7)FOXO3A/LINC00926/PGK1軸調節乳腺***生長和肺轉移
為了證實FOXO3A/LINC00926/PGK1通路的體內表型,我們首先通過將MDA-MB-231細胞注射到BALB/c小鼠的乳腺脂肪墊上,研究了LINC00926/PGK1軸對乳腺*生長的影響。與預期的一樣,下調LINC00926***增加了乳腺**的生長。相反,當PGK1被敲除時,**生長被抑制。更重要的是,當PGK1被敲除時,LINC00926敲除對**生長的影響***減弱(圖7A-7C)。接下來,我們研究了FOXO3A/LINC00926軸對乳腺*生長的影響。結果顯示FOXO3A過表達***降低了乳腺*的生長。當LINC00926敲低時,**生長增加,FOXO3A過表達對**生長的影響***減弱(圖7D-7F)。接下來,我們研究了該途徑對乳腺*轉移的影響。與對照組相比,LINC00926基因抑制組在整個肺區域擴散的結節數量明顯增加(圖7G)。相反,PGK1基因敲低導致乳腺*細胞向肺轉移擴散的減少。然而,PGK1下調極大地減弱了下調LINC00926調節肺轉移的能力(圖7G)。與**生長實驗結果一致,下調LINC00926***減弱了FOXO3A調控肺轉移的能力(圖7H)。 ATM對PTEN的磷酸化導致PTEN在質膜上重新分布。炎癥課題服務兩年
關聯研究已將血液來源的microRNA(miRNA)的改變與結直腸*(CRC)聯系起來。miRNA譜可能在CRC進展過程中多樣化,并在血液中反映CRC進展水平。但是,尚無研究評估不同CRC階段血液中miRNA的變化。本研究對來自不同階段的健康供體、結直腸腺瘤、結直腸憩室炎和CRC患者(UICCstagesI/II,III,andIV)的80份血液樣本中的2,549種miRNA的譜進行了基于微陣列的比較。
接下來通過RT-PCR進行確認,并對另外 36 份血液樣本中miRNA進行驗證。與健康對照相比,有 179 個 CRC 相關 miRNA 的豐度差異。只有三個(miR-1225-5p、miR-1207-5p 和 miR-4459)在所有 CRC 階段表現出增加的水平。
對3個miRNA進行通路分析,發現了miRNAs 以各種方式對幾種**相關通路起作用。
這項研究為改進 CRC 篩查的生物標志物發現提供了線索,是***項提供 CRC 血液表達譜的研究,******評估了不同 CRC不同階段血液中 miRNA 的變化。 這也為其他疾病biomarker的研究提供了新的思路。 醫學相關課題動物模型構建Pex衍生的CD44v6/C1QBP復合物介導了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉移的積極作用。
IGF2BP結合區域包含“GGAC”N6-甲基腺苷(m6A)**基序。IGF2BPs是m6A結合蛋白。為了探索circRNA和IGF2BP之間的相互作用是否通過m6A依賴性的方式進行調節,對circNDUFB2進行了MeRIP,并觀察到circNDUFB2中m6A的顯著富集。敲低METTL3和METTL14顯著降低了circNDUFB2中m6A修飾的水平,并且沒有改變circNDUFB2的水平。METTL3/14敲低顯著削弱了circNDUFB2和IGF2BP之間的相互作用。這些數據表明,circNDUFB2以依賴于m6A的方式與三個IGF2BP物理相互作用。circNDUFB2過表后IGF2BPs的mRNA無***變化,蛋白質水平***降低。此外,circNDUFB2突變體不影響IGF2BPs的蛋白質水平。因此推測circNDUFB2可能通過相互作用使IGF2BP蛋白失穩。發現circNDUFB2的過度表達***降低了IGF2BP蛋白的水平,這可以通過MG132(蛋白酶抑制劑)恢復。circNDUFB2***增加了IGF2BPs的泛素化水平,但這種作用因其突變而受損。這些結果表明circNDUFB2通過促進泛素/蛋白酶體依賴性降解降低IGF2BPs的穩定性。
9.阻斷SUMOylation抑制EVs介導的ELNAT1誘導的淋巴結轉移
用si-NC或si-UBC9#1轉染的對照或ELNAT1過表達UM-UC-3細胞分泌的EVs處理HLECs,結果顯示過表達ELNAT1***促進了體外BCa細胞分泌的EVs誘導淋巴血管生成,而沉默UBC9逆轉了這一作用(Figure9A-C)。IVIS證明UM-UC-3-EVELNAT1增強了體內腘窩淋巴結轉移,而沉默UBC9抑制了這種作用(Figure9D,E)。UM-UC-3-EVELNAT1+siUBC9#1組的腘窩LNs體積比UM-UC-3-EVELNAT1組小(Figure9F)。與UM-UC-3-EVVector組相比,UM-UC-3-EVELNAT1增加了小鼠足底**的淋巴管數量,而下調UBC9的表達導致EVs介導的ELNAT1誘導的淋巴管數量逐漸減少(Figure9G,H)。此外,UM-UC-3-EVELNAT1+si-UBC9#1組的LN生成時間長于UM-UC-3-EVELNAT1組(Figure9I)。綜上所述,這些結果表明UBC9誘導的SUMOylation抑制EVs介導的ELNAT1誘導的BCa淋巴管生成和LN轉移。 我們使用抗體陣列評估了表達PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。
二、YTHDF1缺乏可抑制胃*進展和轉移
YTHDF1在不同胃*細胞株中的蛋白表達水平,遠高于正常胃腺細胞GES-1。為了進一步探討YTHDF1在胃*中的作用,采用了胃*細胞系、細胞系來源的異種移植(CDX)和PDX模型(圖2A)。首先,通過產生兩種穩定的shRNA表達人胃*細胞株MGC-803和HGC-27,研究了YTHDF1的抑制作用,這兩種細胞株在所有被檢測的胃*細胞株中YTHDF1的表達相對較高(補充圖S2B)。YTHDF1基因敲除確實降低了胃*細胞的增殖(圖2B)。此外,在MGC-803和HGC-27細胞中YTHDF1敲除降低細胞的遷移和侵襲能力(圖2C)。隨后通過皮下注射YTHDF1敲除的MGC-803細胞到免疫缺陷裸鼠,研究YTHDF1的抑制是否會影響體內胃*的發生。 小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現典型的外泌體結構。服務課題推薦咨詢
有肝轉移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的PDAC患者。炎癥課題服務兩年
3、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化
為了探索miR-934促進CRLM的分子和細胞基礎,通過Cytoscape軟件注釋了TCGAcohort中191個miR-934相關基因的細胞功能,發現miR-934***參與多種炎癥反應,提示miR-934可能參與了CRC免疫微環境(Fig.3a)。然后發現miR-934與巨噬細胞的基因信號特異性相關(Fig.3b)。為了研究在CRLM中TAM的浸潤與miR-934之間的相關性,我們在原發性結直腸*組織和CRLM組織樣本中采用免疫組化染色檢測TAM標記CD163。如圖3c所示,在CRLM組織中CD163+TAM浸潤豐富的區域觀察到miR-934表達升高。將THP-1細胞與PMA孵育,誘導分化為M0巨噬細胞,M0巨噬細胞具有適當的貼壁形態和巨噬細胞標志物CD68的高表達(Fig.3d)。接下來,研究了CRC細胞來源的外泌體對巨噬細胞M2極化的影響。如Fig.3e所示,當與巨噬細胞共培養時,標記有DiO(綠色)的CRC細胞來源的外泌體被未染色的巨噬細胞內化。相比于低表達miR-934的細胞的外泌體孵育的巨噬細胞或PBS孵育的細胞,M2標記物(CD206,arginase-1,IL10和CD163)的表達在高表達miR-934的CRC細胞的外泌體孵育的巨噬細胞中***增加,而M1標記物(iNOS和IL-1β)幾乎無差異(Fig.3f,g)。 炎癥課題服務兩年
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究
4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗