6.大腸腺瘤預測模型的特異性驗證
提高標志物的特異性可以減少臨床診斷中的假陽性,因此有必要進一步評估腺瘤標志物的特異性,在此分析中,考慮了5種非CRC疾病,包括克羅恩病(CD),潰瘍性結腸炎(UC),腸易激綜合征(IBS),非酒精性脂肪肝疾病(NAFLD)和2型糖尿病(T2D)。非CRC疾病模型的AUC值明顯低于**腺瘤模型的AUC值。
7.大腸腺瘤的微生物功能改變分析
在腺瘤和對照之間的比較中,腺瘤中富含碳水化合物的生物合成途徑(例如,ADP-庚糖生物合成),無機營養代謝以及核苷和核苷酸的生物合成,而芳香化合物降解的途徑和次級代謝產物的生物合成則更為豐富。腺瘤樣本減少。比較腺瘤和CRC,輔助因子,輔基,電子載體,維生素生物合成(例如MK-10生物合成)以及氨基酸降解和發酵的途徑富含**。另一方面,腺瘤的細胞結構生物合成以及脂肪酸和脂質的生物合成/降解途徑減少。 文章檢測了小鼠腸系膜淋巴結(MLN)中的Th17細胞(與結腸炎癥密切相關)。胰腺科研實驗外包
circRNAs已經成為重要的生物調節因子。小編***給大家帶來2021年5月發表于影響因子為16.102的Ann Rheum Dis雜志上題為"circPDE4B prevents articular cartilage degeneration and promotes repair by acting as a scaffold for RIC8A and MID1"的文章。在本研究中,作者旨在闡明circPDE4B的作用,據報道,該circRNAs在骨關節炎(OA)組織中下調。我們體外研究了circPDE4B在人和小鼠軟骨細胞中的作用。通過RNA下拉-質譜分析、免疫共沉淀、谷胱甘肽- S-轉移酶下拉、RNA免疫共沉淀,驗證了circPDE4B與RIC8A)/ MID1復合物的相互作用。采用小鼠OA模型證實了circPDE4B在體內OA發病機制中的作用。本研究強調了circPDE4B-RIC8A軸在OA關節中的功能及其對MAPK-p38的調控,提示這一軸可能是OA的***靶點。廣州表觀遺傳組科研英拜專注高通量測序行業的整體服務。
這可能部分解釋了第3天巨噬細胞的增加。此外,流式細胞術數據顯示M2樣巨噬細胞(CD206+IL4RA+)的百分比在第1天(急性炎癥期)下降并從第3天開始增加(ADM階段),而這些M2樣巨噬細胞的數量在第3天達到峰值,然后迅速減少。此外,流式細胞術數據與免疫熒光分析一致,其中F4/80+CD206+細胞在第3天**豐富。
接下來,我們想知道這些CCR2+單核細胞/巨噬細胞是否可以在胰腺損傷后重新編程為M2樣巨噬細胞。在植入和誘導AP8周后,我們發現第3天的增殖巨噬細胞(Ki67+)主要來自CCR2WT小鼠。與來自CCR2KO小鼠的巨噬細胞相比,來自CCR2WT小鼠的巨噬細胞表現出更高的CD206和IL4RA表達水平。綜上所述,結果表明,ADM階段的M2樣巨噬細胞主要來源于CCR2+單核細胞/巨噬細胞,這些細胞在AP早期募集。
我們進一步研究了 YTHDC2 是否是人類 LUAD 細胞中的**抑制因子。選擇 H1975 和 H1299 細胞是因為它們分別在測試的 LUAD 細胞系中表現出比較高和比較低的 YTHDC2 表達。IB 檢測證實了 YTHDC2 的過表達和敲除效率。雖然在 H1299 細胞中YTHDC2 WT過表達后3D 球體的數量和大小以及異種移植物的**生長減少,但在 YTHDC2 ΔYTH過表達后未觀察到這些影響。相比之下,敲除 H1975 細胞中的 YTHDC2 會增加小鼠的球體形成和異種移植物生長。值得注意的是,當使用 YTHDC2 sg2-抗性(res)重建 YTHDC2 表達時,YTHDC2-sg2 在**發生中的積極作用得以恢復。因此,YTHDC2 通過其 m 6 A 閱讀域在 LUAD 中發揮**抑制功能。這些結果也解釋了為什么 Ythdc2 在鼠**中的顯著表達和 H1299 細胞中的 YTHDC2當突變體過表達時,沒有改變轉化表型。思路是您的操作我們來做。
在所有**中具有比較高***性頻率的基因是蛋白質編碼基因BCL9L。BCL9L在10種**類型的**組織中***上調。其表達水平與m6A信號呈正相關(r=0.35)和m6A亞型在總人口中。在泛*薈萃分析(HR)中,BCL9L的高表達與總體生存率降低***相關。這一發現在6個外部驗證數據集中得到證實,包括肺*,胃*,乳腺*,肝*和卵巢*,乳腺*。BCL9L是Wnt信號通路的重要成員,與Wnt信號通路的ssGSEA富集分數***相關。在參與Wnt信號轉導的5個m6A互作基因(MYC、LEF1、WIF1、CTNNB1和SOX2)中,BCL9L與MYC有很強的相關性(r=0.34)和CTNNB1(r=0.36)。此外,我們驗證了外部數據集中的109個蛋白質編碼基因。在PFDR的meta分析中,40個基因(37.7%)與生存率相關<0.05,表明它們在**中起重要作用。總之,這項研究表明m6A調節因子和相互作用基因可能在**預后中起重要作用。我們對m6A模式的系統評價提高了對**微環境中RNA甲基化失調的理解。預測的相互作用靶基因可能為臨床***靶點提供更多的信息。文章使用FMT(糞微生態移植)來確定大黃酸改變的腸道菌群是否對結腸炎有療效。通用細胞因子科研實驗外包
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環狀RNA(circRNA)在**進展和代謝調節中發揮重要作用。絲氨酸/甘氨酸代謝通過促進*細胞的合成代謝需求和表觀基因組以及調節其氧化還原狀態來支持*細胞的生長。然而,circRNA在調節絲氨酸/甘氨酸(SG)代謝中的作用尚未得到很好的闡明。***講一篇關于circRNA調節絲氨酸/甘氨酸代謝的文章,改文章發表于Molecular Cancer期刊,影響因子27.4。文章題名為:CircMYH9 drives colorectal cancer growth by regulating serine metabolism and redox homeostasis in a p53-dependent manner。胰腺科研實驗外包
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