8)人類乳腺*患者中LINC00926和PGK1表達的相關性
及LINC00926與葡萄糖攝取的相關性我們通過IHC和FISH檢測109例人乳腺*樣本中PGK1和LINC00926的表達情況。與培養細胞中LINC00926抑制PGK1的結果一致,LINC00926的表達與PGK1的表達呈負相關,與FOXO3A呈正相關(圖8A)。通過18FDGPET掃描評估葡萄糖攝取增加的乳腺**患者顯示LINC00926和FOXO3A表達降低,而PGK1表達增加(圖8B)。綜上所述,這些數據表明了LINC00926/PGK1軸在乳腺*中的重要病理作用。
結論我們的研究***證實了LINC00926通過抑制糖酵解關鍵酶PGK1的表達來抑制糖酵解,從而在體內外抑制乳腺*細胞的增殖、侵襲和轉移。在乳腺*患者中,FOXO3A調控的LINC00926與PGK1表達呈負相關。這些發現概述了FOXO3A/LINC00926/PGK1軸在Warburg效應和乳腺**發生進展中的重要性。因此,上調LINC00926可能是***PGK1過表達的乳腺*患者的一種有前途的方法。 IGF-1信號在Pex誘導的肝纖維化中起重要作用。肝損傷課題CRO
這些明確的造血干細胞在妊娠后4周(pcw)首先在胎兒肝臟定植,并在那里大量擴張。在10.5 pcw時,造血部位再次轉移到骨腔(即骨髓[BM]),成人造血在此處長久建立。人們認為,***批在骨髓中播種的造血干細胞在其增殖和分化特性發生戲劇性變化之前,會繼續快速增加數量,以適應高產量分化子代的需要。
歷史上,造血系統的分化過程被描述為一系列中間步驟,由細胞表面標記物(即分化簇[CD])定義。在這個模型中,造血干細胞通常表現為造血樹,造血干細胞產生了越來越多的譜系限制性細胞類型,**終導致成熟的血細胞。這種模式在過去的5年里發生了改變,一些研究報告了數千個單個造血細胞的轉錄組,這些細胞被細胞表面標記物隔離,在小鼠模型和成人中。這些報告表明,以前被認為是同質的祖先種群,實際上在轉錄水平上是非常異構的。 細胞因子芯片英拜生物對整體實驗實施的全局把控。
細胞周期蛋白依賴性激酶4和6(CDK4/6)的藥理學抑制劑是***受體陽性乳腺*的獲批***藥物,目前正在其他**類型的數百項臨床試驗中進行評價。這些抑制劑的臨床成功在很大程度上歸因于定義明確的**內在細胞抑制機制,而其作為免疫調節劑的新作用知之甚少。本研究利用整合的表觀基因組、轉錄組學和蛋白質組學分析,證明了CDK4/6抑制劑在促進免疫T細胞記憶的表型和功能獲得中的新作用。本文的機制見解拓寬了CDK4/6抑制劑作為增強抗**T細胞免疫的臨床工具的前瞻性效用。本研究于2021年5月14日發表在《Cancer Discovery》IF:29.497期刊上。
1)SsD在AML中表現出抗增殖活性
為了闡明SsD在白血病中的藥理作用,我們在10個人白血病細胞系中探討了一系列SsD濃度的影響。我們發現SsD在大多數白血病細胞系中以劑量依賴的方式抑制細胞活力(圖1A)。為了進一步研究SsD對白血病的抑制作用,我們在4種白血病細胞系NB4、kas1、MV4-11和U937(SsD敏感性排名前4位的細胞)進行了集落實驗。與細胞活力結果相似,SsD***抑制了所測細胞系的集落數量和大小(圖1B-E)。有趣的是,SsD對細胞增殖和活力的抑制可能是由于細胞周期阻滯在G1期和NB4細胞凋亡增加(圖1F-G)。 可以上傳原始的fast文件。
2)SsD響應相關基因和通路的鑒定
為了進一步確定可能與白血病細胞中SsD敏感性相關的潛在靶點,我們對SsD處理過的NB4細胞進行了RNA測序。我們共發現3732個上調基因和3442個下調基因(圖2A)。為了揭示SsD的潛在機制,我們進行了富集分析并研究了差異基因相關的通路。我們篩選了上調和下調基因富集的**個通路(圖2B)。此外,我們使用GSEA研究SsD處理影響的信號通路(圖2C)。我們的數據顯示,SsD處理導致MYC靶點、E2F靶點和G2M檢查點信號級聯受到抑制。有趣的是,這些發現與FTO抑制劑和內源性FTO的下調抑制的信號通路相一致。因此,SsD的抑制作用可能有助于FTO抑制細胞周期和增殖(圖2D-E)。此外,絕大多數通過FTO敲低而上調的信號通路對SsD富集,同樣,絕大多數被SsD抑制的信號通路也被FTO敲低而抑制(圖2F)。更重要的是,SsD介導的m6A相關基因的變化具有***的一致性(圖2G)。綜上所述,SsD可能參與了FTO介導的m6ARNA甲基化途徑。 高通量分子實驗的后續標書申請指導服務。克羅恩課題課題設計
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miR-144通過FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路發揮促血管生成功能
我們確定NPC-EV來源的miR-144是否通過介導FBXW7/HIF-1α/VEGF-A通路促進HUVECs的血管樣管形成。免疫印跡分析結果表明,在miR-144抑制劑處理的鼻咽*細胞來源的EVs中,si-FBXW7處理導致FBXW7表達下調,HIF-1α和VEGF-A表達升高。這表明miR-144對HIF-1α/VEGF-A通路的影響是以FBXW7依賴的方式發生的(圖6A)。同樣地,我們還發現與單獨抑制miR-144相比,聯合抑制miR-144和FBXW7后,HUVEC的遷移(圖6B)和侵襲(圖6C)增強,以及血管樣管形成(圖6D)增加,這表明miR-144在體外依賴于FBXW7的促血管生成功能。體內Matrigel栓試驗(圖6E和6F)顯示,與單獨抑制miR-144相比,包含miR144模擬物處理過的鼻咽*細胞EVs的凝膠栓在miR-144和FBXW7抑制聯合作用下,新形成的血管增強了,說明NPC-EVmiR-144在體內依賴于FBXW7的促血管生成功能。
結論:總之,本研究的關鍵發現為EV來源的miR-144在體外鼻咽*的進展中發揮促進作用提供了證據。具體來說,miR-144可以通過鼻咽*細胞來源的EVs轉運到HUVECs,**終強化其惡性表型,為鼻咽*基于EVs的生物標志物和***方式的發展提供了一個新靶點。 肝損傷課題CRO
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗