江蘇rDNA測序科研

來源: 發布時間:2021-10-31

5.ELNAT1與UBC9啟動子形成DNA-RNA三聯體,通過招募hnRNPA1增強H3K4me3修飾

為了探索ELNAT1誘導BCa淋巴轉移的分子機制,我們使用NGS檢測過表達ELNAT1的BCa細胞和對照細胞(Figure5A),由于SUMOylation已經被證明可以調節特異性RNA的識別,并參與RNA分選進入EVs的過程,因此鑒定ELNAT1的SUMOylation相關靶基因。在受ELNAT1調控的925個基因中,作者發現UBC9是SUMOylation相關基因變化*****的(Figure5B-D)。接著通過RNA純化(ChIRP)檢驗ELNAT1與UBC9中P1(153~143bp)啟動子區域存在生理相互作用(Figure5E,F)。CD光譜證實ELNAT1/UBC9TTS1組在270~280nm處有一個***的正峰,在210nm處有一個負峰。在FENDRR/PITX2陽性對照組中也有類似的發現(Figure5G,H)。FRET技術分析顯示,與ELNAT1/UBC9TTS1組相比,熒光強度發生了巨大的變化:從520nm到570–580nm,熒光強度控制單鏈RNA/UBC9ssRNA/UBC9TTS1集團,這與FENDRR/PITX2陽性對照組類似(Figure5I,J)。 英拜的實驗室坐落在上海漕河涇園區浦江園區。江蘇rDNA測序科研

TRIM25的RNA結合活性對于其對底物的泛素連接酶活性是必需的。構建了一個帶有FLAG標記RNA結合域(RBD)缺失突變體。TRIM25ΔRBD不影響IGF2BPs的蛋白質水平,對IGF2BPs的泛素化水平沒有明顯影響,表明TRIM25完整的RBD對于IGF2BPs的有效泛素化和降解是必要的。這些結果表明,TRIM25通過泛素-蛋白酶體途徑促進NSCLC細胞中IGF2BPs的降解,并且TRIM25的RNA結合活性對其在底物泛素化中的作用至關重要。

已經顯示,TRIM25使用RNA作為其靶標有效泛素化的支架。然后,探討了TRIM25對IGF2BPs的泛素連接酶活性是否取決于circNDUFB2的存在。 circNDUFB2的丟失顯示了TRIM25對IGF2BPs泛素化和降解的顯著減弱作用。進一步驗證實驗數據并檢查circNDUFB2是否充當支架來增強TRIM25與IGF2BP的結合,進行了Co-IP分析。在帶有circNDUFB2但沒有circNDUFB2-MUT過表達的A549細胞中,TRIM25和IGF2BP之間的關聯得到增強。由于circNDUFB2對RNA核酸外切酶的抗性,使用RNase A***會嚴重破壞相互作用。此外,在METTL3 / 14敲低后,IGF2BP的泛素化作用顯著降低。結果表明,circNDUFB2充當支架,以增強TRIM25和IGF2BPs之間的相互作用,隨后促進TRIM25介導的IGF2BPs泛素化和降解。 北京上皮細胞科研m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。

紡錘體裝配檢查點(SAC)作為一個傳感器的**的著絲點延遲有絲分裂進入后期,直到適當的染色體分離得到保證。這一安全機制的破壞導致基因組不穩定和非整倍體,這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而,盡管了解了控制SAC的基本機制,但信號通路如何直接與有絲分裂檢查點活動相互作用和調節仍是未知的。在對細胞外刺激的反應中,參與細胞生長、生存和分化的多種信號通路網絡被***,這一過程***受到Ras家族小鳥苷三磷酸酶(GTPases)的調控。RIT1是一種ras相關的GTPase,調節細胞存活和應激反應,是通過有絲分裂和適當的染色體分離及時進展的必要條件。

我們進一步的研究表明,circPDE4B調控RIC8A蛋白水平,而不是mRNA水平或穩定性(圖3G-I)。我們還阻斷了RIC8A蛋白的合成,并觀察到sh-陰性對照(NC)和sh-circPDE4B 的HCs之間的RIC8A蛋白半衰期有明顯差異(圖3J),說明circPDE4B降低了RIC8A蛋白的穩定性。經PS341處理后,RIC8A在circPDE4B過表達和下調細胞中均未發生變化(圖3K,L),表明circPDE4B通過蛋白酶體活性調節RIC8A。無論內源性還是外源性RIC8A, RIC8A的多泛素化在circPDE4B耗盡后均下降,在過表達circPDE4B后則上升(圖3O)。綜上所述,circPDE4B翻譯后影響蛋白酶體介導的RIC8A的降解和周轉。增加乳酸桿菌水平導致尿酸水平下降。

褪黑素不能挽救Fth 敲低HT-22細胞中機械性損傷引起的鐵死亡

為了進一步證實褪黑素對Tth小鼠在Fth- KO小鼠中的上述作用,將HT-22細胞系用siRNA轉染,然后在體外進行機械刮擦損傷。siRNA敲低Fth可以降低Fth的蛋白質水平。鑒于脂質過氧化是鐵死亡的標志,使用DCF和BODIRY 581/591 C11作為評估了溶質ROS。與對照組+刮擦損傷組相比,siFth +刮擦損傷組細胞的熒光強度顯著增加,表明siFth增強了HT-22細胞中機械刮擦損傷引起的ROS產生的上調。重要的是,與未經***的siFth組相比,用褪黑素處理siFth轉染的HT-22細胞未能顯著減少刮擦損傷后ROS的上調。



FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。滲透性應激科研服務兩年

2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法。江蘇rDNA測序科研

2021年6月,在Oncogene雜志上發表了文章“Chromatin-directed proteomics-identified network of endogenous androgen receptor in prostate cancer cells..”。此報道通過運用了一種強大的染色質導向蛋白質組學方法,稱為ChIP-SICAP,揭示去勢抗性前列腺*(CRPC)細胞中內源性AR周圍染色質蛋白網絡(染色質蛋白網絡)的組成。在CRPC細胞雄***信號通路的背景下,進一步研究了與AR相關蛋白作用的染色質重塑者SMARCA4和SIM2。通過整合ChIP-seq、RNA-seq、ATAC-seq和功能實驗的數據,揭示SMARCA4和AR在染色質上***共存,SMARCA4缺失影響了一組AR靶基因的染色質可及性和表達,也抑制了CRPC細胞的生長,驗證了SMARCA4在CRPC細胞中的功能。雖然SIM2的沉默同樣降低了染色質的可及性,但它影響了更多的雄***調節基因的表達。在雞胚絨膜尿囊膜實驗中,SIM2沉默也降低了CRPC細胞的增殖和**的大小。總之,此研究鑒定的AR染色體是研究這一重要藥物靶點的重要資源。江蘇rDNA測序科研

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