轉(zhuǎn)錄組學(xué) (RNA-Seq) 模塊
RNA-seq 模塊對與衰老相關(guān)的全基因組轉(zhuǎn)錄組變化進(jìn)行編目。RNA-seq 模塊中收集的數(shù)據(jù)集來自與衰老研究相關(guān)的已發(fā)表文章。該模塊收集在特定基因干預(yù)（過表達(dá)、敲除等）時(shí)觀察到的轉(zhuǎn)錄組變化，該模塊還收集特定組織和***在生理和病理衰老過程中基因表達(dá)譜的變化。RNA-seq 模塊目前包含 > 18 000 個(gè)可能與衰老有關(guān)的差異表達(dá)基因 (DEG)。在 RNA-seq 模塊中，可以通過基因名稱輕松搜索 DEG，并且每個(gè) DEG 條目都包含潛在的實(shí)驗(yàn)條件和基因表達(dá)的倍數(shù)變化及其發(fā)布的來源。可以下載每篇文章中的所有搜索結(jié)果和相應(yīng)的DEG數(shù)據(jù)庫。 嘌呤在細(xì)胞中執(zhí)行許多重要的功能。推薦科研詢問報(bào)價(jià)
2021年6月，***一篇發(fā)表在Nat Immunol.（IF=25.600）的文章（Mitochondrial stress induced by continuous stimulation under hypoxia rapidly drives T cell exhaustion.）當(dāng)**內(nèi)衰竭T細(xì)胞經(jīng)歷嚴(yán)重缺氧時(shí)，他們假設(shè)代謝應(yīng)激會改變其對其他信號的反應(yīng)，特別是持續(xù)的抗原刺激。在體外，盡管單獨(dú)經(jīng)歷連續(xù)刺激或缺氧的CD8 + T細(xì)胞分化為功能性效應(yīng)物，但這種組合迅速驅(qū)動了與衰竭一致的T細(xì)胞功能障礙。連續(xù)刺激促進(jìn)了Blimp-1介導(dǎo)的PGC-1α依賴性線粒體重編程阻遏作用，使細(xì)胞對缺氧的反應(yīng)較差。代謝科研歡迎咨詢METTL14上調(diào)促進(jìn)胰腺*生長和轉(zhuǎn)移。
由于MLL1在HoxBlinc過表達(dá)介導(dǎo)的異常造血過程中至關(guān)重要，HSPC中HoxBlinc過表達(dá)可能通過增加MLL1募集來***其靶基因，從而提高H3K4me3占用率，以促進(jìn)增強(qiáng)子/啟動子染色質(zhì)的可及性。為了證實(shí)這一點(diǎn)，使用WT和HoxBlincTg LSK細(xì)胞進(jìn)行了MLL1和H3K4me3 ChIP-seq。ChIP-seq和CHIRP-seq聯(lián)合分析顯示HoxBlinc和MLL1的基因組結(jié)合位點(diǎn)存在高度重疊（圖6e-g）。令人驚訝的是，51.2%的基因HoxBlinc結(jié)合增加顯示MLL1招募增加，其中大部分(31.7%)也顯示H3K4me3占用增加，包括NPM1c+-標(biāo)記基因，如前HoxB、后HoxA、Meis1和Runx1，以及其他造血基因，如Stat1和Cdr2（圖6e-g）。這些數(shù)據(jù)表明，HoxBlinc過表達(dá)通過增加MLL1的募集和隨后H3K4me3占用的增強(qiáng)來介導(dǎo)靶基因的表達(dá)。
總之，本文發(fā)現(xiàn)HOXBLINC過表達(dá)是驅(qū)動白血病發(fā)生的關(guān)鍵事件，通過控制MLL1招募、染色質(zhì)結(jié)構(gòu)域和啟動子的順式和反式表達(dá)，建立異常NPM1c+標(biāo)記基因表達(dá)程序。因此，本研究不僅為HSC和NPM1突變的AML的生物學(xué)提供了分子視角，而且還為NPM1c+ AML的藥物靶點(diǎn)識別創(chuàng)造了獨(dú)特的機(jī)會。
4）體外實(shí)驗(yàn)表明，上調(diào)UCP1以減輕AKI期間的脂質(zhì)積累，可通過影響炎癥和凋亡，***抑制疾病進(jìn)展
越來越多的證據(jù)表明，在AKI中有明顯的脂質(zhì)積累和UCP1的異常表達(dá)，并與腎損傷的嚴(yán)重程度有很強(qiáng)的相關(guān)性。為了確定脂質(zhì)積累是否影響AKI期間的細(xì)胞功能，我們首先使用UCP1過表達(dá)慢病毒和UCP1激動劑CL316243構(gòu)建AKI細(xì)胞脂質(zhì)積累***模型。如圖4A所示，在AKI中上調(diào)UCP1***脂質(zhì)積聚，導(dǎo)致腎小管損傷指數(shù)、NGAL***下調(diào)，說明UCP1***脂質(zhì)積聚可***減輕模型細(xì)胞的損傷。鑒于炎癥和凋亡是AKI細(xì)胞損傷**重要和直接的原因，我們對上述細(xì)胞模型中的炎癥和凋亡標(biāo)記物進(jìn)行了量化。IL-1β、IL-6和TNF-α隨著UCP1的上調(diào)而***降低(圖4B-D)。在凋亡指標(biāo)Bax和C-caspase3中也觀察到類似的趨勢，而Bcl-2升高(圖4E)。***，通過TUNEL熒光染色直接定量評估細(xì)胞凋亡，證實(shí)上調(diào)UCP1緩解AKI模型細(xì)胞的凋亡(圖4F)。 英拜生物擁有一支高精尖的技術(shù)豐富的技術(shù)團(tuán)隊(duì)。
與CD44v6敲低實(shí)驗(yàn)的結(jié)果相似，敲低Pex中的C1QBP在很大程度上抑制了α-SMA表達(dá)(圖6H)。過表達(dá)C1QBP并沒有上調(diào)α-SMA的表達(dá)(圖6I)。同時(shí)過表達(dá)CD44v6和C1QBP***增加了α-SMA的表達(dá)(圖6I)。與我們的體外研究一致，敲除Pex中的CD44v6或C1QBP逆轉(zhuǎn)了Pex誘導(dǎo)的HSC***、肝臟剛度增加和肝臟ECM重塑的作用(圖6J-L)。脾內(nèi)注射肝轉(zhuǎn)移模型(圖6M)顯示，與Pex組相比，注射了CD44v6-kd或C1QBP-kd的Pex組小鼠的肝轉(zhuǎn)移減少。這些結(jié)果表明，Pex衍生的CD44v6/C1QBP復(fù)合物介導(dǎo)了Pex對肝纖維化和PDAC肝轉(zhuǎn)移的積極作用。英拜在全國各省會城市均有自己的**客戶。江蘇科研中標(biāo)率高
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患者肺*組織樣本中，與鄰近的正常組織相比，在**中觀察到Y(jié)THDC2 mRNA 和蛋白質(zhì)的顯著下調(diào)。類似地，與 BEAS-2B 細(xì)胞相比，已建立的 LUAD 細(xì)胞系中的 YTHDC2 減少。組織芯片分析表明 YTHDC2 在 51% (98/192) 的 LUAD 患者中下調(diào)。值得注意的是，YTHDC2 的下調(diào)與更大的**直徑和更晚期的階段有關(guān)。表明 YTHDC2 抑制促進(jìn)了 LUAD 中的**進(jìn)展。
YTHDC2通過其m6A閱讀域表現(xiàn)出抗**活性
為了在體內(nèi)探索YTHDC2的m6A閱讀器功能，在有或沒有m6A識別YTH結(jié)構(gòu)域的情況下實(shí)現(xiàn)了YTHDC2的肺過表達(dá)，并生成了基于KP和GFP標(biāo)記的KPYWT、KPYΔYTH和對照KPE小鼠。除了強(qiáng)烈的GFP信號外，與***后25周的KPE小鼠相比，YTHDC2被證實(shí)在來自KPYWT和KPYΔYTH小鼠的**中持續(xù)上調(diào)。，表明AAV5表達(dá)系統(tǒng)的持久效率。盡管YTHDC2無法阻止肺**發(fā)生，但**發(fā)生時(shí)間被延遲，壓倒性的肺**負(fù)荷被顯著抑制，KPYWT小鼠的存活時(shí)間比KPE小鼠和KPYΔYTH小鼠長。 推薦科研詢問報(bào)價(jià)
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