circNDUFB2觸發NSCLC細胞的免疫防御反應
為了研究參與circNDUFB2的信號通路，使用RNA測序（RNA-seq）進行了轉錄組分析。結果表明circNDUFB2過表達影響934個基因的表達水平，其中743個基因上調，191個基因被下調。基因本體生物學過程（GO_BP）和KEGG途徑富集分析表明circNDUFB2觸發了免疫防御和I型干擾素（IFNs）信號傳導。基因集富集分析（GSEA）也表明目標基因的信號傳導途徑參與了免疫反應。確認了在circNDUFB2過表達的NSCLC細胞中一組免疫基因表達被上調，而circNDUFB2敲低降低了NSCLC細胞中這些基因的水平。這些結果表明，過量表達circNDUFB2，而不是其具有相同序列的線性RN**段，導致免疫基因上調。 酶聯免疫吸附試驗（ELISA）證實circNDUFB2過表達顯著增加了細胞培養上清液中CXCL10，CXCL11，CCL5和IFNβ的水平，而circNDUFB2敲低降低了細胞培養上清液中這些細胞因子的水平。這些結果證明circNDUFB2在NSCLC細胞中引發免疫應答。 英拜提供可靠的技術咨詢。基礎醫學科研創新服務
7）NOX4通過氧化應激誘導的人體星形膠質細胞的脂質過氧化促進鐵死亡
為了探討NOX4調控AD星形膠質細胞氧化應激誘導的細胞死亡的分子機制，我們檢測NOX4的升高是否能通過氧化應激誘導的人星形膠質細胞脂質過氧化促進鐵死亡。我們用免疫熒光染色法測定了4-HNE在人星形膠質細胞中的蛋白水平。免疫熒光染色顯示，與對照組相比，NOX4的升高增加了4-HNE蛋白的水平，增加了質膜中脂質過氧化源性液滴的含量，細胞的形狀出現收縮(圖7A)。NOX4過表達使4-HNE陽性細胞數量***增加(圖7B)。NOX4過表達增加了4-HNE水平和MDA水平(圖7C)。值得注意的是，與對照組相比，NOX4的升高增加了鐵的積累，這是鐵死亡的特異性標志(圖7D)。 cancer科研服務兩年m6A表達水平較高的**患者淋巴轉移***增加。
三、pten-s38a突變誘導細胞凋亡抵抗
為了進一步了解阻斷atm依賴的PTEN磷酸化如何影響細胞對基因毒性損傷的反應，我們使用抗體陣列評估了表達PTEN-wt或PTEN-398a的MCF10A細胞裂解液的應激反應和凋亡通路的活性。Pten+/+和Pten398A/398AMEF培養，表達Pten-wt的MCF10A細胞與表達Pten-398A的MCF10A細胞在正常培養條件下的生長速率均無差異(圖3A和補充圖5C)。對細胞進行不同的基因毒性脅迫處理:IR、順鉑和柔紅霉素。在所有條件下，Pten398A/398AMEFs和PTEN-398A表達的MCF10A細胞對基因毒性脅迫的抗性均高于野生型PTEN的細胞(圖3BD和SupplementaryFig.5D,E)。通過流式細胞儀AnnexinV染色判斷(圖3E)。通過使用caspase-3抗體對Pten+/+、MMTVneu和Pten398A/398A、MMTVneu**進行免疫組化染色，證實了這些觀察結果。
1、在響應CDK4/6抑制中瘤內記憶類CD8+T細胞的表現
為了***評價CDK4/6抑制對抗**T細胞免疫的影響，使用多模式單細胞測序(CITE-seq)分析了CDK4/6抑制劑palbociclib或對照處理的MC38-OVA**小鼠的瘤內T細胞群體(Fig.1A)。維度分析顯示MC38-OVA**中有10個不同的T細胞群(Fig.1B)。用CDK4/6i處理的**有較低頻率的CD4+調節性T細胞(Foxp3+Tregs)，而CD8+記憶類T細胞頻率更高，以Tcf7、Sell、Bcl2和Cd7高表達為特征(Fig.1B-D)。CD8+T細胞池的基因動態表達揭示來源于CDK4/6i處理的小鼠的CD8+**免疫浸潤（TILs）向更早、更像干細胞的分化狀態傾斜(Fig.1E-F)。與此一致，較早出現假時間軌跡的細胞表達更高水平的記憶相關基因(Tcf7,Sell,Il7r)，和更低水平的效應相關基因(Prf1,Gzmb)和耗損標志物(PD-1,TIM3)(Fig.1G)。 我們在人類胰腺*細胞系中過表達或敲除METTL14。
HOXBLINC的缺失擾亂了NPM1c+介導的轉錄程序和白血病發生
隨后鑒定了NPM1c+AML和NPM1cWTAML病人中的差異表達基因，與WT相比，有871個下調基因和980個上調基因，包括HoxBlinc和NPM1c+的特征基因HoxB2-5，HoxA7,9-11，Meis1，Runx1（圖1c）。然后，通過RNA-seq分析比較了對照組和HOXBLINCi細胞的全基因組轉錄組變化。一致地，NPM1c+細胞表現出HOXBLINClncRNA和常見的NPM1c+AML標記基因的高表達(圖1d)。有趣的是，在OCI-AML3細胞中抑制HOXBLINC***抑制了許多NPM1c+標志性基因的轉錄，如HOXB2-5、HOXA9-11、RUNX1和MEIS1(圖1d)。 英拜提供生命科學內的一體化服務。新疆科研技術指導
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脂質氧化先于胞質Ca2+的增加和質膜的破壞
體積細胞實驗中Ferroptosis特征之間的詳細時間關系被***后群體細胞發生Ferroptosis的異質性所掩蓋。為了解決這個問題，作者使用活細胞共聚焦顯微鏡在單細胞水平上量化了Fluo-4AM信號、細胞圓度和PI攝入量的增加。從單個細胞獲得的動力學曲線(圖2C,F,K)中，計算出每個ferroptotic表型(t50)實現50%變化所需的時間，這使得可以設置Ferroptosis各過程之間的滯后時間(圖2D,G,L)。結果發現，與所使用的Ferroptosis觸發器無關，胞漿Ca2+的增加先于細胞圓縮和質膜完全坍塌(圖2A,B)。從流式細胞術實驗(圖1G)可以看出，Erastin-1存在時，胞質Ca2+的增加是一個雙相行為的兩步過程(圖2C)。***個事件在比較大Ca2+信號的40%左右達到飽和，與不相關的鈣(Ca2+un)增加相對應，因為它沒有受到Ferroptosis的抑制(圖1G)。 基礎醫學科研創新服務
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4.二代測序：轉錄組測序、smallRNA測序、snoRNA測序、TRF測序
5.芯片：信號通路pcr芯片蛋白芯片
6.表觀遺傳實驗：DNA甲基化實驗（BSP,MSP，焦磷酸測序），RNA甲基化實驗
7.實時定量PCR（mRNA,LncRNA,microRNA,circRNA）,WB，RNA功能驗證實驗(靶基因驗證，過表達，干擾),基因突變及SNP檢測，FISH，RNA-PULLdown，rip，chip實驗以及細胞增殖，凋亡，流式等細胞功能學實驗