自噬“貨物”是有選擇性裝載的，其中主要依靠LIR基序與LC3互作，形成自噬體。隨后，自噬體進行運輸、溶解。研究表明，自噬異常會影響疾病進程。**中的自噬具有雙重作用：一方面自噬的發生會增強*細胞的生存能力；另一方面，抑制自噬會造成“廢物”的積累、基因突變等，誘發**。
1、Meta-GWAS分析
收集三組GWAS數據用于meta分析，確定了35個基因區域中36個**的基因突變（p<5×10?8）。接下來，分析SNP200kb內與AD***相關(p<10-5)的突變，篩選獲得PRKD3/NDUFAF7,SHARPIN,CHRNE,PLCG2,APP6個基因，這6個基因都存在于AD發病***相關的突變。
2、多基因風險評分（PRS）
為了評估AD遺傳景觀的穩健性和綜合效應，基于39個遺傳變異（不包括APOE基因型）構建了一個加權PRS。
接下來測試了RPS與臨床診斷的關聯。PRS與臨床診斷的AD病例的關聯與病理證實的AD的關聯相似；在伴隨的腦部病變（除AD之外）存在的情況下PRS與AD相關；在不同性別中，RPS與AD的相關性無差異，并且在早發型、晚發型中效果一致。
3、PRS有可能及早識別有風險的受試者
使用12,386例樣本分析RPS能否識別早發型AD（AAO），結果表明，PRS與APOE基因型相結合，可能對AAO進行有效的預測。 有肝轉移的PDAC患者外泌體CD44v6和C1QBP的表達明顯高于無肝轉移的PDAC患者。空間轉錄組學課題整體服務
為了探究MIR210HG是否參與了一個新的MIR210HG- miRNA -HMGA2調控網絡，我們使用TargetScan、miRanda、CLIP-Seq和miRDB生物信息學數據庫來預測與HMGA2結合的mirna(圖3F)。選擇3個軟件程序分析交叉處的miRNAs作為候選miRNAs。通過將野生型雙熒光素酶載體介導的HMGA2構建物共轉染HEK293T細胞，共鑒定和篩選了110個miRNAs。轉染后，23個miRNA轉染細胞的熒光素酶活性***降低(圖3G)。在上述23種miRNAs中，轉染miR-3373p、miR-137、let-7c-5p和miR-98-5p時，熒光素酶活性***降低，其中轉染miR-337-3p和miR-137時，熒光素酶活性降低**多。利用生物信息學數據庫TargetScan預測miR-337-3p和miR-137中與HMGA2結合的位點。雙熒光素酶基因報告基因檢測結果顯示，miR-337-3p和miR-137在其預測的結合位點上結合HMGA2(圖3H)。qPCR結果顯示，miR-337-3p和miR-137負調控HMGA2的表達(圖3I)。采用Pearson’s秩相關法分析MIR210HG與HMGA2表達的相關性，發現HMGA2的表達與MIR210HG呈正相關(圖3 J和K)。這些結果表明MIR210HG可能參與了新的MIR210HG-miR-337-3p/137-HMGA2調控網絡。單細胞相關課題課題推薦咨詢解決了對確定因果調節機制網絡的方法的關鍵需求。
四、scRNA-seq和scATAC-seq數據整合
目前尚無人類胚胎HSPCs的染色質可及性圖譜，研究者基于基因體可及性繪制細胞圖譜來整合scRNA-seq和scATAC-seq數據。首先使用6種豐富的細胞類型對scRNA-seq實驗中篩選出的CD34+ CD38- 細胞進行分類，結果顯示scATAC-seq數據集中指定細胞類型的頻率與scRNA-seq數據中的頻率高度一致，這表明染色質可及性和轉錄組具有相關性。然而，不同類型的細胞在整個軌跡上有相當大的混合，如HSCs/MPPs-Cycle***分布在七個集群中，這表明在HSCs/MPP群體中存在***的染色質啟動，從而導致了異質性。之后研究者比較了7個集群中HSCs /MPPs中選定的譜系特異性TF基序的可及性，結果顯示在轉錄同源的HSCs/MPPs集群中，一些先于基因表達的TFs的活性存在***差異。 ***，研究者進一步探索分化過程中染色質可及性和基因表達之間的“時滯”，結果顯示在HSCs/MPS中，GATA1-調節子靶基因的啟動子在任何明顯基因表達之前均是開放的，這證實HSCs/MPP中染色質的可及性早于轉錄變化。
例如，雖然之前認為抗PD-1可以阻斷**末期枯竭的T細胞上的PD-1信號，但這種直接模型已經受到質疑，表明PD-1成功阻斷可能作用于分化較低的類祖細胞，高比例的**浸潤**終耗盡的T細胞預測抗pd -1的耐藥。此外，雖然代謝相關因素，如**細胞消耗氧氣和產生缺氧的能力，可以預測對PD-1阻斷劑的抗性18，但這些環境壓力源已被證明對T細胞功能有不同的影響。缺氧誘導因子1α (HIF1α)及其負調控因子此前已被證實與T細胞***有關23，而在缺氧條件下***細胞的擴張可增強**殺傷能力。然而，無論是在隔離狀態還是在體內，缺氧都具有明顯的免疫抑制作用。因此，雖然代謝壓力和T細胞衰竭有聯系，但尚不清楚T細胞衰竭是否促進了導致細胞代謝改變的程序，或者是否代謝不足和壓力直接導致了T細胞衰竭。小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現典型的外泌體結構。
在Jurkat和小鼠T細胞中檢測到多個肽上特異性磷酸化位點的***缺失，包括典型的CDK4/6靶標RB和RBL 1/2 (Fig. 3D-F)。值得注意的是，RB在兩種細胞蛋白組學中重疊，并且是全基因組CRISPR/Cas9篩選*****的（Fig. 3B，3G），表明CDK4/6i介導的記憶形成是由RB介導。因此，靶向敲除RB1，可以消除CD62L的表達上調(Fig. 3H)。3’RNA-seq分析顯示RB缺失廢除了轉錄對CDK4/6i的響應，包括SELL，其被CDK4/6i誘導的轉錄改變被RB缺失所大幅度減弱了(Fig. 3I)。與此一致，靶向敲除RB1也廢除了***的初級小鼠CD8+T細胞的Tcm形成(Fig. 3J)。動物建模模型實驗的整體服務。代謝組學課題實驗可參觀
將 CTD 暴露與 CTD 解剖學相結合使環境健康科學家能夠調查暴露研究和組織和系統暴露化學應激誘導表型的細節。空間轉錄組學課題整體服務
蛋白降解靶向嵌合體(Proteolysis-TargetingChimeras,PROTACs)是一種新的具有良好前景的藥物類型，其結構類似于啞鈴，通過一個連接子(linker)連接“靶蛋白的配體”以及“E3泛素連接酶的招募配體”，即泛素-蛋白酶體系統選擇性降解靶蛋白。已成為一種新型***技術，具有優于傳統抑制策略的潛在優勢。***講一篇浙江大學侯廷軍教授團隊發表在NucleicAcidsResearch期刊上的關于PROTAC在線數據庫的文章，文章提名為PROTAC-DB:anonlinedatabaseofPROTACs。PROTAC這項技術仍日趨成熟，但PROTAC的設計仍然是一個巨大的挑戰。為了促進PROTAC的合理設計，文章提出PROTAC-DB，這是一個基于Web的開放訪問數據庫，它集成了PROTAC的結構信息和實驗數據。空間轉錄組學課題整體服務
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7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗