我們已經進行了snATAC-seq和snRNA-seq來研究染色質可及性如何改善我們對成熟人類腎臟中細胞狀態和功能的理解。我們生成了一個包含轉錄組和表觀基因組數據的交互式多模態圖譜(/SingleCell/)。結合snRNA-seq和snATAC-seq分析提高了檢測近端小管和厚升肢內獨特細胞狀態的能力，并重新定義了可能有助于腎臟再生和細胞特異性離子通透性的細胞異質性。一、人類成年腎臟的單細胞轉錄和染色質可及性分析1）成人腎臟中的單細胞轉錄和染色質可及性分析snRNA-seq基于譜系特異性標記的表達(圖1c，補充圖1b)，鑒定了腎皮質內所有主要細胞類型(圖1b，補充圖1a)。檢測了近端小管(PT)、壁上皮細胞(PEC)、粗升肢(TAL)、遠端小管(DCT1、DCT2)、連接小管(CNT)、**管(PC、ICA、ICB)、內皮細胞(ENDO)、腎小球細胞類型(MES、PODO)、成纖維細胞(FIB)和少量白細胞(LEUK)(補充表2、補充數據1)。值得注意的是，近端小管亞群中VCAM1表達增加(PT_VCAM1)。該亞群還表達了HAVCR1，這是一種急性損傷后近端小管上調的基因，是長期腎臟預后的預測因子。 間接量熱法測定平均呼吸交換商（RQ值）在SCI + FMT組恢復正常。外泌體標書國家自然科學基金
2、CDK4/6i介導的CD8+T細胞記憶獲得是細胞固有的
為了確定在CDK4/6i處理的**中觀察到的T細胞記憶是否由于CDK4/6在這些細胞內的直接抑制，在體外將活化的小鼠CD8+T細胞暴露于CDK4/6i中，并監測Tcm獲取和分裂數。***CDK4/6i暴露0、24、72h后，Tcm細胞平均分裂數減少，同時細胞比例增加，且呈劑量依賴性，*在24h內發生(Fig.2A)。這表明CDK4/6i不是簡單地抑制分化，而是直接促進記憶形成，表明細胞周期機制與分化之間存在方向性關系。通過3'RNA-seq進一步分析發現，在CDK4/6i處理后，記憶相關轉錄本增加，GSEA分析證實了記憶相關特征的富集，以及細胞周期相關特征的減少，包括E2F靶點(Fig.2B-E)。矛盾的是，CDK4/6抑制也誘導了效應相關轉錄本，包括Gzma、Gzmc和Pdcd1(Fig.2B-C)，這與之前CDK4/6i促進T細胞活化的報道一致。 重慶課題整包標書單細胞核測序能夠獲得組織的細胞圖譜.
8）人類乳腺*患者中LINC00926和PGK1表達的相關性及LINC00926與葡萄糖攝取的相關性
我們通過IHC和FISH檢測109例人乳腺*樣本中PGK1和LINC00926的表達情況。與培養細胞中LINC00926抑制PGK1的結果一致，LINC00926的表達與PGK1的表達呈負相關，與FOXO3A呈正相關(圖8A)。通過18FDGPET掃描評估葡萄糖攝取增加的乳腺**患者顯示LINC00926和FOXO3A表達降低，而PGK1表達增加(圖8B)。綜上所述，這些數據表明了LINC00926/PGK1軸在乳腺*中的重要病理作用。
結論我們的研究***證實了LINC00926通過抑制糖酵解關鍵酶PGK1的表達來抑制糖酵解，從而在體內外抑制乳腺*細胞的增殖、侵襲和轉移。在乳腺*患者中，FOXO3A調控的LINC00926與PGK1表達呈負相關。這些發現概述了FOXO3A/LINC00926/PGK1軸在Warburg效應和乳腺**發生進展中的重要性。因此，上調LINC00926可能是***PGK1過表達的乳腺*患者的一種有前途的方法。
6.靶向遞送lnc-PMIFsiRNA接近骨形成表面的OPCs促進老年小鼠骨形成
接下來評價lnc-PMIF在骨形成表面周圍的老年OPCs中系統靶向沉默對衰老相關骨質疏松的影響。為促進lnc-PMIFsiRNA（即si-PMIF）接近骨形成表面周圍的OPCs，si-PMIF或si-NC被包裹在骨形成表面靶向遞送系統（即，(DSS6)-脂質體）。21月齡自然衰老的雄性和雌性小鼠靜脈注射(DSS6)-脂質體-si-PMIF、(DSS6)-脂質體-si-NC或(DSS6)-脂質體單藥（溶劑）。si-PMIF處理組Gli1+細胞中lnc-PMIF的表達***降低，si-PMIF處理組兩種性別小鼠的骨量更高，脛骨干骺端微結構更好，BMD和BV/TV更高，MAR和BFR/BS較高。這些發現表明，靶向沉默骨形成表面周圍OPCs中的lnc-PMIF可以促進衰老相關骨質疏松小鼠的骨形成。 circSDHC在ccRCC中過表達且其過表達與低存活率相關.
在乳腺*樣本中，LINC00926的表達與PGK1的表達呈負相關(圖1 F)。有趣的是，我們發現內源性PGK1蛋白水平和LINC00926水平在5種乳腺*細胞系(MCF-7、T47D、ZR75-1、MDA-MB-453、MDA-MB-231)中均呈負表達。在相對轉移性細胞系MDA-MB-231中PGK1表達量比較高，LINC00926表達量比較低；而惡性程度較低的細胞系MCF-7中PGK1表達量較低，LINC00926表達量較高(圖1G)。敲除LINC00926后，MCF-7細胞中PGK1的表達***增加，而過表達LINC00926后，MDA-MB-231細胞中PGK1的表達***降低(圖1H)。這些結果表明，LINC00926下調PGK1的表達，可能與PGK1介導的乳腺*發展呈負相關。為了確定水蘇糖是否參與了Tempol對PCOS大鼠的有益作用.SNP檢測標書省自然科學基金
第4周測定FITC標記的葡聚糖(4kd)和血液中FITC水平。外泌體標書國家自然科學基金
在沒有RNA配體的情況下，RIG-I采用一種自動抑制的構象，CARDs發出信號。因此假設circNDUFB2可能通過促進其CARDs釋放***RIG-I。用Co-IP檢測RIG-I的CARDs（FLAG-CARD）和螺旋酶結構域（HA-ΔCARD）之間的相互作用。結果表明circNDUFB2抑制了RIG-I的CARDs和螺旋酶結構域之間的相互作用。此外，circNDUFB2增強了CARDs與線粒體抗病毒信號蛋白（MAVS）的相互作用。這些結果表明circNDUFB2可能通過破壞CARDs與其解旋酶結構域之間的分子內相互作用來***RIG-I，并使RIG-I保持活性，從而***RIG-I-MAVS信號級聯。外泌體標書國家自然科學基金
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗