7.EVs介導的ELNAT1被HLECs內化以誘導淋巴管生成
共聚焦顯微鏡顯示HLECs中PKH67標記EVs孵育后的點狀熒光強度(Figure7A),表明HLECs內化了BCa分泌的EVs。此外,孵化UM-UC-3-EVELNAT1***上調HLECs中ELNAT1表達,而孵化T24-EVsi-ELNAT1,則T24細胞分泌的EVs中ELNAT1表達下調,則削弱了HLECs中EVs誘導ELNAT1過表達的能力(Figure7B,C)。
為了排除淋巴血管生成是由內源性ELNAT1***HLECs中誘導的可能性,構建了ELNAT1-KO HLECS ELNAT1(HLECsELNAT1-KO)模型(Figure 7 D, E)。與HLECsELNAT1-WT一致,我們觀察到,EVs介導的ELNAT1過表達增強了HLECsELNAT1-KO的管狀形成和遷移能力,而下調ELNAT1則抑制了BCa細胞分泌EVs誘導HLECsELNAT1-KO管狀形成和遷移的能力(Figure 7 F-H)。這表明BCa細胞分泌的EVs通過運輸EVs介導的ELNAT1促進淋巴管生成,而不是轉錄***內源性的ELNAT1。綜上所述,這些結果表明EVs介導的ELNAT1被HLECs內化誘導BCa淋巴管生成。 英拜提供一年三節的購物卡津貼。單細胞相關課題科研細胞實驗
Nup62表達引起的Tbph的錯位和聚集也讓我們檢測了Nup62表達是否影響Tbph的溶解度。Nup62 OE或對照果蠅大腦的可溶性-不可溶性分選顯示,與對照相比,Nup62在運動神經元中表達的上調***增加了不溶性,從而改變了Tbph的可溶性(圖4F和G),表明Nup62水平是Tbph溶解度的重要決定因素。qPCR證實了Nup62的過表達(圖4H)。NUP62與內源性TDP-43共聚合(圖4I)。與單獨mRuby相比,NUP62在HEK293T細胞中的表達導致TDP-43的溶解性***改變(圖4J和K)。檢測了nup62介導的TDP-43聚集物在HEK293T細胞中是否被磷酸化。內源性與NUP62-mRuby共定位的TDP-43聚集體被磷酸化(圖4L)。西藏科研歡迎咨詢巨噬細胞表型協調急性胰腺炎損傷后的炎癥和修復再生。
6、外泌體miR-138-5p促進乳腺*肺轉移
極化的巨噬細胞在決定**細胞的表型中起著重要的作用。因此,探究M2巨噬細胞外泌體miR-138-5p處理是否有助于乳腺*小鼠異**模型的**轉移。使用氯膦酸鈉***小鼠巨噬細胞,然后轉移使用過表達miR-138-5p的T47D或T47D細胞來源的外泌體處理的Raw264.7細胞。小鼠模型通過尾靜脈注射4T1-熒光素酶細胞構建(圖6A)。結果顯示,外泌體miR-138-5p處理組***促進小鼠體內乳腺*細胞的**體積和肺轉移,同時增加了CD206和Arg-1陽性細胞數(圖6B-E)。這些結果表明外泌體miR-138-5p誘導的M2巨噬細胞促進乳腺*的肺轉移。
在皂苷處理的MCF-7細胞中,觀察到內源性INPP4B與HARab7WT或HA-Rab7Q67L共同定位于cd63陽性的晚期核內體(圖3e)。HA-Rab7T22N是一個不定位于晚期核內體的顯性陰性突變體(補充圖3f),它的表達也阻止了內源性INPP4B的募集(圖3e),表明活性的gtp結合的Rab7是INPP4B亞細胞定位到晚期核內體所必需的。 GFP-INPP4B***提高了細胞內PI(3)P水平(1.8倍)(圖3f),PI(3,4)P2也存在于早期和晚期核內體。表達INPP4B shrna的MCF-7細胞顯示出更明顯的細胞內PI(3,4)P2斑點,表明INPP4B缺失抑制PI(3,4)P2在核內體上的降解,導致其積累(圖3g)。GFP-INPP4B沒有改變PI(3) p陽性早期核內體的比例,但***增加了PI(3) p陽性晚期核內體的比例(1.7倍)(圖3h, i)。英拜專注高通量測序行業的整體服務。
然而,在單細胞方法中,尚未出現一種適用于所有三種模式的統一方法,這種方法可以應用于高度特定的功能免疫細胞類型。我們系統地測試了PBMCs的全細胞和核純化和制備方法,以克服以往的分析只限于測量細胞表面的核成分(ATAC和核rna)或蛋白質的局限性。我們發現完整的透性細胞的scATAC-seq表現非常好,在某些測量中超過了傳統的細胞核scATAC-seq(圖1b)。這一發現使得一種類似于轉錄組和表位的細胞索引(CITE-seq)的新方案能夠測量表面蛋白豐度和染色質可及性:染色質景觀和表位的整合細胞索引(ICICLE-seq,圖1a和3)。***,我們證明了我們優化的可滲透細胞方法可以與基于液滴的多組學平臺相結合,從而能夠同時測量細胞的三個不同的分子隔間:mRNA(通過scRNA-seq),蛋白質(使用寡聚標記抗體)和DNA(通過scATAC-seq),我們根據轉錄、表位和可及性將其稱為TEA-seq(圖4)。總之,對單細胞水平上基因調控和表達的分子基礎有了新的、更統一的看法。英拜提供分子生物學以及免疫病理相關實驗。生物相關科研地區科學基金
上海英拜生物有經驗豐富的科研團隊。單細胞相關課題科研細胞實驗
7)USP35敲除增強肺*細胞的化療敏感性
鑒于USP35在肺*細胞中的高表達及其在調節鐵死亡中的作用,我們**終評估了USP35沉默是否能使肺*細胞對化療藥物敏感。如圖9A-C所示,USP35缺乏的H460和H1299細胞在體外對DDP和PTX的毒性作用更敏感,細胞活力和定殖的降低證明了這一點。相應地,接種USP35缺陷*細胞的荷瘤小鼠經DDP或PTX***后**體積和重量均減少(圖9D,E)。酪氨酸激酶抑制劑(TKI)已成為常規化療的替代藥物,并為肺*患者提供了***的生存益處。然后,我們在H460和H1299細胞中測量了USP35敲除和TKI之間的協同效應,數據表明USP35沉默在體內和體外使H460和H1299細胞對GFB化療敏感(圖9F-H)。 單細胞相關課題科研細胞實驗
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7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗