由于circMAPK1在GC細胞系中穩定表達,我們推測circMAPK1可能是一種適合GC診斷或預后的標志物。qRT-PCR顯示circMAPK1在*組織中的表達低于匹配的非*組織(圖1m)。Kaplan-Meier生存分析顯示胃*組織中circMAPK1水平較高的患者總生存期***延長(圖1n)。綜上所述,circMAPK1是一種穩定表達的circRNA,可作為有效的診斷和預后標志物,值得進一步研究。
2)CircMAPK1在體外抑制GC細胞的增殖和遷移
為了研究circMAPK1在GC中的生物學功能,我們進行了一系列細胞實驗。隨CCK8實驗(圖2a)、集落形成實驗(圖2b)和EdU實驗(圖2c)結果表明,沉默circMAPK1可***增強GC細胞的增殖能力。我們發現circMAPK1的減少增加了S期GC細胞的數量(圖2d)。Transwell(圖2e)試驗顯示circMAPK1的干擾促進了GC細胞的遷移。此外,過表達circMAPK1***削弱了GC細胞的增殖能力。同樣,過表達circMAPK1時,S期GC細胞的數量***減少,細胞遷移受到抑制。綜上所述,circMAPK1在GC細胞的增殖和遷移中起著重要作用。 可以推斷基因調控事件之間的關系。國自然課題科技檢測
五、NF-κB調節表達VCAM1的近端小管亞群的分子特征
檢測了一組近端小管細胞,VCAM1的表達和染色質可及性增加,我們將其命名為PT_VCAM1(圖1)。免疫熒光研究表明,VCAM1在近端小管上皮中呈散在分布的表達(圖5a)。我們的單細胞研究估計PT_VCAM1占總細胞數的2%,近端小管上皮細胞數的6%。我們還證實,在LTL+ PT細胞中,VCAM1+小管細胞占4.19 1.58%,而在腎皮質的UMOD+ TAL細胞中,VCAM1+細胞未被檢測到(圖5b)。雖然之前的研究表明VCAM1在亨利氏襻(dTL)的降肢表達,但我們*通過AQP1對腎臟切片進行鏈紋檢測,觀察到VCAM1在dTL的一個亞組表達(圖5c)。這些數據表明,VCAM1+小管細胞大部分位于皮質內近端小管內。與VCAM1+ PT細胞相比,有少數dTL小管表達VCAM1。免疫熒光分析確定了一個VCAM1+近端小管細胞亞群表達CD24或CD133(圖5d)。 肝脂肪變性課題CRO我們接下來研究了Pex對HSCs生物學行為的影響。
分化通常與T細胞接收的免疫信號有關:共刺激或細胞因子信號支持一種或另一種命運。然而,環境的代謝組成、檢測該環境的營養傳感器以及T細胞固有的代謝狀態也對決定分化的**終結果至關重要。代謝信號是理解的關鍵,因為T細胞的***和分化發生在各種代謝不同的組織環境。在**中,**細胞代謝的升高可以***改變T細胞所經歷的營養環境。我們之前的研究表明,T細胞浸潤**時存在嚴重的代謝缺陷:葡萄糖攝取能力受到抑制,功能性線粒體質量喪失,伴隨衰竭的發展。我們和其他人也表明,糾正這種錯誤的代謝狀態(通過各種方法)可以增強免疫功能,實現免疫***效果。
1、在響應CDK4/6抑制中瘤內記憶類CD8+T細胞的表現
為了***評價CDK4/6抑制對抗**T細胞免疫的影響,使用多模式單細胞測序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或對照處理的MC38-OVA**小鼠的瘤內T細胞群體(Fig.1A)。維度分析顯示MC38-OVA**中有10個不同的T細胞群(Fig.1B)。用CDK4/6i處理的**有較低頻率的CD4+調節性T細胞(Foxp3+Tregs),而CD8+記憶類T細胞頻率更高,以Tcf7、Sell、Bcl2和Cd7高表達為特征(Fig.1B-D)。CD8+T細胞池的基因動態表達揭示來源于CDK4/6i處理的小鼠的CD8+**免疫浸潤(TILs)向更早、更像干細胞的分化狀態傾斜(Fig.1E-F)。與此一致,較早出現假時間軌跡的細胞表達更高水平的記憶相關基因(Tcf7,Sell,Il7r),和更低水平的效應相關基因(Prf1,Gzmb)和耗損標志物(PD-1,TIM3)(Fig.1G)。 TRF測序課題整體服務。
miR-144在鼻咽*細胞釋放的EVs中高度富集
接下來,為了確定**分泌的miR-144是否具有通過EVs細胞外通信影響**-微環境串擾的能力,我們首先從C666-1、SUNE1和NP69細胞中分離EVs。透射電子顯微鏡(TEM)觀察發現,納米顆粒的直徑為30~100nm,每個囊泡呈杯狀(圖2A)。免疫印跡顯示,與相應的細胞裂解液相比,這些來自C666-1、SUNE1和NP69細胞的納米顆粒中存在常見的EVs特異性標記物,包括CD9、CD63和TSG101,而內質網膜蛋白calnexin明顯缺失(圖2B)。納米顆粒示蹤分析(NTA)進一步顯示EV的平均直徑為94.1nm(C666-1細胞)、90.5nm(SUNE1細胞)和68.5nm(NP69細胞)(圖2C)。此外,我們檢測了C666-1、SUNE1和NP69細胞衍生EVs的表面電荷(圖2D)。添加RNase對這三種細胞系的EVs中miR-144的表達沒有影響,而TritonX-100處理的細胞中miR-144的表達明顯降低,說明細胞膜對miR-144的表達具有保護作用(圖2E)。結果表明,這三種細胞系的EVs具有穩定的膜態,對RNA具有保護作用。通過qRT-PCR檢測EVs中miR-144的表達,結果顯示miR-144在鼻咽*細胞EVs中表達高水平(圖2F)。這些發現為miR-144在npc細胞來源的ev中上調提供了證據。 解決了對確定因果調節機制網絡的方法的關鍵需求。CRO課題分子生物學
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從各組小鼠中分離出外周血CD4+T細胞,結果顯示miR-208b-OE組中PDCD4的***下調,miR-208-KD組的結果則相反(圖7E和7F)。然而,在PDCD4mRNA水平上沒有觀察到差異(圖7G)。從血清中分離出外泌體,檢測miR-208b水平(圖7H)。如預期的,miR-208b在miR-208b-OE組中***升高,而miR-208b-KD組中miR-208b水平下降(圖7I)。這些結果表明,**分泌的miR-208b在體內可以充分地傳遞到CD4+T細胞中,抑制PDCD4的表達。此外,這種現象在奧沙利鉑***組更加***(miR-208b-OE+OXA和miR-208b-KD+OXA)。國自然課題科技檢測
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