紡錘體裝配檢查點(SAC)作為一個傳感器的**的著絲點延遲有絲分裂進入后期,直到適當的染色體分離得到保證。這一安全機制的破壞導致基因組不穩定和非整倍體,這是胚胎死亡、先天性出生缺陷、智力殘疾和**的遺傳原因。然而,盡管了解了控制SAC的基本機制,但信號通路如何直接與有絲分裂檢查點活動相互作用和調節仍是未知的。在對細胞外刺激的反應中,參與細胞生長、生存和分化的多種信號通路網絡被***,這一過程***受到Ras家族小鳥苷三磷酸酶(GTPases)的調控。RIT1是一種ras相關的GTPase,調節細胞存活和應激反應,是通過有絲分裂和適當的染色體分離及時進展的必要條件。RIT1在有絲分裂期間從質膜(PM)分離,并直接與SAC蛋白MAD2和p31conmet相互作用,該過程受周期蛋白依賴性激酶1 (CDK1)活性的調節。此外,致病水平的RIT1沉默了SAC,并通過將MAD2從有絲分裂檢查點復合體(MCC)中分離出來,加速了通過有絲分裂的轉運。此外,致病性RIT1抑制SAC促進染色體分離錯誤和非整倍體。我們的研究結果突出了RIT1與其他Ras GTPases相比的獨特功能,并闡明了信號通路與SAC之間通過一種新的調節機制的直接聯系。在786-O細胞中穩定轉染靶向circSDHC的shRNA.醫學課題標書
二、npm1突變AML患者聚集的分子基礎
DH2是鈣粘蛋白家族的一員,被認為是決定干細胞命運的調節因子15。類似地,G蛋白偶聯受體12(GPR12)在原始亞型中上調,已知在干細胞維持和**干細胞的體細胞重編程中發揮作用。MyoD家族抑制劑(MDFI)在原始亞型中表達增加,據報道它是WNT信號通路的調節因子,只在造血干細胞祖細胞中表達。鋅指蛋白521(ZNF521)是一種轉錄因子,其在人類白血病細胞系中被敲低可以減少增殖但在原始亞型中卻有***的高表達。CD163是一種免疫調節劑,是巨噬細胞清清體受體家族的成員,已知在單核細胞系的AML細胞中表達。在committedcluster中其他基因的高表達包括免疫相關基因,如C1QA,CD14和MARCO。msl1基因,一種已知的白血病干細胞增殖抑制因子,也在committedcluster中高表達。我們通過qPCR驗證了關鍵基因的差異表達(圖2B)。使用基因**富集分析(GSEA),在committed亞型中,免疫反應通路如干擾素-γ介導的信號通路、GPCR信號通路和toll樣受體(TLR)信號通路上調(圖2C,D,SupplementaryFigs.16,18,與FLT3-ITD和DNMT3A突變的弱相關性一致。 國家自然科學基金會評流程水蘇糖確實改善了PCOS大鼠卵巢功能障礙改善了卵巢組織病理損傷。
USF2促進circACTN4在BC中的表達為
了研究 circRNA 在 BC發展中的功能,利用芯片分析檢測了4對BC組織和*旁組織中circRNA表達特征。共發現85個***差異表達的circRNAs, 63 個上調和22個下調circRNAs。熱圖顯示了14個上調的circRNA,其中circACTN4是失調**嚴重的一個,差異高達10倍。根據circBase數據庫發現circACTN4來自位于人類19號染色體上的ACTN4基因,產生于ACTN4外顯子2至外顯子7(共571bp),通過 Sanger 測序驗證了反向剪接連接點。為了驗證circACTN4的環形結構,使用聚斂引物和發散引物擴增環狀 circACTN4 和線性 ACTN4。通過FISH和核質分離PCR觀察到circACTN4主要位于BC細胞的細胞核中, circACTN4在*組織中的表達高于*旁組織。
進一步檢測S100A4的功能,結果顯示敲除S100A4***降低高轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力,過表達S100A4則***增強低轉移性HCC細胞系的遷移和侵襲能力(圖3d)。然后作者收集了S100A4敲除和S100A4過表達的HCC細胞的外泌體,結果得到了類似的結論,S100A4過表達外泌體***增強HCC細胞的遷移和侵襲,以及體內肺部轉移的能力(圖3e-f)。這些結果證實了外泌體S100A4具有增強HCC細胞轉移潛力的功能。
4、外泌體S100A4通過STAT3磷酸化***OPN轉錄
接下來探究了S100A4的作用機制,首先選擇了21個**干性相關基因,然后下載了GEO數據進行相關性分析,結果顯示S100A4主要和11個基因正相關(圖4a)。隨后檢測了不同HCC細胞系中敲除和過表達S100A4后11個基因的表達水平的改變,結果顯示只有OPN是S100A4的下游基因,其表達受到S100A4的調控(圖4b-f)。OPN是促進HCC轉移和干性的關鍵因子,但外泌體S100A4調節OPN的機制仍不清楚。 采用非靶向代謝組學方法測量三組血清代謝產物?
一、人胎肝和骨髓造血室的單細胞轉錄組
為獲取胚胎發育期間造血細胞的全部譜系,研究者從17 – 22 PCW的胚胎肝臟、股骨和髖骨中對表型確定的血液群體進行單細胞分類,并對15個胚胎的單個細胞進行scRNA-seq檢測(圖1)。基于差異表達分析和標準化表達***性排名前20的標記基因,標注了23個不同的群體,發現在肝臟或股骨中檢測不到任何T細胞或先天淋巴細胞(ILCs),單細胞分析顯示在所有免疫表型定義的干細胞和祖細胞群體中存在大量的轉錄異質性,其中一些表型祖細胞群體(如HSCs,MPPs,CMPs,GMPs,MEPs和CLPs)由10多個不同的轉錄表型定義群體組成,這進一步證明人類臍帶血的祖細胞室具有高度的異質性。此外,該研究分析表明當前使用的細胞表面標記物不能很好地預測人類胚胎造血祖細胞的轉錄狀態。 FMT處理可以改善SCI小鼠的體重增加和代謝狀況。課題中期報告
大部分circSDHC定位于細胞質.醫學課題標書
在Jurkat和小鼠T細胞中檢測到多個肽上特異性磷酸化位點的***缺失,包括典型的CDK4/6靶標RB和RBL 1/2 (Fig. 3D-F)。值得注意的是,RB在兩種細胞蛋白組學中重疊,并且是全基因組CRISPR/Cas9篩選*****的(Fig. 3B,3G),表明CDK4/6i介導的記憶形成是由RB介導。因此,靶向敲除RB1,可以消除CD62L的表達上調(Fig. 3H)。3’RNA-seq分析顯示RB缺失廢除了轉錄對CDK4/6i的響應,包括SELL,其被CDK4/6i誘導的轉錄改變被RB缺失所大幅度減弱了(Fig. 3I)。與此一致,靶向敲除RB1也廢除了***的初級小鼠CD8+T細胞的Tcm形成(Fig. 3J)。醫學課題標書
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4.二代測序:轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片:信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗:DNA甲基化實驗(BSP,MSP,焦磷酸測序),RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR(mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA),WB,RNA功能驗證實驗(靶基因驗證,過表達,干擾),基因突變及SNP檢測,FISH,RNA-PULLdown,rip,chip實驗以及細胞增殖,凋亡,流式等細胞功能學實驗