WTAP是DLBCL中piRNA-30473的一個功能重要的靶基因
作者研究WTAP是否在DLBCL的臨床結果中發(fā)揮了關鍵作用，并使用免疫組化分析來評估DLBCL患者樣本中WTAP蛋白的表達。免疫組化和GEO數(shù)據(jù)庫分析均顯示W(wǎng)TAP表達升高預示DLBCL患者預后不良(圖4A,4B)。另外耗盡WTAP也可誘導生長抑制和細胞周期阻滯，且無凋亡跡象(圖4C,4D,4E,圖4F)。通過過表達WTAP可在很大程度上挽救對piRNA-30473的抑制作用。這些數(shù)據(jù)表明WTAP是piRNA-30473的重要功能靶點，并在DLBCL中發(fā)揮致*作用。 外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物。抗體芯片
在野生型小鼠和Caspase-11缺陷小鼠中，MCD處理***降低了pro-caspase1的蛋白水平(圖5A和F)，而增加了活性Caspase-1的蛋白水平(圖5A和G)。此外，Caspase-11缺陷小鼠的活性caspase-1水平明顯低于野生型小鼠，說明MCD處理Caspase-11缺陷小鼠肝臟中Caspase-1的***較少。同樣，我們在MCD處理的Caspase-11缺陷小鼠的肝細胞中檢測到較少的Gsdmd-N表達(圖5H和I)。這些結果表明，Caspase-11缺失減弱了MCD誘導的Gsdmd和IL-1β的***。
6.Caspase-11缺乏抑制脂多糖誘導的肝細胞焦亡和體外損傷
我們在體外評價Caspase-11缺乏對肝細胞焦亡的影響。我們用脂多糖(LPS)處理野生型小鼠原代肝細胞，發(fā)現(xiàn)LPS誘導了pro-caspase-11和caspase-11的表達(圖6A和B)，表明LPS誘導了原代肝細胞中caspase-11的***。我們進一步處理來自野生型和Caspase-11缺陷小鼠的原代肝細胞，并監(jiān)測Gsdmd的表達和***。如圖6C和D所示，LPS處理未在野生型和Caspase-11缺陷的原代肝細胞中誘導pro-Gsdmd的表達。 內蒙古課題服務兩年將 CTD 暴露與 CTD 解剖學相結合使環(huán)境健康科學家能夠調查暴露研究和組織和系統(tǒng)暴露化學應激誘導表型的細節(jié)。
miR-101-3p或miR-423-5p過表達抑制體內**的發(fā)生
為了評價miR-101-3p和miR423-5p在體內的抗**作用，我們將轉染LV16-miR-101-3p、LV16-miR-423-5p或LV16-NC的Daoy細胞皮下注射Balb/c雄性裸鼠。RT-qPCR檢測miR-101-3p和miR-423-5p在慢病毒轉染的Daoy細胞中的相對表達水平。**在注射后2周被發(fā)現(xiàn)，小鼠在植入后7周被處死。與對照組相比，LV16-miR-101-3p-和LV16-miR-423-5p處理組的**生長明顯受到抑制。miR-101-3p或miR-423-5p***后，**重量也***降低。免疫組化檢測EZH2、FOXP4和Ki67在異種移植瘤組織中的表達。在表達LV16-miR-101-3p-和LV16-miR-423-5p的**組織中FOXP4和Ki-67的水平均下調，而在LV16-miR-101-3p組EZH2也下調。這些數(shù)據(jù)表明，miR-101-3p和miR-423-5p通過抑制FOXP4和EZH2的表達，在體內抑制**生長。
然而，SsD***降低了MerTK和BCL-2轉錄本的穩(wěn)定性，這隨后導致了它們的翻譯降低(圖7F和7G)。基因特異性m6A qPCR證實MerTK、BCL-2和STAT3的RNA或蛋白水平的變化是由m6A介導的mRNA穩(wěn)定性引起的。為了在體內檢測這些效應，我們將Kas-1尼洛替尼耐藥細胞移植給裸鼠。細胞接種后，為了保持耐藥表型，我們繼續(xù)每周兩次腹腔注射尼洛替尼，直到**體積接近100mm3。然后，隨機分組給予次優(yōu)劑量的SsD (圖7H)。SsD本身略微減緩了耐藥**的生長(圖7I和7J)。在機制上，我們觀察到mRNA m6A甲基化的總體增加(圖7K)。
結論：我們的研究揭示了FTO/m6A修飾信號之間之前未被認識到的聯(lián)系，并闡明了SsD在AML中的功能。該研究可能為靶向FTO/m6A的表轉錄組提供一個有前途的策略，并突出柴胡皂甙***白血病的臨床潛力。 課題外包服務找英拜放心安心。
此外，低氧誘導乳腺*細胞中依賴ZNF217的NANOG 和KLF4 的mRNA m6A甲基化抑制，且ALKBH5敲除***降低免疫缺陷小鼠乳腺*的肺轉移[24]。在肺*中，METTL3能夠促進肺腺*細胞的生長、生存和侵襲，但還不清楚它是否作為 m6A 調節(jié)器或效應器發(fā)揮作用[25]。在急性髓細胞白血病（AML）患者中，m (6) A 調控基因的突變或拷貝數(shù)變化與TP53 突變存在密切聯(lián)系，且m (6) A 調控基因的改變與AML不良預后相關[26]。此外，F(xiàn)TO在AML中高表達，它通過降低mRNA轉錄本中的m(6)水平，調節(jié)ASB2和RARA等靶點的表達，增強了白血病*基因介導的細胞轉化和白血病形成，并抑制全反式維甲酸(ATRA)誘導的AML細胞分化[27]。在脂肪形成過程中，F(xiàn)TO表達與m6A水平成負相關，促進脂肪形成[3]。在膠質細胞瘤樣細胞中，ALKBH5通過lncRNA FOXM1介導FOXM1基因pre-mRNA上的m6A修飾維持膠質瘤細胞的成瘤性[28]。此外，甲基轉移酶METTL3或METTL14的敲除，能夠改變m6A的富集和ADAM19的表達，極大地促進了膠質瘤細胞的生長、自我更新和**形成[29]。***ATM對PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。蛋白組學
我們使用抗體陣列評估了表達PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。抗體芯片
六、原始亞型預示著對激酶抑制劑的敏感性增加
生成各化合物的藥物劑量響應曲線，并比較各亞型間曲線下面積(areaunderthecurve,AUCd)(單個藥物劑量響應曲線見圖6、)。體外藥物篩選顯示，原始聚類患者樣本對索拉非尼、舒尼替尼和魯索利替尼的敏感性高于合并亞型(Wilcoxon秩和檢驗p-value分別=2E5、0.02和0.01;在UHN患者樣本中，Quizartinib的亞型間差異反應較弱，而伊馬替尼和達沙替尼的亞型間無差異(補充圖27)。使用BeatAML33數(shù)據(jù)集，驗證原始和committed亞型對激酶抑制劑的反應之間的聯(lián)系，該數(shù)據(jù)集包含npm1突變AML患者樣本的體外藥物篩選。我們觀察到UHN和BeatAML數(shù)據(jù)集之間的良好一致性，原始聚類中的樣本對Sorafenib和Sunitinib表現(xiàn)出更高的敏感性(圖6)。有趣的是，Quizartinib在UHN隊列中有微弱的差異反應，但在BeatAML隊列中卻有統(tǒng)計學意義的差異。 抗體芯片
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數(shù)據(jù)信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發(fā)區(qū)浦江園區(qū)，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經(jīng)典通路研究，設計的課題均具有后續(xù)實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，F(xiàn)ISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗