再次從老年和年輕小鼠中分離BMSCs，Dil染色劑標記后體外增殖，脛骨內注射到另一批年輕小鼠中，三天后收獲脛骨對成骨標志物Runx2進行熒光免疫染色。發現老年BMSCs處理的小鼠中Dil標記細胞降低，表明老化過程中OPCs向骨形成表面的遷移能力降低。大部分遷移到骨形成表面的Dil標記細胞表達Runx2，表明OPCs遷移到骨形成表面發生成骨分化，有助于體內骨形成。與年輕BMSCs相比，老年BMSCs的體外遷移能力明顯受損，Macf1***下調，從Macf1基因位點轉錄而來的長鏈非編碼RNA PMIF（即lnc-PMIF）表達***增高。上述提示，衰老過程中小鼠骨形成的減少伴隨著OPCs向骨形成表面遷移的減少和OPCs中lnc-PMIF表達的升高。阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配。醫學基礎實驗課題產學研合作
我們檢測到LPS處理的野生型小鼠原代肝細胞中Gsdmd-N明顯增加。相比之下，LPS處理不影響Caspase-11缺陷小鼠原代肝細胞的Gsdmd-N水平，且Gsdmd-N水平***低于野生型小鼠原代肝細胞。此外，LPS誘導野生型原代肝細胞中IL-1β(圖6E)、ALT(圖6F)和AST(圖6G)的表達。相反，在Caspase11缺陷的原發性肝細胞中，LPS誘導的IL-1β(圖6E)、ALT(圖6F)和AST(圖6G)的產生***減少。綜上所述，Caspase-11的缺失抑制了LPS誘導的Caspase-11和GSDMD的體外***。模型建造高通量測序的后續成文服務。
四、HSCT前通過腸道微生物組成預測急性GvHD 嚴重性
基于機器學習，hsct前腸道微生物群組成預測aGvHD嚴重程度。A.在0級aGvHD患者中，12個**豐富的家族隨著時間的推移在腸道中的相對豐度。B.svmLinear模型識別出的前20個預測腸道ASV的重要性圖，其重要性得分表明，如果將各自的ASV排除在模型之外，預測精度會平均下降。**終的交叉驗證svmLinear模型從腸ASVspreHSCT的豐度中預測了aGvHD(0IvsIIIV)，準確率為86%(95%CI:65-97%)。通過Boruta特征選擇確認的asv用星號表示。
進一步使用E8聚類分析顯示，這些暴露于慢性d-flow的ec向免疫細胞樣類型(EndICLT)轉變，但沒有達到完全分化的免疫細胞狀態(圖3C和S3)。圖3D顯示了EC簇中EndMT、Tagln、Acta2、Cnn1和Snai1的四個標記物，分別**了s流(E2)、急性d流(E6)和慢性d流(E8)染色質可及性的變化。與s-流(E2)和急性d-流(E6)相比，慢性d-流在E8的啟動子區域(箭頭)增加了這些基因的可及性。從scRNA-seq數據的小提琴圖中可以看出，E8中相應基因的表達量增加，進一步證實了這一結果(圖3E)。阻斷atm依賴的磷酸化會損害DNA損傷后PTEN的亞細胞再分配
藥物篩選確定**類腸道中HIF-2α的合成易損性
作者構建Apc缺失型（Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/fl）和CRCHIF-2α過表達小鼠模型（Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL），從這2個小鼠模型中分離腸類藥物，并用化療藥物培養，生長被監測了5天。在Cdx2-ERT2Cre;在Apcfl/flHIF-2αLSL/LSL小鼠中，他莫昔芬可誘導HIF-2α，并特異性地破壞結腸上皮細胞中的Apc。來自Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/fl**腸系膜的小鼠對doxorubicin,mitoxantrone,irinotecan,以及eribulin等藥物高度敏感，與來自Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF2αLSL/LSL的不同。RSL3、sorafenib索拉菲尼、erastin和DMF被認為是***的小分子，可以***降低Cdx2-ERT2Cre；Apcfl/flHIF2αLSL/LSL**腸道類物質的生長。Erastin和RSL3是經典的ferroptosis***劑，分別抑制xCT(由Slc7a11基因編碼，是xC系統的一個組成部分)和GPX4。DMF一種細胞可滲透的線粒體衍生物，在一些**細胞系中具有細胞毒性這些結果表明，HIF-2α表達的**可以被氧化應激***劑選擇性靶向。 ***ATM對PTEN的磷酸化增加了DNA損傷后AKT和p27Kip1的***。武漢課題課題設計
高通量測序后續的機制實驗。醫學基礎實驗課題產學研合作
特殊的Sno-lncRNA
在2012年由上海生化所陳玲玲課題組率先鑒定出來,Sno-lncRNA是一類新型的長非編碼RNA，它們的序列中包含完整的snoRNA序列，并且該序列對sno-lncRNA的穩定性和亞細胞定位至關重要,研究表明sno-lncRNA長非編碼RNASLERT通過松弛DDX21的環形結構，從而促進PolI轉錄rRNA的重要作用[14]。
snoRNAs與**發***展
snoRNAs參與的**的分子病理學，在早年的研究中在非小細胞肺*中多種snoRNAs呈現出不同的表達狀態[15]。snoRNAsU502bp純合缺失突變與前列腺*的發***展有關[16]并且在乳腺*中U50具有雜合缺失以及轉錄下調的特點[11]。通過基因組芯片技術檢測到SNORD33,SNORD66,SNORD73B,SNORD76,SNORD78,andSNORA42六種snoRNAs在非小細胞肺*(NSCLC)是表達上調的他們通常位于肺*的頻繁擴增的基因組區域[17]。snoRNAs與**的關系也能夠延伸到與它們相互作用的蛋白分子上。Fibrillarin是發育必須的，缺失Fibrillarin能夠導致胚胎致死。在乳腺*的研究中當高水平的Fibrillarin干擾應激***p53，snoRNA通路被抑制時，**抑制因子p53可以作為snoRNP擾動的前哨，***其介導生長抑制作用[18]。Dyskerin、NOP10以及Nhp2p的突變與上皮*有關[19]。 醫學基礎實驗課題產學研合作
公司特色是以各式高通量二代測序為基礎，利用生物數據信息分析手段，通過英拜生物自有的分子、病理以及細胞實驗平臺，提供課題整體設計外包、撰寫SCI論文一站式服務。公司實驗平臺落座在漕河涇開發區浦江園區，實驗平臺開放參觀，客戶可隨時參觀實驗并參與實驗課題的進度，保證您的實驗是在您的指導下完成。
1.整體課題外包服務：RNA甲基化研究專題，外泌體研究專題，wnt/VEGF/toll等經典通路研究，設計的課題均具有后續實驗課題的延展性，為您的標書奠定較好的基礎
2.標書申請：提供標書課題設計、撰寫，標書部分基礎實驗的開展，設計的標書均符合科研前沿熱點，中標率很高。
3.提供熱點**文獻技術支持，探討科研前沿熱點研究：trfRNA，DNA/RNA甲基化，外泌體，自噬，WNT等相關研究
4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗