出生缺陷拷貝數科研國家自然科學基金

來源: 發布時間:2021-11-02

第三步:上傳附加文件(可以選擇性上傳)

附加文件中可以包括平臺、批次等信息。 例如,在平臺列中,“1”表示數據來自 Affymetrix U133 plus2 平臺,“2”表示來自安捷倫微陣列芯片的數據,“3”表示來自 Illumina Hiseq 2000 的數據等。

第四步:填寫電子郵箱(選填,建議填寫)

如果填寫郵箱,結果會以郵件形式發送至該郵箱。

第五步:提交

數據文件全部上傳后,點擊“Submit”進行提交,頁面會自動跳轉至結果頁。也可以根據頁面給出的job ID查詢結果。

總而言之,我們可以使用Rank-In對**的芯片和 RNA-seq中的混合數據進行綜合轉錄組學分析。 上海英拜生物提供可靠可信可參觀的實驗平臺。出生缺陷拷貝數科研國家自然科學基金

再次從老年和年輕小鼠中分離BMSCs,Dil染色劑標記后體外增殖,脛骨內注射到另一批年輕小鼠中,三天后收獲脛骨對成骨標志物Runx2進行熒光免疫染色。發現老年BMSCs處理的小鼠中Dil標記細胞降低,表明老化過程中OPCs向骨形成表面的遷移能力降低。大部分遷移到骨形成表面的Dil標記細胞表達Runx2,表明OPCs遷移到骨形成表面發生成骨分化,有助于體內骨形成。與年輕BMSCs相比,老年BMSCs的體外遷移能力明顯受損,Macf1***下調,從Macf1基因位點轉錄而來的長鏈非編碼RNA PMIF(即lnc-PMIF)表達***增高。上述提示,衰老過程中小鼠骨形成的減少伴隨著OPCs向骨形成表面遷移的減少和OPCs中lnc-PMIF表達的升高。遼寧抗病毒反應科研英拜提供可靠的技術咨詢。

3、CRC細胞來源的外泌體miR-934誘導巨噬細胞M2極化

為了探索miR-934促進CRLM的分子和細胞基礎,通過Cytoscape軟件注釋了TCGAcohort中191個miR-934相關基因的細胞功能,發現miR-934***參與多種炎癥反應,提示miR-934可能參與了CRC免疫微環境(Fig.3a)。然后發現miR-934與巨噬細胞的基因信號特異性相關(Fig.3b)。為了研究在CRLM中TAM的浸潤與miR-934之間的相關性,我們在原發性結直腸*組織和CRLM組織樣本中采用免疫組化染色檢測TAM標記CD163。如圖3c所示,在CRLM組織中CD163+TAM浸潤豐富的區域觀察到miR-934表達升高。將THP-1細胞與PMA孵育,誘導分化為M0巨噬細胞,M0巨噬細胞具有適當的貼壁形態和巨噬細胞標志物CD68的高表達(Fig.3d)。接下來,研究了CRC細胞來源的外泌體對巨噬細胞M2極化的影響。如Fig.3e所示,當與巨噬細胞共培養時,標記有DiO(綠色)的CRC細胞來源的外泌體被未染色的巨噬細胞內化。相比于低表達miR-934的細胞的外泌體孵育的巨噬細胞或PBS孵育的細胞,M2標記物(CD206,arginase-1,IL10和CD163)的表達在高表達miR-934的CRC細胞的外泌體孵育的巨噬細胞中***增加,而M1標記物(iNOS和IL-1β)幾乎無差異(Fig.3f,g)。

使用測量細胞一致性的活細胞成像作為細胞生長和擴散的代理,來測試SMARCA4消耗的影響是否轉化為VCaP細胞生長的改變。如圖5所示,在沒有雄***的情況下,SMARCA4刪除并不影響細胞的生長,而在有雄***的情況下,它降低了細胞的相對融合,盡管程度低于去除AR。SMARCA4刪除同樣會降低LNCaP細胞的相對融合。

四、SIM2沉默改變了arb亞群的染色質可及性

SIM2沉默降低了2434個arb染色質可及性,三分之二受siSIM2影響的arb在雄***暴露前可及(圖6a c中可獲得),而其余在雄***暴露后可及(圖6a c中重新獲得)。根據ChIP-SICAP數據,siim2受影響的位點中**富集的motif是ARE,盡管其在這些位點的富集程度低于未受siim2影響的位點(NC位點,圖6d)。AR、FOXA1、ERG和HOXB13在sisim2影響的位點的標簽密度與NC位點相比均呈上升趨勢(圖6e),表明SIM2是一種與AR協同的TF。 FOXO3A誘導的LINC00926限制乳腺瘤細胞的生長和轉移。

中國科學院動物研究所劉光慧研究組、曲靜研究組和北京基因組研究所(國家生物信息中心)鮑一明研究組、張維綺研究組合作建立了Aging Atlas數據庫。數據庫相關文章于2020年10月29日以“Aging Atlas: a multi-omics database for aging biology”為題在線發表于Nucleic Acids Research雜志(IF=11.501)。

Aging Atlas 目前的實現包括五個模塊:轉錄組學、單細胞轉錄組學、表觀基因組學、蛋白質組學和藥物基因組學。此外,Aging Atlas Consortium 還手動管理了一系列與衰老相關的人類和小鼠基因(GAAA)。GAAA 部分現在包含數百個人類和小鼠衰老相關基因,分為 10 個“基因集”和相應的 KEGG 通路。基因組具有成熟的老化特征,包括基因組不穩定性、端粒磨損、表觀遺傳改變、蛋白質穩態喪失、線粒體功能障礙、營養感知失調、細胞間通訊改變、細胞衰老和干細胞衰竭。Aging Atlas Consortium 的老年學專家將 GAAA 中的每個基因都歸因于這些基因集。因此,GAAA 提供了 Aging Atlas 的基準部分,以幫助用戶更好地解釋這些與衰老相關的基因的生物學意義。 專注于生命科學內的前沿研究。細胞能動性科研服務兩年

巨噬細胞表型協調急性胰腺炎損傷后的炎癥和修復再生。出生缺陷拷貝數科研國家自然科學基金

6.ELNAT1通過UBC9誘導的hnRNPA1的SUMOylation被封裝到EVs中

UBC9可以催化靶蛋白的SUMOylation來調節它們與生物分子的相互作用和細胞運輸。Figure6A顯示,通過co-IP分析,觀察到一個明顯的15~25kDa條帶被hnRNPA1特異性富集。此外,IP分析顯示UBC9過表達增強了hnRNPA1的SUMO2連接,表明UBC9誘導hnRNPA1的SUMOylation(Figure6B)。將hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點賴氨酸3(K3)和賴氨酸113(K113)用精氨酸替代(Figure6C),并通過co-IP分析表明,證明了hnRNPA1中SUMOylation修飾的位點是K113(Figure6D)。ELNAT1過表達上調了hnRNPA1K113的SUMO化,而敲除UBC9則消除了這個影響(Figure6E)。 出生缺陷拷貝數科研國家自然科學基金

公司特色是以各式高通量二代測序為基礎,利用生物數據信息分析手段,通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺,提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區,實驗平臺開放參觀,客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度,保證您的實驗是在您的指導下完成。

1.整體課題外包服務:RNA甲基化研究專題,外泌體研究專題,wnt/VEGF/toll等經典通路研究,設計的課題均具有后續實驗課題的延展性,為您的標書奠定較好的基礎

2.標書申請:提供標書課題設計、撰寫,標書部分基礎實驗的開展,設計的標書均符合科研前沿熱點,中標率很高。

3.提供熱點**文獻技術支持,探討科研前沿熱點研究:trfRNA,DNA/RNA甲基化,外泌體,自噬,WNT等相關研究

4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序

5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片

6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗

7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗

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