6.靶向遞送lnc-PMIFsiRNA接近骨形成表面的OPCs促進老年小鼠骨形成
接下來評價lnc-PMIF在骨形成表面周圍的老年OPCs中系統靶向沉默對衰老相關骨質疏松的影響。為促進lnc-PMIFsiRNA(即si-PMIF)接近骨形成表面周圍的OPCs,si-PMIF或si-NC被包裹在骨形成表面靶向遞送系統(即,(DSS6)-脂質體)。21月齡自然衰老的雄性和雌性小鼠靜脈注射(DSS6)-脂質體-si-PMIF、(DSS6)-脂質體-si-NC或(DSS6)-脂質體單藥(溶劑)。si-PMIF處理組Gli1+細胞中lnc-PMIF的表達***降低,si-PMIF處理組兩種性別小鼠的骨量更高,脛骨干骺端微結構更好,BMD和BV/TV更高,MAR和BFR/BS較高。這些發現表明,靶向沉默骨形成表面周圍OPCs中的lnc-PMIF可以促進衰老相關骨質疏松小鼠的骨形成。 METTL14是其***的潛在靶點。重慶Notch信號靶標科研
在體外,上調UCP1減少AKI期間的脂質積累可通過AMPK/ULK1途徑促進自噬
自噬已被證實在AKI中發揮重要作用。因此,自噬已經成為我們關注的重要途徑之一。在通過慢病毒轉染過表達UCP1或UCP1激動劑CL316243的AKI細胞模型中,自噬相關指標顯示AMPK/ULK1/自噬通路******(圖7A-B)。電子顯微鏡圖像也顯示,上調UCP1消除AKI中的脂質積累后,細胞自噬得到促進(圖7C)。基于這些發現,為了驗證自噬在UCP1功能中的重要性,我們進行了功能恢復實驗。如圖7D-F所示,氯喹抑制自噬***逆轉了順鉑組UCP1引起的炎癥指標下降。同樣,TUNEL染色顯示,使用氯喹抑制自噬,可以明顯逆轉UCP1促進的凋亡抑制作用(圖7G)。這些結果表明,脂質積累通過作用于AKI細胞自噬,在調節細胞功能方面發揮著重要作用。 骨質疏松癥科研實驗可參觀嘌呤在細胞中執行許多重要的功能。
2)整合單核RNA和ATAC數據集,用于預測和驗證ATAC細胞類型分配
snATAC-seq捕獲單個細胞的染色質可及性特征。相對而言,我們對細胞類型特異性染色質可及性圖譜的了解較少;因此,我們利用注釋snRNA-seq數據集使用標簽轉移來預測使用Seurat的snATAC-seq細胞類型。標簽轉移是通過從snATAC-seq數據創建一個基因活性矩陣來進行的,這是一種衡量蛋白編碼基因的基因體和啟動子內染色質可及性的方法。在參考snRNA-seq數據集和查詢基因活性矩陣之間識別轉移錨點,然后分配預測的細胞類型。snATAC-seq預測分數的分布表明,絕大多數細胞具有較高的預測分數,并被自信地劃分為單細胞類型(補充圖2)。
五、gata1調控靶基因的染色質可及性及表達動態
5)過表達miR-337-3p和miR-137抑制子宮內膜*細胞的惡性生物學行為
為了研究miR-337-3p和miR-137在子宮內膜*生物學行為中的可能作用,我們分別用agomir-337-3p/137和antagomir-3373p/137轉染Ishikawa和HEC-1A細胞。使用CCK-8和EdU檢測細胞增殖(圖5A和5B)。傷口愈合和Transwell檢測分別用于評估細胞遷移和侵襲。過表達miR-33373p和miR-137降低了Ishikawa和HEC-1A細胞的遷移和侵襲能力(圖5C和5D)。流式細胞術檢測并分析細胞周期分布(圖5E)。以上實驗結果證實,與miR-NC組相比,miR-337-3p和miR-137過表達***抑制了細胞的增殖、侵襲和遷移。 大黃酸處理對正常組沒有任何明顯的副作用或促炎反應。血管生產因子科研實驗可參觀
2108年俞立團隊明確闡述了收集和檢測遷移體的實驗方法。重慶Notch信號靶標科研
褪黑素可挽救TBI后皮層的鐵蓄積和神經元損傷
為了進一步研究褪黑素在TBI后鐵蓄積和神經元損傷中的假定作用,在TBI后第3天,在受傷的皮層中觀察到了Fe2+,Fe3+,總鐵含量顯著增加。而褪黑素或Lip-1抑制TBI誘導的血清和同側皮層中鐵含量的上調的。Perls的藍色染色表明,TBI后第7天鐵陽性細胞的數量顯著增加,褪黑素或Lip-1***組的鐵陽性細胞少于對照組。鑒于TBI誘導的鐵超載伴隨著Fth表達的上調,使用免疫熒光染色觀察了TBI后神經元中Fth的表達。發現與假手術組相比,模型組中Fth陽性神經元的***增加,而褪黑素和Lip-1處理顯著降低了Fth陽性神經元。與假手術組相比,受傷的神經元的細胞體在TBI后7天出現胞質萎縮或核固縮。褪黑素和Lip-1處理可減輕這些組織病理學變化。TBI后第7天,FJB染色測定腦部神經元變性,發現TBI導致大腦皮層變性神經元的數量增加,但是褪黑素和Lip-1給藥明顯減少了變性神經元的數量。這些數據表明褪黑素可防止TBI誘導的鐵蓄積并防止同側皮質的神經元損傷。 重慶Notch信號靶標科研
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗