二代測序

來源: 發布時間:2021-10-27

Pex誘導肝纖維化微環境,促進PDAC肝轉移從小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現典型的外泌體結構,大小約為50-150nm(圖1A,B)。進一步的westernblot分析證實了分離的外泌體的存在(圖1C)。為了確定Pex在PDAC肝轉移中的作用,我們首先進行了“教育”程序,并進一步通過脾內注射建立了PDAC肝轉移模型(圖1D)。在“教育”過程后,STE和原子力顯微鏡(AFM)顯示,與Npex組相比,Pex組小鼠的肝臟剛度***增加(圖1E,F)。此外,肝組織膠原密度增加(圖1G),肝ECM明顯重構(圖1H,I)。同樣,PDAC原位植入模型也顯示原位**可增加肝臟膠原沉積。肝轉移模型顯示,與Npex組相比,Pex組肝轉移更多,肝質量更高(圖1J)。這些數據表明,Pex可以通過重構肝臟ECM來誘導肝纖維化微環境,促進PDAC肝轉移英拜生物致力于分子生物行業十余年。二代測序

人PTC組織中tRFs和tiRNAs的表達為了鑒定人PTC組織中的tRFs和tiRNAs,收集3對PTC*組織和*旁組間,用于高通量測序,其結果比對至tRNAlibraryGtRNAdb文庫,并從中去除線粒體tRNA。**終累計獲得1723個tRN**段,其中594個片段只存在于**組織,136個只存在于*旁組織(圖1A-B)。成分分析顯示,**中tiRNAs的數量遠超*旁組織,而tRFs則主要存在于*旁(圖1C)。火山圖可以看出5個在**組織中***上調的tRN**段:5’-tiRNA-Gly-GCC,5’-tiRNA-Lys-CTT,5’-tiRNA-Glu-CTC,5’-tRF-Val-CAC,pre-tRNA-Ser-TGA(Fig.1D)。圖1E顯示tRN**段1260,1293,1297和1385明顯來源于**組織。tRN**段1293和1297都是5’-tiRNA-Gly-GCC剪切自tiRNA-Gly-GCC的不同部分的。tRN**段1260切割自tRNA-Glu-CTC,tRN**段1358切割自tRNA-Lys-CTT。課題整包課題實驗外包提供整體課題外包實驗構思。

為了進一步研究MAO-A是否作為巨噬細胞自主因子直接調控TAM極化從而影響抗**免疫,進行了巨噬細胞過繼轉移**實驗。從Maoa WT和KO小鼠中獲取BM細胞,然后培養成骨髓源性巨噬細胞(bone marrow macrophages, BMDMs)。然后將這些Maoa WT或KO BMDMs與B16-OVA黑色素瘤細胞混合,皮下注射到BoyJ WT受體小鼠中建立實體**(圖2g)。在本實驗中,MAO-A缺乏的比較***于TAM細胞。在接受Maoa KO BMDMs小鼠中觀察到**生長抑制(圖2h-i),TAM免疫抑制markers下調(圖2j),免疫刺激markers上調(圖2k-l),以及增強**浸潤CD8+T細胞***(圖2m)。綜上所述,這些體內研究表明MAO-A作為一種直接調節TAM極化的自主因子,從而影響T細胞抗**反應性和影響**生長。

4)Pex來源的CD44v6對于HSCs的***是必要的,但不是充分的

我們之前的研究揭示了CD44v6參與調控PDAC細胞的IGF-1通路。因此,我們首先驗證了CD44v6在外泌體中的表達,發現CD44v6在Pex中的表達水平明顯高于Npex(圖5A)。為了研究CD44v6是否能夠被傳遞到受體細胞中,我們采用蛋白合成抑制劑環己酰亞胺檢測加入Pex后CD44v6的蛋白水平。westernblot分析顯示,加入Pex后,HSCs中CD44v6的表達水平明顯增加(圖5B)。與Npex-孵育的細胞相比,CD44v6的表達水平保持不變(圖5B)。我們還進行了免疫熒光分析,檢測出HSC膜中CD44v6與Pan-cadherin共定位(圖5C)。這些結果表明,Pex可將CD44v6輸送到HSC膜 IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。

抑制piRNA-30473可降低DLBCL的發生

為了進一步探索piRNA-30473在DLBCL中的功能作用,作者使用antiagomir-30473在DLBCL細胞中去除piRNA-30473。結果發現,與對照組相比,在DLBCL細胞中耗盡piRNA-30473導致增殖減少(圖2A)。此外,細胞周期分析顯示,在DLBCL細胞中抑制piRNA-30473可以增加G1期細胞的比例,減少S期和G2期細胞的比例(圖2B,2C)。然而,耗盡piRNA-30473并不誘導細胞凋亡(圖2D)。此外,通過SU-DHL-8異種移植DLBCL模型,以評估piRNA-30473對體內DLBCL進展的影響(圖2E)。結果發現,抑制piRNA-30473抑制**增長(圖2F)。這些數據表明沉默piRNA-30473可以抑制DLBCL細胞在體內和體外的活性。 高通量測序后續的機制實驗。rip

soRNA測序的 整套服務。二代測序

2、miR-138-5p介導*細胞誘導的巨噬細胞KDM6B表達抑制構建了miR-138-5p過表達的乳腺*細胞系,取其培養基與巨噬細胞共培養,結果巨噬細胞中miR-138-5p表達***上調,同時KDM6B的表達***下降。證實miR-138-5p介導*細胞誘導的巨噬細胞KDM6B表達抑制。

3、*細胞來源的外泌體miR-138-5p下調KDM6B的表達

隨后為了判定上述巨噬細胞中miR-138-5p表達上調的原因,檢測了巨噬細胞中原代(pri-)和前體(pre-)miR-138的水平。結果顯示共培養和對照組間原代和前體miR-138的水平沒有差異,表明miR-138-5p是外源供應的(圖1A)。此外,使用RNaseA處理miR-138-5p水平不變,使用TritonX-100其水平***下降。提示miR-138-5p被膜狀結構包裹(圖1B)。進一步分析表明使用外泌體抑制劑GW4869處理組和外泌體刪除組的培養基中miR-138-5p的表達***下降(圖1C)。表明外泌體來源于乳腺*細胞。 二代測序

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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