此外,生存分析顯示,EV中CD44v6和C1QBP高表達的患者的生存結局明顯較差(圖7F)。循環外泌體的隨訪數據也顯示了一致的結果。PDAC患者中循環外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于健康對照組(圖7G), PDAC伴有肝轉移的患者中循環外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的患者(圖7G)。免疫電子顯微鏡顯示,CD44v6和C1QBP在PDAC患者的循環外泌體***表達(圖7H)。高循環外泌體表達CD44v6和C1QBP的患者比其他患者更容易發生肝轉移 (圖7I)。然而,高表達循環外泌體CD44v6和C1QBP的患者生存率明顯較差(圖7J)。總之,我們的研究結果證實了CD44v6和C1QBP在組織源性EV和循環外泌體中的表達可以預測PDAC患者的預后和肝轉移。
結論:我們揭示了原代PDAC細胞和HSCs之間通過PDAC來源的外泌體進行遠距離的細胞通信。此外,Pex通過促進肝纖維化微環境的形成來指示肝特異性轉移。更重要的是,我們發現外泌體CD44v6/C1QBP復合物傳遞到HSC的質膜上誘導IGF-1信號通路的***。外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物,也是***PDAC肝轉移的潛在靶點。 **近科研技術的開發。海南科研售后服務
數據組織和訪問
LncExpDB 的中心實體是 lncRNA 基因,每個 lncRNA 基因都有一個對應的頁面,由兩個主要部分組成,即基本信息(例如基因符號、基因組上下文、長度、外顯子數、分類和對應的轉錄本信息)和表達譜。對于每個 lncRNA,LncExpDB 在所有收集的條件下分析其基因表達譜,并以交互方式可視化其表達譜。它以結構化的方式組織所有相關數據,以促進基于基因、數據集和基于上下文的數據瀏覽/搜索。它可以在一頁中可視化特定 lncRNA 的各種表達譜,促進對特征基因及其相關共表達網絡的探索,并提供有用的功能來捕獲不同生物條件下的表達情況。 廣西科研整體服務上海英拜生物設有專業的武漢技術中心。
外泌體成分包含蛋白質、miRNA、tRFRNA、LncRNA、circRNA,可調節多種生理或病理反應,包括血管生長、兔疫應答等。同時,miRNA也可以作為**診斷以及預后標志物。其中的tRFRNA也是目前的研究熱點,其在體內參與多種生理及病理過程,包括病毒***、氧化應激、神經退行性疾病、遺傳性代謝疾病等.客戶案例:與上海、重慶、沈陽等醫學領域的老師合作就外泌體以及tRFRNA在神經性疾病以及一-些兔疫代謝疾病方面取得了較大進展,并且在影響因子較高的期刊雜志上發表了文章。
APCmRNA上的METTL3依賴性m6A上調抑制APC表達為了確定METTL3依賴的m6A調控對APC表達的影響,構建了一個熒光素酶報告基因,熒光素酶分析顯示,METTL3缺失**增加了WTAPC的熒光素酶活性,而突變的APC提高了熒光素酶活性并使該活性抵抗METTL3缺失的調節。相反,METTL3過表達抑制了WT-APC的熒光素酶活性,但沒有突變的APC。這些結果表明METTL3介導的m6A水平的APCmRNA上調抑制了APC的表達。與這一發現一致,METTL3缺失增加了APCmRNA和蛋白質表達(,并且這些增加被KYSE450細胞中rMETTL3的重組表達所消除。此外,METTL3的過表達降低了KYSE450細胞中APC的表達,四環素劑量依賴性增加的METTL3表達水平與APC水平呈負相關。相反,METTL3非活性突變體與WT對應物不同,未能調節APC表達。值得注意的是,ESCC細胞中的METTL14缺失消除了METTL3的過度表達降低了APC的表達。這些結果表明,在ESCC細胞中,METTL3與METTL14共同介導的APCmRNAm6A上調抑制了APCmRNA和蛋白的表達。Th1/Th2細胞失衡也是結腸炎的一個重要特征。
應用ssGSEA計算了2236條典型路徑在基因組中的富集分數。FDR校正后,共有949條通路(42.4%)與m6A信號***相關,表明m6A修飾與***的生物學過程相關,大多數**類型的結果一致。還發現了一些與*****相關的經典途徑,如FOXM1途徑、細胞周期調控、polo樣激酶1(PLK1)相關途徑和AuroraA/B途徑。
與m6A修飾相互作用的潛在靶點
我們在至少10種PFDR**亞型中鑒定出114個與該特征相關的新基因<?0.05。在105個有可用**評分的基因中,78個基因(74.3%)通過了建議的閾值(**評分>?21.09),明顯高于**評分系統中隨機選擇*基因的比例(35%)。 英拜生物您隨身的科研小助手。河北科研動物模型構建
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為了驗證tRFs&tiRNA-Seq數據,作者檢測了91對PTC組織和*旁組織中tRFs&tiRNA的表達,其中,tiRNA-Gly在人類PTC組織中的表達水平比較高,并***高于*旁組織(圖1F-G)。WB顯示,tiRNA-Gly在PTC**中蛋白表達***高于*旁,但是tRNA-Gly的表達在*和*旁中無***差異(圖1H)。總之,tiRNA-Gly可能在PTC的進展中起致*作用。
在小鼠模型中,tiRNA-Gly調節PTC細胞的增殖和遷移,并影響**生長
首先檢測了tiRNA-Gly在3株PTC細胞系中的表達,如圖2A所示,K1細胞系中tiRNA-Gly的表達***低于BCPAP和TPC-1細胞系。因此,對于功能獲得性實驗,合成帶有5’磷酸末端的tiRNA-Gly轉染至K1細胞系(圖2B)。結果發現,與對照組相比,tiRNA-Gly***促進K1細胞的增殖和遷移(圖2C-D)。對于功能缺失實驗,在BCPAP和TPC-1細胞系中轉染siRNA干擾tiRNA-Gly的表達,結果顯示細胞的增殖和遷移都***下降(圖2E-G)。體內實驗得出了類似的結果,干擾tiRNA-Gly表達導致**體積減小,Ki67表達下降。總之,體內體外實驗都表明tiRNA-Gly是PTC的惡性因子。 海南科研售后服務
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