴氨酸(K)突變為精氨酸(R),以排除泛素化。IP結果表明,與WT相比,K415的取代**降低了RIC8A的泛素化位點(圖4K)。有趣的是,K415在哺乳動物中高度保守(圖4L,M)。此外,在K415突變后,circPDE4B過表達或抑制不再調節RIC8A的泛素化水平(圖4N)。這些結果表明circPDE4B可以作為促進RIC8A和MID1之間聯系的支架。根據自身需要檢索相關基因或者化學品。蛋白組學課題創新服務

4)SsD通過直接抑制FTOm6A去甲基化活性來誘導m6A修飾

為了檢測m6A在RNA上的變化,我們在SsD處理的白血病細胞中進行了m6A點印跡實驗。如圖4A所示,SsD***增加了m6A在轉錄組中的豐度。此外,HPLC-MS/MS定量證實了SsD處理的NB4和Kas-1細胞mRNA中細胞m6A的增加(圖4B)。接下來,我們檢測了FTO的兩個直接靶點MYC和RARA在SsD處理的細胞中的表達。SsD在mRNA和蛋白水平***下調了NB4和Kas-1細胞的MYC,而上調了RARA(圖4C-D)。有趣的是,SsD依賴的MYC和RARA的減少是由于FTO過表達細胞中mRNA和蛋白穩定性的降低(圖4E-4H)。綜上所述,這些結果證明了FTO及其下游靶點(如MYC,RARA)是FTO過表達白血病細胞中SsD的主要效應因子。 安徽課題創新服務提供整體課題外包實驗構思。

2021年,來自加拿大多倫多大學和加拿大溫哥華英屬哥倫比亞大學等團隊合作在Nature communication雜志上發表了文章“Biological and therapeutic implications of a unique subtype of NPM1 mutated AML.”。此報道描述了npm1突變AML患者的分子異質性。基于rna-seq的基因表達譜分析,確定了兩種新亞型,稱為原始型和committed型。基于基因表達、表觀基因組(ATAC-seq)和免疫表型(CyToF)的差異,在**的AML隊列中將亞型與特定的分子特征、疾病分化狀態和患者生存聯系起來。此外,表明了在缺乏FLT3-ITD的原始特征病例的***中添加激酶抑制劑對AML可能有***益處。

作為一種典型的G蛋白偶聯受體, DRD2的內化誘導其受體β-arrestin2在質膜上的募集,并增加其與β-arrestin2的親和力。LPS和CM刺激了DRD2和β-arrestin2的蛋白-蛋白結合(圖5F-G)。同時,通過IF染色觀察到,經過LPS處理后,DRD2似乎在細胞質中與p-p65結合(圖5A), Co-IP和IB進一步證實了這種結合(圖5F)。據報道,β-arrestin2信號的***會破壞星形膠質細胞中TAK1-Tab1的結合,而這種結合對于TAK1的***至關重要。本研究還證實,內化的DRD2可以促進TAB1與β-arrestin2的結合,削弱TAB1與TAK1的結合(圖5H)。綜上所述,DRD2***的β-arrestin2通過競爭性地結合TAB1來拮抗TAK1的磷酸化。小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現典型的外泌體結構。

6.YTHDC2傾向于相互作用并使m6A甲基化的SLC7A11mRNA不穩定

為了揭示SLC7A11mRNA中潛在的m6A甲基化位點,在H1975細胞中METTL3敲除前后分別進行了MeRIP-seq研究。在H1975細胞中,無論是否敲除METTL3,GGACmotif都高度富集于m6A位點(圖6A)。m6A峰在mRNA停止密碼子附近的3’非翻譯區(3’UTR)尤為豐富(圖6B)。為了進一步證實SLC7A11mRNA的m6A依賴性修飾,我們進行MeRIP-qPCR。在H1975細胞中,敲除METTL3后,SLC7A11mRNA中的m6A修飾明顯減少,特別是在假定的m6A位點周圍。相反,當METTL3在H1299細胞中過表達時,觀察到相反的結果(圖6C)。 提供生物醫學領域內的課題思路設計。海南課題中標率高

高通量測序后續的機制實驗。蛋白組學課題創新服務

DNA生物標志物

DNA生物標記物是MarkerDB中比較大的一類標記物。MarkerDB中的DNA生物標記進一步分為26021個與209種疾病相關的DNA突變標記、353個與70種疾病相關的SNP標記和23個與16種傳染病相關的微生物/病毒基因。DNA突變數據(和臨床批準的突變試驗)來自Genetic Testing Registry,序列數據從GenBank中提取,DNA SNP生物標記物的主要來源是數據庫GWAS-ROCS,疾病信息從OMIM或Genetics Home Reference中提取,關于微生物/病毒生物標記基因的剩余數據通過原始文獻或專利檢索獲得。目前,MarkerDB中的所有DNA標記都有一個或多個疾病關聯,以及MarkerDB ID、序列(標記了疾病變體)、詳細的基因描述(編碼區范圍內)、基因名稱/同義詞、一個或多個文獻參考和到其他在線數據庫的外部超鏈接。 蛋白組學課題創新服務

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎

2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。

3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究

4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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