為了探索 HIF1α促進circMYH9表達的分子機制，測量了 MYH9 前體 mRNA 的表達。SG或Glu饑餓增加了MYH9的前體mRNA 水平，HIF1α敲低降低了缺乏SG或Glu的CRC細胞中的MYH9前體 mRNA 水平。這些結果表明HIF1α在轉錄水平上促進 MYH9 前體 mRNA，這進一步增加了circMYH9。使用 JASPAR 搜索了MYH9啟動子中的HIF1α結合位點和基序。確定了兩個**可能的HIF1α結合位點。ChIP-qPCR 證明 HIF1α與HCT116細胞中MYH9 啟動子的兩個HBS位點結合。為了證實HIF1α通過HBS促進MYH9表達，構建了包含全長MYH9啟動子區域和HBS缺失的circMYH9啟動子區域的熒光素酶報告基因。HBS1或HBS2的缺失部分消除了HIF1α敲低或過表達對MYH9 熒光素酶報告基因活性的抑制或促進，而HBS1和HBS2的缺失則完全消除了 HIF1α shRNA 或質粒對MYH9熒光素酶報告基因活性的影響。這些數據表明，HBS區域對于SG或Glu剝奪下的HIF1α依賴性circMYH9轉錄調控至關重要。表達PTEN- 398A的細胞中上調的基因與G1/S檢查點的***有關。課題服務價格
5、血漿外泌體S100A4和OPN水平聯合可以作為HCC患者術后的強力預后因子
在168例接受肝切除術的HCC患者中，進一步研究了血漿外泌體S100A4和OPN水平的臨床意義。結果發現外泌體S100A4水平和OPN的表達***正相關，并且外泌體S100A4低表達組患者的總體生存率和無疾病生存率要***高于外泌體S100A4高表達組（圖6b-d）。隨后，基于外泌體S100A4水平和OPN水平的聯合分析，將患者分為4組，結果發現雙低水平S100A4和OPN組具有比較好的預后，而雙高組則預后**差（圖6e-f）。 生物相關課題外泌體CD44v6和C1QBP可能是預測PDAC患者預后的有前途的生物標志物。
七、YTHDF1-FZD7-b-catenin軸促進胃*進展
和B, Western blot分析YTHDF1、FZD7、B -catenin和***的B -catenin在YTHDF1敲低的MGC-803 (A)和HGC-27 (B)細胞中轉染FZD7構建物或空載體對照。C和D，如上所述MGC-803 (C)和HGC-27 (D)細胞的增殖。E，如上所述MGC-803(左)和HGC-27(右)細胞的遷移分析。F，如上所述MGC-803(左)和HGC-27(右)細胞的侵襲分析。G，熱圖顯示YTHDF1, FZD7，(總)b-catenin在人胃*樣本中的表達結果(n= 79)。H, YTHDF1、FZD7和(總)b-catenin在人胃*樣本中的表達的相關性分析(n= 79;Pearson和Spearman相關檢驗)。I，三對胃**及鄰近正常組織中YTHDF1、FZD7、活化b-catenin的代表性IHC芯片結果。J，胃*患者YTHDF1、FZD7、(total) b-catenin (low, n 39; high, n 40)及總生存率Kaplan Meier分析(log-rank with Mantel Cox test)。K，顯示YTHDF1如何調節b-catenin信號通路促進胃*進展的示意圖。
TransCirc數據庫整合了各種與翻譯相關的證據，檢索的結果能直觀的呈現翻譯產物的相關證據信息。數據共分析了328080種已知人類circRNA的翻譯潛能，有蛋白質譜證據（MS）的circRNA有168個，核糖體印跡或多聚核糖體分析（RP/PP）的證據4284個circRNA，潛在翻譯產物序列分析（SeqComp）的301100個circRNA。有IRES預測結果的314138個circRNA，有m6A修飾位點信息的39397個circRNA，有翻譯起始位點信息（TIS）的9394個circRNA，有ORF信息的305016個circRNA。ATM對PTEN的磷酸化驅動細胞周期進程。
為了確定EVs介導的ELNAT1在體內促進LN轉移，首先構建一個小鼠腘窩的淋巴結轉移模型。小鼠隨機分為2組（n=12），每3天接受由載體（UM-UC-EVVector）或ELNAT1（UM-UC-3-EVELNAT1）轉染的UM-UC-3細胞分泌的EVs瘤內注射，當原發**大小達到200mm3時采集**和腘窩的LNs（Figure3D）。結果發現，通過體內成像系統（IVIS）發現，與UM-UC-EVVector相比，UM-UC-3-EVELNAT1促進了UM-UC-3細胞向腘窩LNs的轉移，LNs體積更大（Figure3E-I）。
由于淋巴管生成是淋巴結轉移的關鍵步驟，因此進一步評估了EVs介導的ELNAT1在體內對淋巴管生成的影響。結果顯示，UM-UC-3-EVELNAT1組***增加了小鼠足底**瘤內和瘤旁區域的淋巴管內皮透明質酸受體1陽性（LYVE-1positive）（Figure3J,K）。以上結果表明，EVs介導的ELNAT1促進BCa體內淋巴管生成和淋巴結轉移。 進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應。推廣課題服務兩年
我們使用抗體陣列評估了表達PTEN- wt或PTEN- 398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。課題服務價格
7.EVs介導的ELNAT1被HLECs內化以誘導淋巴管生成
共聚焦顯微鏡顯示HLECs中PKH67標記EVs孵育后的點狀熒光強度（Figure7A），表明HLECs內化了BCa分泌的EVs。此外,孵化UM-UC-3-EVELNAT1***上調HLECs中ELNAT1表達,而孵化T24-EVsi-ELNAT1，則T24細胞分泌的EVs中ELNAT1表達下調，則削弱了HLECs中EVs誘導ELNAT1過表達的能力（Figure7B,C）。為了排除淋巴血管生成是由內源性ELNAT1***HLECs中誘導的可能性，構建了ELNAT1-KOHLECSELNAT1（HLECsELNAT1-KO）模型（Figure7D,E）。與HLECsELNAT1-WT一致，我們觀察到，EVs介導的ELNAT1過表達增強了HLECsELNAT1-KO的管狀形成和遷移能力，而下調ELNAT1則抑制了BCa細胞分泌EVs誘導HLECsELNAT1-KO管狀形成和遷移的能力（Figure7F-H）。這表明BCa細胞分泌的EVs通過運輸EVs介導的ELNAT1促進淋巴管生成，而不是轉錄***內源性的ELNAT1。綜上所述，這些結果表明EVs介導的ELNAT1被HLECs內化誘導BCa淋巴管生成。 課題服務價格
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗