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SIM2是否也影響AR與染色質(zhì)的結(jié)合,我們在SIM2沉默后進行AR ChIP-seq。如圖7所示,受體與大多數(shù)arb的結(jié)合沒有改變。然而,SIM2沉默影響2265 ARBs藥物通過降低和增加染色質(zhì)占用大約相同數(shù)量的地點(圖7 a、b)。當(dāng)反映這些siSIM2-affected染色質(zhì)易訪問性的變化,有趣的是,減少可訪問性是在690年siSIM2-DN ARBs藥物(圖7 c、e、f),而在siSIM2-UP arb中,染色質(zhì)可及性的變化不明顯(圖7c)。其余的(1744)siSIM2位點在AR結(jié)合方面沒有變化。大多數(shù)由SIM2沉默改變的arb并不與FOXA1缺失改變的arb重疊,這得到了基元分析的支持,表明FOXA1基元在siSIM2-DN arb上的富集少于在AR結(jié)合沒有變化的位點上的富集(圖7d)。代謝變化被認(rèn)為是腸病**重要的特征之一。細(xì)胞因子科研服務(wù)兩年
由于腸道微生物群在多囊卵巢綜合征的起始和發(fā)展中起著重要作用,作者還研究DHEA和tempol是否影響腸道的氧化還原狀態(tài)。腸道MDA、3-NT和AGEs水平在PCOS大鼠中***高于對照組和氧化生物標(biāo)記的增加被tempol處理消除(圖3K-M)。此外,tempol***增加PCOS大鼠的腸道SOD1和SOD2表達(圖3N)。因此,這些結(jié)果表明tempol能夠降低PCOS大鼠的腸道氧化應(yīng)激。
4.Tempol減輕PCOS大鼠腸道微生物失調(diào)
隨后,通過rarefaction和Shannon曲線(Fig.4A-B),以及4個α-多樣性指數(shù)(ACE)、Shannon、Simpson和Chao1來評估細(xì)菌群落的豐度和多樣性。當(dāng)序列增加到2000時多個樣本稀疏曲線往往是平坦的,這表明測序數(shù)據(jù)的數(shù)量是合理的(圖4C-F)。在多個樣本Shannon曲線也觀察到類似的結(jié)果(圖4g),表明大多數(shù)樣本多樣性被測序覆蓋。有趣的是,rarefaction和Shannon曲線以及4個α-多樣性指數(shù)的結(jié)果在不同組間沒有差異(圖4A-F),這表明DHEA處理或tempol干預(yù)對腸道微生物群α-多樣性沒有明顯影響。 細(xì)胞因子科研服務(wù)兩年m6A表達水平較高的**患者淋巴轉(zhuǎn)移***增加。
circNDUFB2抑制NSCLC進展
體外研究表明circNDUFB2過表達顯著抑制了NSCLC細(xì)胞的增殖,遷移和侵襲,而circNDUFB2敲低顯著促進了這些表型。體內(nèi)實驗表明circNDUFB2過表達可顯著抑制NSCLC細(xì)胞的致瘤性和轉(zhuǎn)移。這些數(shù)據(jù)表明circNDUFB2可能在NSCLC進展中起抑制作用。
circNDUFB2與NSCLC細(xì)胞中的IGF2BP1/2/3相互作用
為了探索circNDUFB2是否通過與蛋白質(zhì)相互作用發(fā)揮功能,RNA pulldown來鑒定與其相關(guān)的蛋白質(zhì)。RNApulldown沉淀物通過SDS-PAGE分離。銀染后,切下約65 kDa的有義特異性條帶,并使用質(zhì)譜進行分析。發(fā)現(xiàn)**個豐富的蛋白質(zhì)分別是IGF2BP2,IGF2BP1和IGF2BP3。使用Western blot和RIP分析證實了這一結(jié)果。此外, RNA FISH免疫熒光分析,發(fā)現(xiàn)circNDUFB2與IGF2BPs共定位在細(xì)胞質(zhì)中。為了探討IGF2BPs的KH域?qū)τ谂ccircNDUFB2之間的相互作用,構(gòu)建IGF2BPs突變體,KH結(jié)構(gòu)域突變明顯減少了IGF2BP與circNDUFB2之間的相互作用。接下來進行了circNDUFB2突變,發(fā)現(xiàn)circNDUFB2突變顯著降低了IGF2BP與circNDUFB2之間的相互作用。
六、INPP4B通過增強GSK3β的溶酶體降解促進pi3k依賴的Wnt/β-catenin信號轉(zhuǎn)導(dǎo)
通過nanoString RNA譜分析,我們檢測了GFP-INPP4B和gfp載體表達MCF-7細(xì)胞中已知的**通路,結(jié)果顯示幾種Wnt/β-catenin通路基因的表達發(fā)生了改變(圖6a)。定量RTPCR證實GFP-INPP4B-MCF-7細(xì)胞中Wnt/β-catenin靶基因AXIN2(1.8倍)、LEF1(5.6倍)、DKK1(3.3倍)和MYCN(2倍)的mRNA表達增加,表明Wnt/β-catenin信號通路增加(圖6b)。它結(jié)合TCF/LEF轉(zhuǎn)錄因子,促進Wnt靶基因的轉(zhuǎn)錄。Wnt/β-catenin信號通路被Wnt3a和R-spondin處理***,在這些條件下,與gfp載體對照相比,GFP-INPP4B細(xì)胞表現(xiàn)出AXIN2 mRNA表達和非磷酸化-β- catenins33 /S37/T41(活性-β-catenin)水平增加(圖6c, d)。 大黃酸處理改變腸道菌群組成。
人類人臍帶來源的間充質(zhì)干細(xì)胞(hUC-MSCs)移植被證實是***系統(tǒng)性紅斑狼瘡(SLE)的有效方法,但是詳細(xì)的潛在機制仍不明確。轉(zhuǎn)運miRNAs可能是MSCs交流其它細(xì)胞的方法。Sirt1是一種NAD依賴的去乙酰化酶,通過去乙酰化p53來防止細(xì)胞衰老。本研究旨在探討在MRL/lpr狼瘡小鼠模型中,hUC-MSCs是否通過miRNA調(diào)節(jié)Sirt1/p53來影響脾CD4+ T細(xì)胞的衰老。本文于2021年1月發(fā)表在《Theranostics》IF:8.597期刊上。
1、hUC-MSCs減輕緩解MRL/lpr小鼠的疾病進展
為了評估對MRL/lpr小鼠狼瘡綜合征的***作用,從17周齡開始用5×105hUC-MSCs或PBS***MRL/lpr小鼠,并在21周齡時處死所有小鼠(圖1A)。與PBS處理的小鼠相比,hUC-MSC處理的小鼠的腎臟病變明顯減少(圖1B)。此外,與PBS處理的MRL/lpr小鼠相比,hUC-MSCs處理后小鼠的脾臟重量和蛋白尿明顯降低(圖1C-D)。hUC-MSCs***組的血清anti-dsDNA抗體水平較低,但未達到統(tǒng)計學(xué)水平(圖1E)。數(shù)據(jù)表明hUC-MSCs改善MRL/lpr小鼠的狼瘡疾病。 METTL14的上調(diào)可以通過m6A修飾降低PERP水平。血管生成科研地區(qū)科學(xué)基金
思路是您的操作我們來做。細(xì)胞因子科研服務(wù)兩年
由于腸道微生物群在多囊卵巢綜合征的起始和發(fā)展中起著重要作用,作者還研究DHEA和tempol是否影響腸道的氧化還原狀態(tài)。腸道MDA、3-NT和AGEs水平在PCOS大鼠中***高于對照組和氧化生物標(biāo)記的增加被tempol處理消除(圖3K-M)。此外,tempol***增加PCOS大鼠的腸道SOD1和SOD2表達(圖3N)。因此,這些結(jié)果表明tempol能夠降低PCOS大鼠的腸道氧化應(yīng)激。
4. Tempol減輕PCOS大鼠腸道微生物失調(diào)
隨后,通過rarefaction和Shannon曲線(Fig. 4A-B),以及4個α-多樣性指數(shù)(ACE)、Shannon、Simpson和Chao1來評估細(xì)菌群落的豐度和多樣性。當(dāng)序列增加到2000時多個樣本稀疏曲線往往是平坦的,這表明測序數(shù)據(jù)的數(shù)量是合理的(圖4C-F)。在多個樣本Shannon曲線也觀察到類似的結(jié)果(圖4 g),表明大多數(shù)樣本多樣性被測序覆蓋。有趣的是,rarefaction和Shannon曲線以及4個α-多樣性指數(shù)的結(jié)果在不同組間沒有差異(圖4A-F),這表明DHEA處理或tempol干預(yù)對腸道微生物群α-多樣性沒有明顯影響。 細(xì)胞因子科研服務(wù)兩年
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎(chǔ),利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細(xì)胞實驗平臺,提供課題整體設(shè)計外包、撰寫SCI論文一站式服務(wù)。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū),實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導(dǎo)下完成。
1.整體課題外包服務(wù):RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究,設(shè)計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性,為您的標(biāo)書奠定較好的基礎(chǔ)
2.標(biāo)書申請:提供標(biāo)書課題設(shè)計、撰寫,標(biāo)書部分基礎(chǔ)實驗的開展,設(shè)計的標(biāo)書均符合科研前沿?zé)狳c,中標(biāo)率很高。
3.提供熱點**文獻技術(shù)支持,探討科研前沿?zé)狳c研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關(guān)研究
4.二代測序:轉(zhuǎn)錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,F(xiàn)ISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細(xì)胞增殖,凋亡,流式等細(xì)胞功能學(xué)實驗