HIF***可促進DMF誘導的CRC細胞死亡
作者的篩選鑒定出DMF是一種小分子,可以有效地減少低氧**腸道樣體的生長。一組CRC細胞系使用DMF單獨或聯合缺氧或模擬缺氧FG4592處理。通過MTT和長期克隆生存試驗評估,FG4592增強DMF誘導的CRC細胞死亡。此外,DMF處理和缺氧培養的細胞存活率較低。與erastin和RSL3數據一致,HIF-2α是促進DMF介導的CRC細胞生長的關鍵。
DMF**于鐵死亡誘導細胞死亡
由于DMF與其他細胞對鐵死亡***劑一起有效地降低了缺氧細胞的生長,我們評估了DMF是否介導了鐵死亡***劑的死亡。在DMF處理后,Fer-1和Lip-1不能挽救細胞的死亡和活力,而rsl3介導的細胞死亡被Fer-1和Lip-1挽救。在DMF處理后,Fer-1和Lip-1不能挽救細胞的死亡和活力,而RSL3介導的細胞死亡被Fer-1和Lip-1挽救。DMF可與抗氧化劑GSH直接反應,導致NADPH降低,ROS增強。然而,FG4592和糖酵解抑制劑的共同作用并沒有降低細胞活力。這些結果表明,在DMF介導的缺氧**細胞死亡中有其他機制參與。 高通量測序后續的機制實驗。項目課題技術指導
1、循環miR-208b是CRC中FOLFOX化療敏感性的一種很有前途的生物標志物如圖1所示,作者設計了一項多期研究,以確定新的血清miRNAs作為預測和監測奧沙利鉑聯合亞葉酸和5-FU(FOLFOX)化療反應的替代標志物。
作者檢測了69個化療敏感和47個化療不敏感患者的血漿中miR-208b表達,結果顯示與未響應組相比,miR-208b的表達水平在響應組***下調(圖2A-B)。同時檢測了血清*胚抗原(CEA)水平,血清miR-208b的曲線下面積(AUC)與血清CEA的AUC相比,優于血清CEA水平。在化療響應組,在化療前miR-208b的表達高于化療后,而在未響應組,化療前低于化療后水平(圖2C)。生存分析顯示,無進展生存期化療響應組***高于未響應組,miR-208b低表達組***高于高表達組(圖2D)。這些結果表明miR-208b可作為預測CRC中FOLFOX化療敏感性的非侵襲性標志物。 鐵死亡課題協同創作小鼠正常胰腺(Npex)和小鼠PDAC細胞分離的外泌體呈現典型的外泌體結構。
IFNα和抗CD3/CD28磁珠長期刺激后CD8 + T細胞中SRC能力的降低表明生物能量適應性受損。研究發現,IFNα刺激的CD8 + T細胞在初始爆發后,與*用CD3/CD28刺激的CD8 + T細胞相比,其氧化和糖酵解能力下降更快(圖4d)。總之,使用健康對照CD8 + T細胞的體外研究表明,雖然單獨延長IFNα處理能夠觸發可檢測的代謝改變,但只有IFNα暴露和T細胞活化的聯合才能表型復制IFN-High SLE患者CD8 + T細胞中觀察到的線粒體和代謝異常。
5、IFNα暴露誘導慢性***CD8+T細胞死亡
在建立重現SLECD8+T細胞代謝變化的實驗條件后,接下來研究了下游效應。與SLE患者的離體數據一致,發現IFNα暴露延長聯合T細胞活化可促進CD8+T細胞的自發死亡(圖5a)。與自發性細胞死亡數據一致,作者發現再激發后,暴露于IFNα的細胞中表達AnnexinV的增殖性CD8+T細胞百分比***增加(圖5b)。此外,在IFN刺激的細胞中檢測到較少的脫顆粒(CD107a陽性)和活化的(CD69和CD25陽性)CD8+T細胞(圖5c)。總之,數據表明,I型IFN改變了SLE患者CD8+T細胞的代謝,導致TCR再激發后細胞存活率降低。
2021年6月,***一篇發表在Microbiome(IF=11.607)的文章(Microbiotalong-termdynamicsandpredictionofacutegraft-versus-hostdiseaseinpediatricallogeneicstemcelltransplantation.)從共生功能體視點的角度對29名接受同種異體造血干細胞移植的兒童的腸道、口腔和鼻腔微生物群進行了綜合宿主微生物群分析。***揭示了口腔和鼻子中的細菌可能預測急性移植物抗宿主病(aGvHD)。監測HSCT患者不同身體部位的微生物群,特別是通過移植前樣本的參與,可能具有預后價值,并有助于指導個性化***策略。識別具有預測移植后aGvHD潛力的獨特細菌,可能為改進預防性臨床管理提供機會,包括對微生物群的調節。背景:在異種造血干細胞移植(allogeneichematopoieticstemcelltransplantation,allo-HSCT)中,供者來源的干細胞輸注被用于***各種類型的血液病和非血液病。在異種造血干細胞移植患者中,移植后人體腸道菌群發生變化,這可能部分歸因于******和調理方案。我們接下來研究了Pex對HSCs生物學行為的影響。
磷酸甘油酸激酶1 (PGK1)是糖酵解途徑的重要組成部分,與多種**的發***展有關。然而,PGK1抑制劑在*細胞中的抑制機制和生理意義尚不清楚。因此,***給大家介紹于2021年4月發表于“Molecular Therapy”(IF=8.986)的文章“FOXO3A-induced LINC00926 suppresses breast tumor growth and metastasis through inhibition of PGK1-mediated Warburg effect”。在這里,我們鑒定了一個負調控PGK1表達的lncRNA LINC00926,并預測乳腺*良好的臨床預后。我們的研究建立了FOXO3A/LINC00926/PGK1作為調節乳腺*生長和進展的關鍵軸。靶向PGK1或補充LINC00926或FOXO3A可能是乳腺*的潛在***策略。促*分泌體通過外泌體傳遞和運輸是轉移前微環境形成和轉移的關鍵。課題地區科學基金
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circACTN4 和 FIR 與 FUBP1 競爭結合
推測circACTN4可以與FUBP1競爭性結合并阻止FIR與FUBP1結合以促進 MYC的轉錄和表達。為了進一步驗證提出的假設,qRT-PCR檢測了BC和匹配組織中FIR的表達,與正常相鄰組織相比,BC組織中FIR的表達顯著下調。Pearson相關分析表明,FIR的表達與BC組織中circACTN4、FUBP1和MYC的水平呈負相關。免疫共沉淀試驗結果表明,在過表達circACTN4的BC細胞的FUBP1-共免疫共沉淀物中未發現明顯的FIR蛋白帶,而在circACTN4被敲低后,通過蛋白質印跡在共免疫共沉淀物中明顯檢測到FIR,這表明上調的circACTN4顯著削弱FIR與 FUBP1的結合,同時下調 circACTN4 顯著加強了 FUBP1 和 FIR 之間的相互作用。ChIP分析結果表明,高濃度si-circ#2轉染后FIR和FUSE的結合水平高于低濃度si-circ#2轉染后FIR和FUSE的結合水平。 項目課題技術指導
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5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗