1)USP35敲除抑制肺*細胞生長、集落形成和**進展
我們首先檢測了肺*組織和細胞系中USP35豐度的變化。如圖1A所示,USP35在肺ADC和SCC**中都***上調。與正常的BEAS2B和HBE肺上皮細胞系相比,USP35mRNA水平在肺*細胞系(A549、H358、H460、H1299和H1650)中也高度表達(圖1B)。鑒于H460和H1299細胞中USP35mRNA的豐度較高,我們在下一項研究中使用了這兩種細胞系。與mRNA水平一致,在H460和H1299細胞中USP35蛋白也增加了(圖1C)。為了闡明USP35在肺*發病機制中的作用,我們在H460和H1299細胞中沉默了USP35(圖1D)。有趣的是,USP35敲除抑制了H460和H1299細胞在體外的生長能力和集落形成(圖1E、F)。來自**異種移植實驗的數據進一步表明,USP35沉默抑制了25天生長后的**體積和重量(圖1G,H)。總之,USP35在調節肺*細胞生長和**進展中起著關鍵作用。 醫學整體課題外包服務。云南課題國家自然科學基金
C.為了評估這種差異對每種方法獲得的數據的影響,在TSS和CTCF轉錄因子結合位點附近覆蓋了Tn5足跡。在透性細胞中,TSS的信號被保留,但是與孤立的核相比,TSS的側翼位置(被鄰近的核小體占據)的信號減少了
D.用白細胞分離純化的pbmc比用Ficoll梯度離心純化的pbmc始終具有更高的FRIP評分和更少的非細胞條形碼。
E.F.FACS獲得的完整通透細胞具有比較高的frp和FRITSS評分,**少的非細胞條形碼和比較大的細胞捕獲效率,線粒體閱讀量*略有增加. 湖北課題實驗外包公共比較毒理基因組學數據庫。
脂質氧化先于胞質Ca2+的增加和質膜的破壞
體積細胞實驗中Ferroptosis特征之間的詳細時間關系被***后群體細胞發生Ferroptosis的異質性所掩蓋。為了解決這個問題,作者使用活細胞共聚焦顯微鏡在單細胞水平上量化了Fluo-4AM信號、細胞圓度和PI攝入量的增加。從單個細胞獲得的動力學曲線(圖2C,F,K)中,計算出每個ferroptotic表型(t50)實現50%變化所需的時間,這使得可以設置Ferroptosis各過程之間的滯后時間(圖2D,G,L)。結果發現,與所使用的Ferroptosis觸發器無關,胞漿Ca2+的增加先于細胞圓縮和質膜完全坍塌(圖2A,B)。從流式細胞術實驗(圖1G)可以看出,Erastin-1存在時,胞質Ca2+的增加是一個雙相行為的兩步過程(圖2C)。***個事件在比較大Ca2+信號的40%左右達到飽和,與不相關的鈣(Ca2+un)增加相對應,因為它沒有受到Ferroptosis的抑制(圖1G)。
二、TBI破壞了NPC和Ran***1的分布,導致TBPH/NPC共聚集
使用鼻咽*標記Mab414,它可以識別包括Nup62在內的幾個Nups的FG結構域,我們發現在非tbi控制的果蠅大腦中,核膜上有一個主要的同質的環狀標記。非腦外傷對照組的腹神經索(VNC)鼻咽*染色呈均勻分布。相比之下,暴露于TBI的vnc核膜NPC染色不規則,顯示核形態紊亂。我們在腦外傷后觀察到核膜間隙和聚集(Mab414團塊)的出現(圖2A)。TBI腦中Mab414染色異常的細胞百分比明顯高于非TBI對照(圖2B)。tbi暴露的vnc中Tbph和Mab414的核周和細胞質共聚集,而對照大腦顯示很少或沒有共聚集(圖2C)。定量結果顯示,與對照組相比,tbi暴露的vnc中具有共聚集的Mab414 tbph陽性細胞百分比***升高(圖2D)。 進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應。
PTEN表達檢測的總有效率約為70%,而PTEN表達陰性患者的總有效率*為20%。PTEN功能的喪失通常與基因組的不穩定性有關。此外,小鼠胚胎成纖維細胞(mef)中PTEN基因的缺失導致了未修復的DNA雙鏈斷裂的積累。PTEN缺失被認為通過至少兩種分子機制促進了基因組的完整性。在細胞核中,PTEN與著絲粒結合蛋白CENP-C結合,促進著絲粒組裝和中期到后期的轉變。此外,作為轉錄因子E2F1的輔助因子,核PTEN似乎調節Rad51的表達,Rad51是DNA修復機制的關鍵組成部分。然而,后續的研究得出了不一致的結果,表明PTEN在轉錄水平上對RAD51的調控可能***于特定的細胞環境。PTEN缺陷改變了多個細胞周期檢查點,可能留下更少的時間進行DNA損傷修復和/或染色體分離。細胞周期的進展需要幾個分子過程的完美執行,以確保一個熟練的,無錯誤的,細胞分裂。這些事件發生的速度由周期蛋白依賴激酶(CDKs)的活性決定,CDKs磷酸化關鍵底物以促進DNA合成和有絲分裂進程TIMEOR是***個基于 Web 的自適應時間序列多組學管道方法。福建課題中標率高
致力于醫學相關領域的實驗技術服務和相關生物醫學課題的研究。云南課題國家自然科學基金
紡錘體裝配檢查點(SAC)作為一個傳感器的**的著絲點延遲有絲分裂進入后期,直到適當的染色體分離得到保證。這一安全機制的破壞導致基因組不穩定和非整倍體,這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而,盡管了解了控制SAC的基本機制,但信號通路如何直接與有絲分裂檢查點活動相互作用和調節仍是未知的。在對細胞外刺激的反應中,參與細胞生長、生存和分化的多種信號通路網絡被***,這一過程***受到Ras家族小鳥苷三磷酸酶(GTPases)的調控。RIT1是一種ras相關的GTPase,調節細胞存活和應激反應,是通過有絲分裂和適當的染色體分離及時進展的必要條件。RIT1在有絲分裂期間從質膜(PM)分離,并直接與SAC蛋白MAD2和p31conmet相互作用,該過程受周期蛋白依賴性激酶1 (CDK1)活性的調節。此外,致病水平的RIT1沉默了SAC,并通過將MAD2從有絲分裂檢查點復合體(MCC)中分離出來,加速了通過有絲分裂的轉運。此外,致病性RIT1抑制SAC促進染色體分離錯誤和非整倍體。我們的研究結果突出了RIT1與其他Ras GTPases相比的獨特功能,并闡明了信號通路與SAC之間通過一種新的調節機制的直接聯系。云南課題國家自然科學基金
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